当前蛋白身份：P06400
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1AD6 DOMAIN A OF HUMAN RETINOBLASTOMA TUMOR SUPPRESSOR 提交 1997-02-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
378–562（185 aa）
片段：DOMAIN A
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；pH 6.0
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.240 |
| 1GH6 RETINOBLASTOMA POCKET COMPLEXED WITH SV40 LARGE T ANTIGEN 提交 2000-11-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
379–577（199 aa）
片段：UNP residues 379-577 and 645-772
链 B
645–772（128 aa）
片段：UNP residues 379-577 and 645-772
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.2；pH 7.2
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.314 |
| 1GUX RB POCKET BOUND TO E7 LXCXE MOTIF 提交 1997-11-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
372–589（218 aa）
片段：POCKET DOMAIN
链 B
636–787（152 aa）
片段：POCKET DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；3.5 M SODIUM FORMATE, 0.1M NA HEPES PH 7.5, 20 MIROMOLAR CDCL2
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.289 |
| 1H25 CDK2/Cyclin A in complex with an 11-residue recruitment peptide from retinoblastoma-associated protein 提交 2002-07-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
868–878（11 aa）
片段：RESIDUES 869-878
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；0.8M KCL, 1.2M (NH4)2SO4, 40MM HEPES PH 7.0. PROTEIN CONCENTRATION = 10MG/ML
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.266 |
| 1O9K Crystal structure of the retinoblastoma tumour suppressor protein bound to E2F peptide 提交 2002-12-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
372–589（218 aa）
片段：DOMAIN A, RESIDUES 372-589
链 B
636–787（152 aa）
片段：DOMAIN B, RESIDUES 636-787
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.8；pH 7.80
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.285 |
| 1O9K Crystal structure of the retinoblastoma tumour suppressor protein bound to E2F peptide 提交 2002-12-16 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
372–589（218 aa）
片段：DOMAIN A, RESIDUES 372-589
链 D
636–787（152 aa）
片段：DOMAIN B, RESIDUES 636-787
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.8；pH 7.80
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.285 |
| 1O9K Crystal structure of the retinoblastoma tumour suppressor protein bound to E2F peptide 提交 2002-12-16 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
372–589（218 aa）
片段：DOMAIN A, RESIDUES 372-589
链 F
636–787（152 aa）
片段：DOMAIN B, RESIDUES 636-787
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.8；pH 7.80
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.285 |
| 1O9K Crystal structure of the retinoblastoma tumour suppressor protein bound to E2F peptide 提交 2002-12-16 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 G
372–589（218 aa）
片段：DOMAIN A, RESIDUES 372-589
链 H
636–787（152 aa）
片段：DOMAIN B, RESIDUES 636-787
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.8；pH 7.80
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.285 |
| 1PJM Mouse Importin alpha-bipartite NLS from human retinoblastoma protein Complex 提交 2003-06-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
857–876（20 aa）
片段：NLS (nuclear localization signal) bipartite peptide
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；Sodium Citrate, DTT, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.239 |
| 2AZE Structure of the Rb C-terminal domain bound to an E2F1-DP1 heterodimer 提交 2005-09-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
829–874（46 aa）
片段：C-terminal core domain (residues 829-874)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；Sodium Citrate, Ammonium Sulfate, PEG 400, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.262 |
| 2AZE Structure of the Rb C-terminal domain bound to an E2F1-DP1 heterodimer 提交 2005-09-10 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 C
829–874（46 aa）
片段：C-terminal core domain (residues 829-874)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；Sodium Citrate, Ammonium Sulfate, PEG 400, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.262 |
| 2QDJ Crystal structure of the Retinoblastoma protein N-domain provides insight into tumor suppression, ligand interaction and holoprotein architecture 提交 2007-06-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
52–355（304 aa）
片段：N-terminal domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.2 M Na acetate, 25% (w/v) PEG 4000, 0.1 M Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.276 |
| 2R7G Structure of the retinoblastoma protein pocket domain in complex with adenovirus E1A CR1 domain 提交 2007-09-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
380–581（202 aa）
片段：Pocket domain, deletion of residues 582-642
链 A
643–787（145 aa）
片段：Pocket domain, deletion of residues 582-642
链 C
380–581（202 aa）
片段：Pocket domain, deletion of residues 582-642
链 C
643–787（145 aa）
片段：Pocket domain, deletion of residues 582-642
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；15mM magnesium acetate tetrahydrate, 50mM sodium cacodylate trihydrate, pH 6.0 and 1.7M ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 1.67 Å R-free 0.218 |
| 3N5U Crystal structure of an Rb C-terminal peptide bound to the catalytic subunit of PP1 提交 2010-05-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
870–882（13 aa）
片段：UNP residues 870-882
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
hanging drop；pH 7.5；298 K；100mM HEPES, 200mM MgCl2, 18% PEG 4000, pH 7.5, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.261 |
| 3N5U Crystal structure of an Rb C-terminal peptide bound to the catalytic subunit of PP1 提交 2010-05-25 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
870–882（13 aa）
片段：UNP residues 870-882
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
hanging drop；pH 7.5；298 K；100mM HEPES, 200mM MgCl2, 18% PEG 4000, pH 7.5, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.261 |
| 3POM Crystal Structure of the Unliganded Retinoblastoma Protein Pocket Domain 提交 2010-11-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
380–577（198 aa）
片段：Pocket Domain, Domain A, UNP residues 380-577, Domain B, UNP residues 643-787
链 A
643–783（141 aa）
片段：Pocket Domain, Domain A, UNP residues 380-577, Domain B, UNP residues 643-787
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 10.6；277 K；100 mM CAPS, 10% PEG 3350, pH 10.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.262 |
| 3POM Crystal Structure of the Unliganded Retinoblastoma Protein Pocket Domain 提交 2010-11-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
380–577（198 aa）
片段：Pocket Domain, Domain A, UNP residues 380-577, Domain B, UNP residues 643-787
链 B
643–783（141 aa）
片段：Pocket Domain, Domain A, UNP residues 380-577, Domain B, UNP residues 643-787
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 10.6；277 K；100 mM CAPS, 10% PEG 3350, pH 10.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.262 |
| 4ELJ Crystal structure of the inactive retinoblastoma protein phosphorylated at T373 提交 2012-04-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
53–244（192 aa）
片段：UNP residues 53-244, 268-582, 642-787
链 A
268–582（315 aa）
片段：UNP residues 53-244, 268-582, 642-787
链 A
642–787（146 aa）
片段：UNP residues 53-244, 268-582, 642-787
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277.15 K；100mM HEPES, 100mM Ammonium Fluoride, 16% PEG4K, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.15K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.266 |
| 4ELL Structure of the inactive retinoblastoma protein pocket domain 提交 2012-04-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
380–787（408 aa）
片段：POCKET DOMAIN, UNP residues 380-787
|
突变：S608E, L561F | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277.15 K；100mM sodium citrate, 1mM LiCl, 18% PEG 8K., pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.15K
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.238 |
| 4ELL Structure of the inactive retinoblastoma protein pocket domain 提交 2012-04-10 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
380–787（408 aa）
片段：POCKET DOMAIN, UNP residues 380-787
|
突变：S608E, L561F | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277.15 K；100mM sodium citrate, 1mM LiCl, 18% PEG 8K., pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.15K
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.238 |
| 9DGK The Retinoblastoma Protein with Mutation M704V 提交 2024-09-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
380–793（414 aa）
|
突变：M704V, S608E, S612A, S780A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；18% PEG 8K, 0.1M sodium citrate, 0.1M succinate pH 5.5, 1M lithium chloride
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.277 |
| 9DGK The Retinoblastoma Protein with Mutation M704V 提交 2024-09-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
380–793（414 aa）
|
突变：M704V, S608E, S612A, S780A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；18% PEG 8K, 0.1M sodium citrate, 0.1M succinate pH 5.5, 1M lithium chloride
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.277 |
| 9DHC The Retinoblastoma Protein with Mutation S751Y 提交 2024-09-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
380–793（414 aa）
|
突变：S751Y, S608E, S612A, S780A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；18% PEG 8K, 0.1M sodium citrate, 0.1M succinate pH5.5, 1M lithium chloride
|
分辨率 2.32 Å R-free 0.263 |
| 9DHC The Retinoblastoma Protein with Mutation S751Y 提交 2024-09-03 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
380–793（414 aa）
|
突变：S751Y, S608E, S612A, S780A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；18% PEG 8K, 0.1M sodium citrate, 0.1M succinate pH5.5, 1M lithium chloride
|
分辨率 2.32 Å R-free 0.263 |
| 9DHF The Retinoblastoma Protein with Mutation E554K 提交 2024-09-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
380–793（414 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；18% PEG8K, 0.1M sodium citrate, 0.1M succinate pH 5.5, 1M lithium chloride
|
分辨率 2.26 Å R-free 0.265 |
| 9DHF The Retinoblastoma Protein with Mutation E554K 提交 2024-09-03 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
380–793（414 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；18% PEG8K, 0.1M sodium citrate, 0.1M succinate pH 5.5, 1M lithium chloride
|
分辨率 2.26 Å R-free 0.265 |
| 9DHU The Retinoblastoma Protein with Mutation E533K 提交 2024-09-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
380–786（407 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277.15 K；PEG 8K (18%), 0.1M sodium citrate, 0.1M succinate pH 5.5, 1M lithium chloride
|
分辨率 2.16 Å R-free 0.263 |
| 9DHU The Retinoblastoma Protein with Mutation E533K 提交 2024-09-04 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
380–786（407 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277.15 K；PEG 8K (18%), 0.1M sodium citrate, 0.1M succinate pH 5.5, 1M lithium chloride
|
分辨率 2.16 Å R-free 0.263 |