当前蛋白身份:P08027 重新检索
本组结构的主要差异维度
突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1BOS SHIGA-LIKE TOXIN COMPLEXED WITH ITS RECEPTOR 提交 1998-01-13 Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 21–89(69 aa) 片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 B 21–89(69 aa) 片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 C 21–89(69 aa) 片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 D 21–89(69 aa) 片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 E 21–89(69 aa) 片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
未记录 GAL beta-D-galactopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6;pH 6.0
分辨率 2.80 Å R-free 0.226
1BOS SHIGA-LIKE TOXIN COMPLEXED WITH ITS RECEPTOR 提交 1998-01-13 Assembly 2 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 F 21–89(69 aa) 片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 G 21–89(69 aa) 片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 H 21–89(69 aa) 片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 I 21–89(69 aa) 片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 J 21–89(69 aa) 片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
未记录 GAL beta-D-galactopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6;pH 6.0
分辨率 2.80 Å R-free 0.226
1BOS SHIGA-LIKE TOXIN COMPLEXED WITH ITS RECEPTOR 提交 1998-01-13 Assembly 3 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 K 21–89(69 aa) 片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 L 21–89(69 aa) 片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 M 21–89(69 aa) 片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 N 21–89(69 aa) 片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 O 21–89(69 aa) 片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
未记录 GAL beta-D-galactopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6;pH 6.0
分辨率 2.80 Å R-free 0.226
1BOS SHIGA-LIKE TOXIN COMPLEXED WITH ITS RECEPTOR 提交 1998-01-13 Assembly 4 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 P 21–89(69 aa) 片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 Q 21–89(69 aa) 片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 R 21–89(69 aa) 片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 S 21–89(69 aa) 片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 T 21–89(69 aa) 片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
未记录 GAL beta-D-galactopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6;pH 6.0
分辨率 2.80 Å R-free 0.226
1C4Q MUTATED SHIGA-LIKE TOXIN B SUBUNIT (F30A/W34A) COMPLEXED WITH RECEPTOR GB3 ANALOGUE 提交 1999-08-31 Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 21–89(69 aa) 片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 B 21–89(69 aa) 片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 C 21–89(69 aa) 片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 D 21–89(69 aa) 片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 E 21–89(69 aa) 片段:RECEPTOR-BINDING DOMAIN
突变:F30A, W34A 突变:F30A, W34A 突变:F30A, W34A 突变:F30A, W34A 突变:F30A, W34A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5;pH 7.5
分辨率 1.52 Å R-free 0.194
1CQF THE COMPLEX OF THE MUTATED SHIGA TOXIN B SUBUNIT AND GB3 TRISACCHARIDE 提交 1999-08-06 Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 21–89(69 aa) 片段:SHIGA-LIKE TOXIN I BINDING DOMAIN
链 B 21–89(69 aa) 片段:SHIGA-LIKE TOXIN I BINDING DOMAIN
链 C 21–89(69 aa) 片段:SHIGA-LIKE TOXIN I BINDING DOMAIN
链 D 21–89(69 aa) 片段:SHIGA-LIKE TOXIN I BINDING DOMAIN
链 E 21–89(69 aa) 片段:SHIGA-LIKE TOXIN I BINDING DOMAIN
突变:G62T 突变:G62T 突变:G62T 突变:G62T 突变:G62T 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;0.2 M CaCl2, 26% PEG 400, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.20 Å R-free 0.200
1D1I MUTATED SHIGA-LIKE TOXIN B SUBUNIT (W34A) COMPLEXED WITH RECEPTOR GB3 ANALOGUE 提交 1999-09-17 Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 21–89(69 aa) 片段:SHIGA TOXIN I BINDING DOMAIN
链 B 21–89(69 aa) 片段:SHIGA TOXIN I BINDING DOMAIN
链 C 21–89(69 aa) 片段:SHIGA TOXIN I BINDING DOMAIN
链 D 21–89(69 aa) 片段:SHIGA TOXIN I BINDING DOMAIN
链 E 21–89(69 aa) 片段:SHIGA TOXIN I BINDING DOMAIN
突变:W34A 突变:W34A 突变:W34A 突变:W34A 突变:W34A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;10% (NH4)2SO4, 5% propanol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 1.70 Å R-free 0.211
1D1K MUTATED SHIGA-LIKE TOXIN B SUBUNIT (D17E/W34A) COMPLEXED WITH RECEPTOR GB3 ANALOGUE 提交 1999-09-17 Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 21–89(69 aa) 片段:SHIGA TOXIN I BINDING DOMAIN
链 B 21–89(69 aa) 片段:SHIGA TOXIN I BINDING DOMAIN
链 C 21–89(69 aa) 片段:SHIGA TOXIN I BINDING DOMAIN
链 D 21–89(69 aa) 片段:SHIGA TOXIN I BINDING DOMAIN
链 E 21–89(69 aa) 片段:SHIGA TOXIN I BINDING DOMAIN
突变:D17E,W34A 突变:D17E,W34A 突变:D17E,W34A 突变:D17E,W34A 突变:D17E,W34A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;0.4 M K,NA TARTRATE, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.00 Å R-free 0.218