当前蛋白身份：P08189
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2JMR NMR structure of the E. coli type 1 pilus subunit FimF 提交 2006-11-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
23–176（154 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；310.1 K
NMR样品组成
1.4 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] FimF, 25 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 0.05 % sodium azide, 5 % D2O, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 3BFQ Crystal structure of truncated FimG (FimGt) in complex with the donor strand peptide of FimF (DSF) 提交 2007-11-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
23–37（15 aa）
片段：sequence database residues 23-37
|
未记录 | CO COBALT (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20 mM Tris/HCl, pH 8.0, 80 mM NaCl, 27.5% PEG 1500, 20 mM cobalt chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.34 Å R-free 0.179 |
| 3BFW Crystal structure of truncated FimG (FimGt) in complex with the donor strand peptide of FimF (DSF) 提交 2007-11-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
23–37（15 aa）
片段：sequence database residues 23-37
|
未记录 | YT3 YTTRIUM (III) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20 mM Tris/HCl, pH 8.0, 80 mM NaCl, 27.5% PEG 1500, 20 mM yttrium chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.238 |
| 3BFW Crystal structure of truncated FimG (FimGt) in complex with the donor strand peptide of FimF (DSF) 提交 2007-11-23 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
23–37（15 aa）
片段：sequence database residues 23-37
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20 mM Tris/HCl, pH 8.0, 80 mM NaCl, 27.5% PEG 1500, 20 mM yttrium chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.238 |
| 3BWU Crystal structure of the ternary complex of FimD (N-Terminal Domain, FimDN) with FimC and the N-terminally truncated pilus subunit FimF (FimFt) 提交 2008-01-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 F
35–176（142 aa）
片段：N-terminal truncation construct of pilus subunit fimF, Residues 13-154
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未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 13 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20 mM Tris/HCl pH 8.0, 20% PEG 8000, 50 mM succinic acid pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.212 |
| 3JWN Complex of FimC, FimF, FimG and FimH 提交 2009-09-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
23–176（154 aa）
片段：UNP residues 23-176
链 F
23–176（154 aa）
片段：UNP residues 23-176
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.1；293 K；1.6 M potassium chloride, 0.1 M sodium citrate, pH 4.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.69 Å R-free 0.272 |
| 3JWN Complex of FimC, FimF, FimG and FimH 提交 2009-09-18 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 K
23–176（154 aa）
片段：UNP residues 23-176
链 L
23–176（154 aa）
片段：UNP residues 23-176
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未记录 | GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.1；293 K；1.6 M potassium chloride, 0.1 M sodium citrate, pH 4.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.69 Å R-free 0.272 |
| 4J3O Crystal structure of the FimD usher traversed by the pilus tip complex assembly composed of FimC:FimF:FimG:FimH 提交 2013-02-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 F
23–176（154 aa）
片段：UNP residues 21-176
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；1.6-2.0M sodium formate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.299 |
| 5IQM Crystal structure of the E. coli type 1 pilus subunit FimG (engineered variant with substitution Q134E; N-terminal FimG residues 1-12 truncated) in complex with the donor strand peptide DsF_T4R-T6R-D13N 提交 2016-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
23–37（15 aa）
片段：UNP residues 23-37
|
未记录 | CO COBALT (II) ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；MOPS-NaOH pH 7.0 (RT), PEG-1500, NaCl, CoCl2
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.185 |
| 5IQM Crystal structure of the E. coli type 1 pilus subunit FimG (engineered variant with substitution Q134E; N-terminal FimG residues 1-12 truncated) in complex with the donor strand peptide DsF_T4R-T6R-D13N 提交 2016-03-11 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
23–37（15 aa）
片段：UNP residues 23-37
|
未记录 | CO COBALT (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；MOPS-NaOH pH 7.0 (RT), PEG-1500, NaCl, CoCl2
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.185 |
| 5IQN Crystal structure of the E. coli type 1 pilus subunit FimG (engineered variant with substitution Q134E; N-terminal FimG residues 1-12 truncated) in complex with the donor strand peptide DsF_SRIRIRGYVR 提交 2016-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
25–34（10 aa）
片段：UNP residues 35-34
|
未记录 | CO COBALT (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；MOPS-NaOH pH 6.8 (RT), PEG-1500, CoCl2, NaCl
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.146 |
| 5IQN Crystal structure of the E. coli type 1 pilus subunit FimG (engineered variant with substitution Q134E; N-terminal FimG residues 1-12 truncated) in complex with the donor strand peptide DsF_SRIRIRGYVR 提交 2016-03-11 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
25–34（10 aa）
片段：UNP residues 35-34
|
未记录 | CO COBALT (II) ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；MOPS-NaOH pH 6.8 (RT), PEG-1500, CoCl2, NaCl
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.146 |
| 5IQO Crystal structure of the E. coli type 1 pilus subunit FimG (engineered variant with substitutions Q134E and S138E; N-terminal FimG residues 1-12 truncated) in complex with the donor strand peptide DsF_T4R-T6R-D13N 提交 2016-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
23–37（15 aa）
片段：UNP residues 23-37
|
未记录 | CO COBALT (II) ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；MOPS-NaOH pH 7.6 (RT), PEG-1500, CoCl2, NaCl
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.170 |
| 5IQO Crystal structure of the E. coli type 1 pilus subunit FimG (engineered variant with substitutions Q134E and S138E; N-terminal FimG residues 1-12 truncated) in complex with the donor strand peptide DsF_T4R-T6R-D13N 提交 2016-03-11 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
23–37（15 aa）
片段：UNP residues 23-37
|
未记录 | CO COBALT (II) ION × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；MOPS-NaOH pH 7.6 (RT), PEG-1500, CoCl2, NaCl
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.170 |
| 6E14 Handover mechanism of the growing pilus by the bacterial outer membrane usher FimD 提交 2018-07-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 F
22–176（155 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 6E15 Handover mechanism of the growing pilus by the bacterial outer membrane usher FimD 提交 2018-07-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 F
22–176（155 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.10 Å |
| 9BOG Structural basis for adhesin secretion by the outer-membrane usher in type 1 pili 提交 2024-05-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 F
23–176（154 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.99 Å |
| 9FX0 Cryo-EM structure of the type 1 pilus tip-to-rod transition 提交 2024-07-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 F
23–176（154 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9FY9 Cryo-EM structure of the type 1 chaperone-usher pilus FimD-tip complex (FimDHGFC) - Conformer 1 提交 2024-07-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 F
23–176（154 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.30 Å |