当前蛋白身份:P08027
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1BOS SHIGA-LIKE TOXIN COMPLEXED WITH ITS RECEPTOR 提交 1998-01-13 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 A
21–89(69 aa)
片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 B
21–89(69 aa)
片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 C
21–89(69 aa)
片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 D
21–89(69 aa)
片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 E
21–89(69 aa)
片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
|
未记录 | GAL beta-D-galactopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6;pH 6.0
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.226 |
| 1BOS SHIGA-LIKE TOXIN COMPLEXED WITH ITS RECEPTOR 提交 1998-01-13 | Assembly 2 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 F
21–89(69 aa)
片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 G
21–89(69 aa)
片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 H
21–89(69 aa)
片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 I
21–89(69 aa)
片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 J
21–89(69 aa)
片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
|
未记录 | GAL beta-D-galactopyranose × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6;pH 6.0
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.226 |
| 1BOS SHIGA-LIKE TOXIN COMPLEXED WITH ITS RECEPTOR 提交 1998-01-13 | Assembly 3 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 K
21–89(69 aa)
片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 L
21–89(69 aa)
片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 M
21–89(69 aa)
片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 N
21–89(69 aa)
片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 O
21–89(69 aa)
片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
|
未记录 | GAL beta-D-galactopyranose × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6;pH 6.0
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.226 |
| 1BOS SHIGA-LIKE TOXIN COMPLEXED WITH ITS RECEPTOR 提交 1998-01-13 | Assembly 4 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 P
21–89(69 aa)
片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 Q
21–89(69 aa)
片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 R
21–89(69 aa)
片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 S
21–89(69 aa)
片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 T
21–89(69 aa)
片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
|
未记录 | GAL beta-D-galactopyranose × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6;pH 6.0
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.226 |
| 1C4Q MUTATED SHIGA-LIKE TOXIN B SUBUNIT (F30A/W34A) COMPLEXED WITH RECEPTOR GB3 ANALOGUE 提交 1999-08-31 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 A
21–89(69 aa)
片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 B
21–89(69 aa)
片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 C
21–89(69 aa)
片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 D
21–89(69 aa)
片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 E
21–89(69 aa)
片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
|
突变:F30A, W34A 突变:F30A, W34A 突变:F30A, W34A 突变:F30A, W34A 突变:F30A, W34A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5;pH 7.5
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.194 |
| 1CQF THE COMPLEX OF THE MUTATED SHIGA TOXIN B SUBUNIT AND GB3 TRISACCHARIDE 提交 1999-08-06 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 A
21–89(69 aa)
片段:SHIGA-LIKE TOXIN I BINDING DOMAIN
链 B
21–89(69 aa)
片段:SHIGA-LIKE TOXIN I BINDING DOMAIN
链 C
21–89(69 aa)
片段:SHIGA-LIKE TOXIN I BINDING DOMAIN
链 D
21–89(69 aa)
片段:SHIGA-LIKE TOXIN I BINDING DOMAIN
链 E
21–89(69 aa)
片段:SHIGA-LIKE TOXIN I BINDING DOMAIN
|
突变:G62T 突变:G62T 突变:G62T 突变:G62T 突变:G62T | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;0.2 M CaCl2, 26% PEG 400, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.200 |
| 1D1I MUTATED SHIGA-LIKE TOXIN B SUBUNIT (W34A) COMPLEXED WITH RECEPTOR GB3 ANALOGUE 提交 1999-09-17 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 A
21–89(69 aa)
片段:SHIGA TOXIN I BINDING DOMAIN
链 B
21–89(69 aa)
片段:SHIGA TOXIN I BINDING DOMAIN
链 C
21–89(69 aa)
片段:SHIGA TOXIN I BINDING DOMAIN
链 D
21–89(69 aa)
片段:SHIGA TOXIN I BINDING DOMAIN
链 E
21–89(69 aa)
片段:SHIGA TOXIN I BINDING DOMAIN
|
突变:W34A 突变:W34A 突变:W34A 突变:W34A 突变:W34A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;10% (NH4)2SO4, 5% propanol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.211 |
| 1D1K MUTATED SHIGA-LIKE TOXIN B SUBUNIT (D17E/W34A) COMPLEXED WITH RECEPTOR GB3 ANALOGUE 提交 1999-09-17 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致 |
链 A
21–89(69 aa)
片段:SHIGA TOXIN I BINDING DOMAIN
链 B
21–89(69 aa)
片段:SHIGA TOXIN I BINDING DOMAIN
链 C
21–89(69 aa)
片段:SHIGA TOXIN I BINDING DOMAIN
链 D
21–89(69 aa)
片段:SHIGA TOXIN I BINDING DOMAIN
链 E
21–89(69 aa)
片段:SHIGA TOXIN I BINDING DOMAIN
|
突变:D17E,W34A 突变:D17E,W34A 突变:D17E,W34A 突变:D17E,W34A 突变:D17E,W34A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;0.4 M K,NA TARTRATE, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.218 |