当前蛋白身份：P06126
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1ONQ Crystal Structure of CD1a in Complex with a Sulfatide 提交 2003-02-28 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
18–294（277 aa）
|
未记录 | FUC alpha-L-fucopyranose × 1 SLF SULFATE-3-D-GALACTOSYL-BETA-1-1-N-STEAROYL-D-SPHINGOSINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；277 K；MPEG 2000, Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.0K, pH 8.50
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.276 |
| 1ONQ Crystal Structure of CD1a in Complex with a Sulfatide 提交 2003-02-28 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
18–294（277 aa）
|
未记录 | FUC alpha-L-fucopyranose × 1 SLF SULFATE-3-D-GALACTOSYL-BETA-1-1-N-STEAROYL-D-SPHINGOSINE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；277 K；MPEG 2000, Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.0K, pH 8.50
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.276 |
| 1XZ0 Crystal structure of CD1a in complex with a synthetic mycobactin lipopeptide 提交 2004-11-11 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
18–294（277 aa）
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未记录 | JH0 6-(HYDROXY-HEXADECANOYL-AMINO)-2-{[(4S)-2-(2-HYDROXY-PHENYL)-4,5-DIHYDRO-OXAZOLE-4-CARBONYL]-AMINO}-HEXANOIC ACID 2-[(3S)-1-(TERT-BUTYL-DIPHENYL-SILANYLOXY)-2-OXO-AZEPAN-3-YLCARBAMOYL]-(1S)-1-METHYL-ETHYL ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG 2000 MME, Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.277 |
| 1XZ0 Crystal structure of CD1a in complex with a synthetic mycobactin lipopeptide 提交 2004-11-11 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
18–294（277 aa）
|
未记录 | JH0 6-(HYDROXY-HEXADECANOYL-AMINO)-2-{[(4S)-2-(2-HYDROXY-PHENYL)-4,5-DIHYDRO-OXAZOLE-4-CARBONYL]-AMINO}-HEXANOIC ACID 2-[(3S)-1-(TERT-BUTYL-DIPHENYL-SILANYLOXY)-2-OXO-AZEPAN-3-YLCARBAMOYL]-(1S)-1-METHYL-ETHYL ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG 2000 MME, Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.277 |
| 4X6C CD1a ternary complex with lysophosphatidylcholine and BK6 TCR 提交 2014-12-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
21–295（275 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 42H (4R,7R,18Z)-4,7-dihydroxy-N,N,N-trimethyl-10-oxo-3,5,9-trioxa-4-phosphaheptacos-18-en-1-aminium 4-oxide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；sodium citrate, bis-tris propane, PEG 3350
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.236 |
| 4X6C CD1a ternary complex with lysophosphatidylcholine and BK6 TCR 提交 2014-12-08 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
21–295（275 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 42H (4R,7R,18Z)-4,7-dihydroxy-N,N,N-trimethyl-10-oxo-3,5,9-trioxa-4-phosphaheptacos-18-en-1-aminium 4-oxide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；sodium citrate, bis-tris propane, PEG 3350
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.236 |
| 4X6D CD1a ternary complex with endogenous lipids and BK6 TCR 提交 2014-12-08 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
21–295（275 aa）
|
未记录 | OLA OLEIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；sodium citrate, bis-tris propane, PEG 3350
|
分辨率 2.98 Å R-free 0.229 |
| 4X6D CD1a ternary complex with endogenous lipids and BK6 TCR 提交 2014-12-08 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
21–295（275 aa）
|
未记录 | PAM PALMITOLEIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；sodium citrate, bis-tris propane, PEG 3350
|
分辨率 2.98 Å R-free 0.229 |
| 4X6E CD1a binary complex with lysophosphatidylcholine 提交 2014-12-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
21–295（275 aa）
|
未记录 | MLT D-MALATE × 1 42H (4R,7R,18Z)-4,7-dihydroxy-N,N,N-trimethyl-10-oxo-3,5,9-trioxa-4-phosphaheptacos-18-en-1-aminium 4-oxide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20 mM DL-malic acid, 40 mM MES, 40 mM tris, PEG 1500
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.234 |
| 4X6F CD1a binary complex with sphingomyelin 提交 2014-12-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
21–295（275 aa）
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未记录 | 3XU (4S,7S,23Z)-4-hydroxy-7-[(1S,2Z)-1-hydroxyhexadec-2-en-1-yl]-N,N,N-trimethyl-9-oxo-3,5-dioxa-8-aza-4-phosphadotriacont- 23-en-1-aminium 4-oxide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20 mM DL-malic acid, 40 mM MES, 40 mM tris, PEG 1500
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.224 |
| 5J1A Antigen presenting molecule 提交 2016-03-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–295（295 aa）
|
突变：T30I, C51W | 6F8 3-[(8Z,11Z)-pentadeca-8,11-dien-1-yl]benzene-1,2-diol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20-25% PEG 1500 / 10% MMT buffer pH 5-6
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.217 |
| 7KOZ CD1a-36:2 SM binary complex 提交 2020-11-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
18–295（278 aa）
|
未记录 | WU7 (4S,7S,17Z)-4-hydroxy-7-[(1S,2E)-1-hydroxyhexadec-2-en-1-yl]-N,N,N-trimethyl-4,9-dioxo-3,5-dioxa-8-aza-4lambda~5~-phosphahexacos-17-en-1-aminium × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20-25% PEG 1500, 0.1M MMT pH 5.5
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.246 |
| 7KP0 CD1a-42:1 SM binary complex 提交 2020-11-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
18–295（278 aa）
|
未记录 | WUA (4R,7S)-4-hydroxy-7-[(1S,2E)-1-hydroxyhexadec-2-en-1-yl]-N,N,N-trimethyl-4,9-dioxo-3,5-dioxa-8-aza-4lambda~5~-phosphadotriacontan-1-aminium × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20-25% PEG 1500, 0.1M MMT pH 5.5
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.264 |
| 7KP1 CD1a-42:2 SM binary complex 提交 2020-11-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
18–295（278 aa）
|
未记录 | FO4 sphingomyelin × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20-25% PEG 1500, 0.1M MMT pH 5.5
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.226 |
| 7RYM CD1a-endo-gdTCR complex 提交 2021-08-25 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
18–295（278 aa）
|
未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG3350,
0.2M Ammonium Sulfate
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.286 |
| 7RYN CD1a-sulfatide-gdTCR complex 提交 2021-08-25 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
18–295（278 aa）
|
未记录 | CIS (15Z)-N-((1S,2R,3E)-2-HYDROXY-1-{[(3-O-SULFO-BETA-D-GALACTOPYRANOSYL)OXY]METHYL}HEPTADEC-3-ENYL)TETRACOS-15-ENAMIDE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；15% PEG 4000,
0.15M Ammonium Sulfate,
0.1M MES pH6
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.268 |
| 7RYO CD1a-dideoxymycobactin-gdTCR complex 提交 2021-08-25 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
18–295（278 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 WGR dideoxymycobactin-838 × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% PEG 3350,
0.2M Ammonium sulfate
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.267 |
| 7SH4 CD1a-phosphatidylglycerol binary structure 提交 2021-10-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
18–295（278 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 MW9 (21R,24R,27S)-24,27,28-trihydroxy-18,24-dioxo-19,23,25-trioxa-24lambda~5~-phosphaoctacosan-21-yl (9Z)-octadec-9-enoate × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；20-25% PEG 1500, 0.1M MMT pH 5.5
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分辨率 2.00 Å R-free 0.230 |
| 9OHZ Crystal structure of CD1a presenting ganglioside GD3 提交 2025-05-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
20–295（276 aa）
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突变：C68W | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 A1CB9 N-{(2S,3R)-1-[(4-O-beta-D-galactopyranosyl-beta-D-glucopyranosyl)oxy]-3-hydroxyoctadecan-2-yl}tetracosanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；21% PEG 1500, 0.1M MMT pH 5.5
|
分辨率 2.14 Å R-free 0.247 |