当前蛋白身份：P08475
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1IR2 Crystal Structure of Activated Ribulose-1,5-bisphosphate Carboxylase/oxygenase (Rubisco) from Green alga, Chlamydomonas reinhardtii Complexed with 2-Carboxyarabinitol-1,5-bisphosphate (2-CABP) 提交 2001-09-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 I
46–185（140 aa）
链 J
46–185（140 aa）
链 K
46–185（140 aa）
链 L
46–185（140 aa）
链 M
46–185（140 aa）
链 N
46–185（140 aa）
链 O
46–185（140 aa）
链 P
46–185（140 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 8 CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8 GOL GLYCEROL × 20 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PEG4000, HEPES-KOH, glycerol, NaHCO3, MgCl2, DTT, 2-carboxyarabinitol-1,5-bisphosphate (2-CABP), EDTA, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.181 |
| 1IR2 Crystal Structure of Activated Ribulose-1,5-bisphosphate Carboxylase/oxygenase (Rubisco) from Green alga, Chlamydomonas reinhardtii Complexed with 2-Carboxyarabinitol-1,5-bisphosphate (2-CABP) 提交 2001-09-03 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 1
46–185（140 aa）
链 2
46–185（140 aa）
链 3
46–185（140 aa）
链 4
46–185（140 aa）
链 5
46–185（140 aa）
链 6
46–185（140 aa）
链 7
46–185（140 aa）
链 8
46–185（140 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 8 CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8 GOL GLYCEROL × 20 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PEG4000, HEPES-KOH, glycerol, NaHCO3, MgCl2, DTT, 2-carboxyarabinitol-1,5-bisphosphate (2-CABP), EDTA, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.181 |
| 7JFO EPYC1(49-72)-bound Rubisco 提交 2020-07-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 B
1–185（185 aa）
链 D
1–185（185 aa）
链 F
1–185（185 aa）
链 H
1–185（185 aa）
链 J
1–185（185 aa）
链 L
1–185（185 aa）
链 N
1–185（185 aa）
链 P
1–185（185 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；200 mM sorbitol, 50 mM HEPES, 50 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2.4H2O and 1 mM CaCl2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.13 Å |
| 7JN4 Rubisco in the apo state 提交 2020-08-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 B
1–185（185 aa）
链 D
1–185（185 aa）
链 F
1–185（185 aa）
链 H
1–185（185 aa）
链 J
1–185（185 aa）
链 L
1–185（185 aa）
链 N
1–185（185 aa）
链 P
1–185（185 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；200 mM sorbitol, 50 mM HEPES, 50 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2.4H2O and 1 mM CaCl2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.68 Å |
| 7JSX EPYC1(106-135) peptide-bound Rubisco 提交 2020-08-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 B
1–185（185 aa）
链 D
1–185（185 aa）
链 F
1–185（185 aa）
链 H
1–185（185 aa）
链 J
1–185（185 aa）
链 L
1–185（185 aa）
链 N
1–185（185 aa）
链 P
1–185（185 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；200 mM sorbitol, 50 mM HEPES, 50 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2.4H2O and 1 mM CaCl2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.06 Å |