当前蛋白身份:P05205 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1KNA Chromo domain of HP1 complexed with histone H3 tail containing dimethyllysine 9. 提交 2001-12-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 17–76(60 aa) 片段:Residues 23-76
突变:K38M 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;283 K;Ammonium Sulfate, MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 283.0K
分辨率 2.10 Å R-free 0.259
1KNE Chromo domain of HP1 complexed with histone H3 tail containing trimethyllysine 9 提交 2001-12-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 17–76(60 aa) 片段:Residues 17-76
突变:K38M 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.1;283 K;Ammonium Sulfate, MES, pH 6.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 283K
分辨率 2.40 Å R-free 0.267
1Q3L Chromodomain Of HP1 Complexed With Histone H3 Tail Containing monomethyllysine 9. 提交 2003-07-30 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 17–76(60 aa) 片段:sequence database residues 17-76
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.1;283 K;Ammonium Sulfate, MES, pH 6.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 283K
分辨率 1.64 Å R-free 0.241
3P7J Drosophila HP1a chromo shadow domain 提交 2010-10-12 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 131–206(76 aa) 片段:UNP residues 131-206
链 B 131–206(76 aa) 片段:UNP residues 131-206
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;12% PEG400, 0.1 M HEPES. Cryoprotected in 12% PEG400, 0.1 M HEPES, 33% glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.30 Å R-free 0.246
3P7J Drosophila HP1a chromo shadow domain 提交 2010-10-12 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 131–206(76 aa) 片段:UNP residues 131-206
链 B 131–206(76 aa) 片段:UNP residues 131-206
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;12% PEG400, 0.1 M HEPES. Cryoprotected in 12% PEG400, 0.1 M HEPES, 33% glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.30 Å R-free 0.246
6ASZ Chromodomain HP1 with Y24F mutation bound to histone H3 peptide containing trimethyl lysine 提交 2017-08-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 17–76(60 aa) 片段:Chromo 1 domain, residues 17-76
突变:Y24F , K38M 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 6.3;277 K;0.1 M MES, 3.4 M (NH4)2SO4
分辨率 1.52 Å R-free 0.274
6AT0 Chromodomain HP1 with a p-nitro-L-phenylalanine mutation at position 24 bound to histone H3 peptide containing trimethyl lysine 提交 2017-08-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 17–76(60 aa) 片段:Chromo 1 domain, residues 17-76
突变:K38M 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.8;277 K;0.1M MES, 3.0M (NH4)2SO4
分辨率 1.28 Å R-free 0.260
6MHA dHP1 Chromodomain Y24W variant bound to histone H3 peptide containing trimethyllysine 提交 2018-09-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 22–74(53 aa)
突变:Y24W, K38M 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;3.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M MES
分辨率 1.50 Å R-free 0.219