当前蛋白身份:P06533 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1B0N SINR PROTEIN/SINI PROTEIN COMPLEX 提交 1998-11-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–111(111 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6;pH 6.00
分辨率 1.90 Å R-free 0.245
1B0N SINR PROTEIN/SINI PROTEIN COMPLEX 提交 1998-11-11 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–111(111 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6;pH 6.00
分辨率 1.90 Å R-free 0.245
1B0N SINR PROTEIN/SINI PROTEIN COMPLEX 提交 1998-11-11 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–111(111 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6;pH 6.00
分辨率 1.90 Å R-free 0.245
1B0N SINR PROTEIN/SINI PROTEIN COMPLEX 提交 1998-11-11 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–111(111 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6;pH 6.00
分辨率 1.90 Å R-free 0.245
1B0N SINR PROTEIN/SINI PROTEIN COMPLEX 提交 1998-11-11 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–111(111 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6;pH 6.00
分辨率 1.90 Å R-free 0.245
1B0N SINR PROTEIN/SINI PROTEIN COMPLEX 提交 1998-11-11 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–111(111 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6;pH 6.00
分辨率 1.90 Å R-free 0.245
2YAL SinR, Master Regulator of biofilm formation in Bacillus subtilis 提交 2011-02-23 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 75–111(37 aa) 片段:OLIGOMERISATION DOMAIN, RESIDUES 75-111
链 B 75–111(37 aa) 片段:OLIGOMERISATION DOMAIN, RESIDUES 75-111
未记录 NI NICKEL (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5;18% PEG MME2000, 0.16 M TRIS PH 8.5,0.01 M NI(II) CHLORIDE, 0.1 M MGCL2.
分辨率 2.27 Å R-free 0.435
3QQ6 The N-terminal DNA binding domain of SinR from Bacillus subtilis 提交 2011-02-15 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–69(69 aa) 片段:N-terminal domain of SinR residues 1-69
链 B 1–69(69 aa) 片段:N-terminal domain of SinR residues 1-69
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;0.1M TRIS pH 8.5, 27% PEG3350, 5% glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.256
3QQ6 The N-terminal DNA binding domain of SinR from Bacillus subtilis 提交 2011-02-15 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–69(69 aa) 片段:N-terminal domain of SinR residues 1-69
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;0.1M TRIS pH 8.5, 27% PEG3350, 5% glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.256
3QQ6 The N-terminal DNA binding domain of SinR from Bacillus subtilis 提交 2011-02-15 Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 1–69(69 aa) 片段:N-terminal domain of SinR residues 1-69
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;0.1M TRIS pH 8.5, 27% PEG3350, 5% glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.256
3ZKC Crystal structure of the master regulator for biofilm formation SinR in complex with DNA. 提交 2013-01-22 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 A 1–111(111 aa)
链 B 1–111(111 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5;0.01M ZNCL2, 0.1M SODIUM ACTEATE, PH 5.0, 20% (W/V) PEG 6000
分辨率 3.00 Å R-free 0.264
5TN0 Solution Structure of the N-terminal DNA-binding domain of the master biofilm-regulator SinR from Bacillus subtilis 提交 2016-10-13 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–69(69 aa) 片段:residues 1-69
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6;293 K;离子强度(mmCIF原始值)200;压力 1
NMR样品组成 1 mM [U-15N] SinrN, 20 mM MES, 200 mM sodium chloride, 0.02 % sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-13C; U-15N] SinrN, 20 mM MES, 200 mM sodium chloride, 0.02 % sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-13C; U-15N] SinRN, 20 mM MES, 200 mM sodium chloride, 0.02 % sodium azide, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
5TN2 Solution Structure of the C-terminal multimerization domain of the master biofilm-regulator SinR from Bacillus subtilis 提交 2016-10-13 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 69–111(43 aa) 片段:residues 69-111
链 B 69–111(43 aa) 片段:residues 69-111
链 C 69–111(43 aa) 片段:residues 69-111
链 D 69–111(43 aa) 片段:residues 69-111
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6;293 K;离子强度(mmCIF原始值)200;压力 1
NMR样品组成 1 mM [U-15N] SinRC, 20 mM MES, 200 mM sodium chloride, 0.02 % sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-13C; U-15N] SinRC, 20 mM MES, 200 mM sodium chloride, 0.02 % sodium azide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-13C; U-15N] SinRC, 20 mM MES, 200 mM sodium chloride, 0.02 % sodium azide, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供