当前蛋白身份：P05231
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1ALU HUMAN INTERLEUKIN-6 提交 1997-06-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
28–212（185 aa）
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 8 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.3；PROTEIN AT 15 MG/ML WAS CRYSTALLIZED FROM 1.8M AMMONIUM SULFATE, 300 MM SODIUM POTASSIUM TARTRATE, IN 100MM PH 6.3 SODIUM CITRATE BUFFER.
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分辨率 1.90 Å R-free 0.277 |
| 1ALU HUMAN INTERLEUKIN-6 提交 1997-06-03 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
28–212（185 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 8 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.3；PROTEIN AT 15 MG/ML WAS CRYSTALLIZED FROM 1.8M AMMONIUM SULFATE, 300 MM SODIUM POTASSIUM TARTRATE, IN 100MM PH 6.3 SODIUM CITRATE BUFFER.
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.277 |
| 1IL6 HUMAN INTERLEUKIN-6, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1997-01-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
28–212（185 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.1；298 K
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分辨率未提供 |
| 1P9M Crystal structure of the hexameric human IL-6/IL-6 alpha receptor/gp130 complex 提交 2003-05-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
29–212（184 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；Sodium formate, Sodium acetate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 3.65 Å R-free 0.334 |
| 2IL6 HUMAN INTERLEUKIN-6, NMR, 32 STRUCTURES 提交 1997-01-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
28–212（185 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.1；298 K
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分辨率未提供 |
| 4CNI Crystal structure of the Fab portion of Olokizumab in complex with IL- 6 提交 2014-01-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
42–212（171 aa）
片段：RESIDUES 41-212
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未记录 | TAM TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å R-free 0.215 |
| 4CNI Crystal structure of the Fab portion of Olokizumab in complex with IL- 6 提交 2014-01-22 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
42–212（171 aa）
片段：RESIDUES 41-212
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未记录 | TAM TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å R-free 0.215 |
| 4J4L Modular evolution and design of the protein binding interface 提交 2013-02-07 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
47–212（166 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8；290 K；0.1M magnesium formate, 15-18% w/v polyethylene glycol 3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 290K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.268 |
| 4J4L Modular evolution and design of the protein binding interface 提交 2013-02-07 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
47–212（166 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8；290 K；0.1M magnesium formate, 15-18% w/v polyethylene glycol 3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 290K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.268 |
| 4NI7 Crystal structure of human interleukin 6 in complex with a modified nucleotide aptamer (SOMAMER SL1025) 提交 2013-11-05 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
28–212（185 aa）
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未记录 | NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；289 K；31% PEG 3350, 180 mM LiNO3, 100 mM Sodium Acetate (pH 5.5), 2.5% Hexamine Cobalt Chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 289K
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分辨率 2.40 Å R-free 0.260 |
| 4NI9 Crystal structure of human interleukin 6 in complex with a modified nucleotide aptamer (SOMAMER SL1025), FORM 2 提交 2013-11-05 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
28–212（185 aa）
链 C
28–212（185 aa）
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未记录 | NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；289 K；31% PEG 3350, 90 mM Magnesium Sulfate, 90 mM Sodium Acetate (pH 5.5) 100 mM LiCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 289K
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分辨率 2.55 Å R-free 0.239 |
| 4O9H Structure of Interleukin-6 in complex with a Camelid Fab fragment 提交 2014-01-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
28–212（185 aa）
片段：UNP residues 28-212
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.5；277 K；2M Ammonium sulfate, 0.15M Na citrate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.42 Å R-free 0.244 |
| 4ZS7 Structural mimicry of receptor interaction by antagonistic IL-6 antibodies 提交 2015-05-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
42–212（171 aa）
片段：residues 14-184
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；25% PEG 4K, 0.15 M (NH4)2SO4, 0.1 M MES pH 5.5.
Took 9 month
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分辨率 2.93 Å R-free 0.293 |
| 5FUC Biophysical and cellular characterisation of a junctional epitope antibody that locks IL-6 and gp80 together in a stable complex: implications for new therapeutic strategies 提交 2016-01-25 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
49–212（164 aa）
片段：RESIDUES 49-212
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
0.1 M MES, PH 6.5, 14% PEG20K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.287 |
| 5FUC Biophysical and cellular characterisation of a junctional epitope antibody that locks IL-6 and gp80 together in a stable complex: implications for new therapeutic strategies 提交 2016-01-25 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
49–212（164 aa）
片段：RESIDUES 49-212
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
0.1 M MES, PH 6.5, 14% PEG20K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.287 |
| 7NXZ Synthetic glycoform of Human Interleukin 6 提交 2021-03-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 AAA
30–212（183 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2-0.25 M sodium malonate, pH 7.0 and 18-22% (w/v) PEG 3350
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分辨率 2.00 Å R-free 0.253 |
| 8D82 Cryo-EM structure of human IL-6 signaling complex in detergent: model containing full extracellular domains 提交 2022-06-07 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 D
30–212（183 aa）
链 H
30–212（183 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 18 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.22 Å |
| 8QY5 Structure of interleukin 6. 提交 2023-10-25 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
1–212（212 aa）
链 E
1–212（212 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8QY6 Structure of interleukin 6 (gp130 P496L mutant). 提交 2023-10-25 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
1–212（212 aa）
链 E
1–212（212 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.16 Å |
| 8YWQ Crystal structure of the Fab fragment of the anti-IL-6 antibody I9H in complex with a domain-swapped IL-6 dimer 提交 2024-03-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
28–212（185 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 10.5；293 K；40% v/v 2-methyl-2,4-pentanediol, 100 mM CAPS
(seed stock crystallization conditions: 14-16% PEG 8000, 100 mM magnesium acetate, 100 mM MES pH 6.5)
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分辨率 2.51 Å R-free 0.277 |
| 8YWR Crystal structure of the Fab fragment of the anti-IL-6 antibody 68F2 in complex with a domain-swapped IL-6 dimer 提交 2024-03-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
42–212（171 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；25% PEG 4K, 0.15 M (NH4)2SO4, 0.1 M MES
|
分辨率 2.93 Å R-free 0.256 |