当前蛋白身份：P07834
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1NEX Crystal Structure of ScSkp1-ScCdc4-CPD peptide complex 提交 2002-12-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
263–744（482 aa）
片段：residues 601-604 and 609-624 deleted
|
突变：C608L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；Ammonium Sulphate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.273 |
| 1NEX Crystal Structure of ScSkp1-ScCdc4-CPD peptide complex 提交 2002-12-12 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
263–744（482 aa）
片段：residues 601-604 and 609-624 deleted
|
突变：C608L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；Ammonium Sulphate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.273 |
| 2P63 Suprafacial orientation of the SCFCdc4 dimer accommodates multiple geometries for substrate ubiquitination 提交 2007-03-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
222–273（52 aa）
片段：D Domain
链 B
222–273（52 aa）
片段：D Domain
链 C
222–273（52 aa）
片段：D Domain
链 D
222–273（52 aa）
片段：D Domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；300 K；50%MPD, 100 mM (NH4)H2PO4 ph 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
|
分辨率 2.67 Å R-free 0.279 |
| 2P63 Suprafacial orientation of the SCFCdc4 dimer accommodates multiple geometries for substrate ubiquitination 提交 2007-03-16 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
222–273（52 aa）
片段：D Domain
链 D
222–273（52 aa）
片段：D Domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；300 K；50%MPD, 100 mM (NH4)H2PO4 ph 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
|
分辨率 2.67 Å R-free 0.279 |
| 2P63 Suprafacial orientation of the SCFCdc4 dimer accommodates multiple geometries for substrate ubiquitination 提交 2007-03-16 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
222–273（52 aa）
片段：D Domain
链 B
222–273（52 aa）
片段：D Domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；300 K；50%MPD, 100 mM (NH4)H2PO4 ph 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
|
分辨率 2.67 Å R-free 0.279 |
| 3MKS Crystal Structure of yeast Cdc4/Skp1 in complex with an allosteric inhibitor SCF-I2 提交 2010-04-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
263–744（482 aa）
片段：UNP Residues 263-744 with 602-605 and 609-624 deleted
链 D
263–744（482 aa）
片段：UNP Residues 263-744 with 602-605 and 609-624 deleted
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 11 C1C 1,1'-binaphthalene-2,2'-dicarboxylic acid × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；1.5 M Ammonium sulfate, 100mM Tris pH 8.5, 15% glycerol, 1mM SCF-I2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.266 |
| 3MKS Crystal Structure of yeast Cdc4/Skp1 in complex with an allosteric inhibitor SCF-I2 提交 2010-04-15 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
263–744（482 aa）
片段：UNP Residues 263-744 with 602-605 and 609-624 deleted
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；1.5 M Ammonium sulfate, 100mM Tris pH 8.5, 15% glycerol, 1mM SCF-I2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.266 |
| 3MKS Crystal Structure of yeast Cdc4/Skp1 in complex with an allosteric inhibitor SCF-I2 提交 2010-04-15 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
263–744（482 aa）
片段：UNP Residues 263-744 with 602-605 and 609-624 deleted
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 6 C1C 1,1'-binaphthalene-2,2'-dicarboxylic acid × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；1.5 M Ammonium sulfate, 100mM Tris pH 8.5, 15% glycerol, 1mM SCF-I2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.266 |
| 3V7D Crystal Structure of ScSkp1-ScCdc4-pSic1 peptide complex 提交 2011-12-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
263–744（482 aa）
片段：UNP residues 263-744
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突变：C608L | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；1.5 M Ammonium Sulphate, 0.1 M Hepes, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.31 Å R-free 0.221 |
| 3V7D Crystal Structure of ScSkp1-ScCdc4-pSic1 peptide complex 提交 2011-12-20 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
263–744（482 aa）
片段：UNP residues 263-744
|
突变：C608L | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；1.5 M Ammonium Sulphate, 0.1 M Hepes, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.221 |