当前蛋白身份:P07463 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1CLM STRUCTURE OF PARAMECIUM TETRAURELIA CALMODULIN AT 1.8 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1993-01-23 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–148(148 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.80 Å
1EXR THE 1.0 ANGSTROM CRYSTAL STRUCTURE OF CA+2 BOUND CALMODULIN 提交 2000-05-03 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 2–149(148 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;278 K;MPD, calcium chloride, sodium cacodylate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
分辨率 1.00 Å R-free 0.163
1N0Y Crystal Structure of Pb-bound Calmodulin 提交 2002-10-15 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–148(148 aa)
未记录 PB LEAD (II) ION × 7 CAC CACODYLATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;277 K;MPD, sodium cacodylate, sodium acetate, lead nitrate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.75 Å R-free 0.223
1N0Y Crystal Structure of Pb-bound Calmodulin 提交 2002-10-15 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 1–148(148 aa)
未记录 PB LEAD (II) ION × 7 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;277 K;MPD, sodium cacodylate, sodium acetate, lead nitrate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.75 Å R-free 0.223
1OSA CRYSTAL STRUCTURE OF RECOMBINANT PARAMECIUM TETRAURELIA CALMODULIN AT 1.68 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1993-08-11 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–148(148 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.68 Å
2KXW Structure of the C-domain Fragment of apo Calmodulin Bound to the IQ motif of Nav1.2 提交 2010-05-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 77–149(73 aa) 片段:C-domain (UNP Residues 77-149)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100;压力 ambient
NMR样品组成 1.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] C-domain of apo Calmodulin, 1.5 mM Voltage-dependent Sodium Channel v 1.2, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 1.5 mM Voltage-dependent Sodium Channel v 1.2, 1.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] C-domain of apo Calmodulin, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
2M5E Structure of the C-domain of Calcium-saturated Calmodulin bound to the IQ motif of NaV1.2 提交 2013-02-21 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 77–149(73 aa) 片段:UNP residues 77-149
未记录 CA CALCIUM ION × 2 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8;298 K;压力 ambient
NMR样品组成 1.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] C-domain of Calmodulin, 1.5 mM IQ motif peptide of NaV1.2, 3.3 mM CALCIUM ION, 10 mM [U-2H] imidazole, 100 mM potassium chloride, 0.01 % sodium azide, 50 uM [U-2H] EDTA, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 1.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] C-domain of Calmodulin, 1.5 mM IQ motif peptide of NaV1.2, 3.3 mM CALCIUM ION, 10 mM [U-2H] imidazole, 100 mM potassium chloride, 0.01 % sodium azide, 50 uM [U-2H] EDTA, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
5E1K Selenomethionine Ca2+-Calmodulin from Paramecium tetraurelia SAD data 提交 2015-09-29 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 2–149(148 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) CA CALCIUM ION × 5 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;277 K;50 mM sodium cacodylate, 50% MPD
分辨率 1.00 Å R-free 0.165
5E1N Selenomethionine Ca2+-Calmodulin from Paramecium tetraurelia qFit disorder model 提交 2015-09-29 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 2–149(148 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 CA CALCIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;277 K;50 mM sodium cacodylate, 50% MPD
分辨率 1.00 Å R-free 0.150
5E1P Ca(2+)-Calmodulin from Paramecium tetraurelia qFit disorder model 提交 2015-09-29 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 2–149(148 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 5 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;277 K;50 mM sodium cacodylate, 50% MPD
分辨率 1.01 Å R-free 0.142