当前蛋白身份:P07013
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1TXY E. coli PriB 提交 2004-07-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–103(103 aa)
链 B
1–103(103 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;298 K;PEG 8000, Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.285 |
| 1V1Q Crystal structure of PriB- a primosomal DNA replication protein of Escherichia coli 提交 2004-04-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–104(104 aa)
链 B
1–104(104 aa)
|
突变:YES 突变:YES | CYS CYSTEINE × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.7;pH 5.70
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分辨率 2.10 Å R-free 0.263 |
| 1WOC Crystal structure of PriB 提交 2004-08-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
1–103(103 aa)
链 B
1–103(103 aa)
链 C
1–103(103 aa)
链 D
1–103(103 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;25%(v/v) MPD, 50mM Magnesium Chloride, 100mM Tris-HCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.276 |
| 1WOC Crystal structure of PriB 提交 2004-08-13 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–103(103 aa)
链 D
1–103(103 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;25%(v/v) MPD, 50mM Magnesium Chloride, 100mM Tris-HCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.276 |
| 1WOC Crystal structure of PriB 提交 2004-08-13 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
1–103(103 aa)
链 C
1–103(103 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;25%(v/v) MPD, 50mM Magnesium Chloride, 100mM Tris-HCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.276 |
| 2CCZ Crystal structure of E. coli primosomol protein PriB bound to ssDNA 提交 2006-01-19 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致 |
链 A
1–103(103 aa)
链 B
1–103(103 aa)
|
突变:YES 突变:YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5;pH 6.50
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分辨率 2.70 Å R-free 0.284 |
| 2PNH Escherichia coli PriB E39A variant 提交 2007-04-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–104(104 aa)
链 B
1–104(104 aa)
|
突变:E39A 突变:E39A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;298 K;8% polyethylene glycol 8000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 2.25 Å R-free 0.276 |
| 8FAK DNA replication fork binding triggers structural changes in the PriA DNA helicase that regulate the PriA-PriB replication restart pathway in E. coli 提交 2022-11-28 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:hexameric(6) 与全部聚合物一致 |
链 A
1–104(104 aa)
链 B
1–104(104 aa)
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.22 Å |
| 9ZBT Visualization of PriA/PriB/DnaT complexes reveals mechanisms governing structure-specific assembly of the DNA replication restart primosome 提交 2025-11-21 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:heptameric(7) 与全部聚合物一致 |
链 A
1–104(104 aa)
链 B
1–104(104 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8;50 mM Tris-HCl, pH 8, 2 mM dithiothreitol, 5 mM ethylenediaminetetraacetic acid, 75 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.22 Å |
| 9ZBU Visualization of PriA/PriB/DnaT complexes reveals mechanisms governing structure-specific assembly of the DNA replication restart primosome 提交 2025-11-21 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:tridecameric(13) 与全部聚合物一致 |
链 A
2–100(99 aa)
链 B
2–100(99 aa)
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8;50 mM Tris-HCl, pH 8, 2 mM dithiothreitol, 5 mM ethylenediaminetetraacetic acid, 75 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |