当前蛋白身份：P08514
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1DPK SOLUTION STRUCTURE OF THE CYTOPLASMIC DOMAIN OF THE INTEGRIN ALPHA-IIB SUBUNIT 提交 1999-12-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1020–1039（20 aa）
片段：CYTOPLASMIC DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM NACL；压力 1
NMR样品组成
3MM PEPTIDE
|
分辨率未提供 |
| 1DPQ SOLUTION STRUCTURE OF THE CONSTITUTIVELY ACTIVE MUTANT OF THE INTEGRIN ALPHA IIB CYTOPLASMIC DOMAIN. 提交 1999-12-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1020–1039（20 aa）
片段：CYTOPLASMIC DOMAIN
|
突变：P1029A/P1030A | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM NACL；压力 1
NMR样品组成
3 MM PEPTIDE
|
分辨率未提供 |
| 1KUP Solution Structure of the Membrane Proximal Regions of alpha-IIb and beta-3 Integrins 提交 2002-01-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1018–1028（11 aa）
片段：Membrane proximal region
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.2；298 K；压力 ambient
NMR样品组成
2 mM aIIb/b3 peptides; pH 5.2 (unbuffered), 90% H2O 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
2 mM aIIb/b3 peptides; pH 5.2 (unbuffered), 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1KUZ Solution Structure of the Membrane Proximal Regions of alpha-IIb and beta-3 Integrins 提交 2002-01-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1018–1028（11 aa）
片段：Membrane proximal region
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.2；298 K；压力 ambient
NMR样品组成
2 mM aIIb/b3 peptides; pH 5.2 (unbuffered), 90% H2O 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
2 mM aIIb/b3 peptides; pH 5.2 (unbuffered), 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1M8O Platelet integrin alfaIIb-beta3 cytoplasmic domain 提交 2002-07-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1020–1039（20 aa）
片段：cytoplasmic domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.3
NMR样品组成
1mM 15N/13C MBP-beta3,
1.3 mM unlabeled alfaIIb, | 20 mM phosphate buffer pH6.3
5mM Ca
NMR样品组成
1mM 15N/13C MBP-alfaiib,
1.3 mM unlabeled beta3, | 20 mM phosphate buffer pH6.3
5mM Ca
NMR样品组成
1mM unlabeled alfaIIB,
0.1 mM unlabeled MBP-beta3,
0.2 mM unlabeled talin head domain | 20 mM phosphate buffer pH6.3
5mM Ca
|
分辨率未提供 |
| 1S4W NMR structure of the cytoplasmic domain of integrin AIIb in DPC micelles 提交 2004-01-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1020–1039（20 aa）
片段：cytoplasmic domain (residues 1020-1039)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.3；313 K
NMR样品组成
300 mM dDPC, 95/5% H2O/D2O | 95/5% H2O/D2O
|
分辨率未提供 |
| 1TYE Structural basis for allostery in integrins and binding of ligand-mimetic therapeutics to the platelet receptor for fibrinogen 提交 2004-07-07 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
32–483（452 aa）
片段：residues 1-452
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CAC CACODYLATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；10% PEG 8000, 0.4 M magnesium acetate, 0.1 M sodium cacodylate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.254 |
| 1TYE Structural basis for allostery in integrins and binding of ligand-mimetic therapeutics to the platelet receptor for fibrinogen 提交 2004-07-07 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
32–483（452 aa）
片段：residues 1-452
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CAC CACODYLATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；10% PEG 8000, 0.4 M magnesium acetate, 0.1 M sodium cacodylate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.254 |
| 1TYE Structural basis for allostery in integrins and binding of ligand-mimetic therapeutics to the platelet receptor for fibrinogen 提交 2004-07-07 | Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
32–483（452 aa）
片段：residues 1-452
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CAC CACODYLATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；10% PEG 8000, 0.4 M magnesium acetate, 0.1 M sodium cacodylate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.254 |
| 2K1A Bicelle-embedded integrin alpha(IIB) transmembrane segment 提交 2008-02-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
989–1029（41 aa）
片段：Transmembrane region
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.4；308.2 K；离子强度（mmCIF原始值）0.025；压力 ambient
NMR样品组成
0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N; 80% 2H] protein, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2K9J Integrin alphaIIb-beta3 transmembrane complex 提交 2008-10-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
989–1029（41 aa）
片段：Transmembrane domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.4；301.2 K；离子强度（mmCIF原始值）0.025；压力 ambient
NMR样品组成
1.2 mM [U-100% 13C; U-100% 15N; 80% 2H] Integrin alpha-IIb light chain, 1.2 mM [U-100% 13C; U-100% 15N; 80% 2H] Integrin beta-3, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2KNC Platelet integrin ALFAIIB-BETA3 transmembrane-cytoplasmic heterocomplex 提交 2009-08-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
991–1039（49 aa）
片段：transmembrane and cytoplasmic domains, residues 991-1039
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
25 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 AMBIENT
NMR样品组成
0.2 MM [U-100% 13C U-100% 15N] AIIBTMCD, 0.6 MM B3TMCD, 50% CD3CN/50% H2O, 0.1% TFA | 50% CD3CN/50% H2O
NMR样品组成
0.2 MM [U-100% 13C U-100% 15N] B3TMCD, 0.6 MM AIIBTMCD, 50% CD3CN/50% H2O, 0.1% TFA | 50% CD3CN/50% H2O
NMR样品组成
0.4 MM [U-100% 2H U-100% 15N] B3TMCD, 1.2 MM AIIBTMCD, 50% CD3CN/50% H2O, 0.1% TFA | 50% CD3CN/50% H2O
NMR样品组成
0.4 MM [U-100% 2H U-100% 15N] AIIBTMCD, 1.2 MM B3TMCD, 50% CD3CN/50% H2O, 0.1% TFA | 50% CD3CN/50% H2O
|
分辨率未提供 |
| 2MTP The structure of Filamin repeat 21 bound to integrin 提交 2014-08-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
1019–1039（21 aa）
片段：UNP residues 1019-1039
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N; U-80% 2H] protein, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2N9Y Structure of the Integrin alphaIIb-beta3(A711P) Transmembrane Complex 提交 2015-12-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
989–1029（41 aa）
片段：Helical transmembrane residues 989-1029
|
突变：A963C | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.4；313 K；离子强度（mmCIF原始值）0.05；压力 ambient
NMR样品组成
0.8 mM [U-15N; U-2H] alphaIIb, 0.8 mM beta3, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成
0.8 mM alphaIIb, 0.8 mM [U-15N; U-2H] beta3, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成
0.8 mM [U-99% 13C; U-99% 15N; 80% 2H] alphaIIb, 0.8 mM [U-99% 13C; U-99% 15N; 80% 2H] beta3, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2VC2 Re-refinement of Integrin AlphaIIbBeta3 Headpiece Bound to Antagonist L-739758 提交 2007-09-18 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
32–483（452 aa）
片段：HEADPIECE, RESIDUES 32-483
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 CA CALCIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 180 2-(S)-[N-(3-PYRIDYLSULFONYL)AMINO]-3-[[2-CARBONYL-5-[2-(PIPERIDIN-4-YL)ETHYL]-THIENO[2,3-B]THIOPHENEYL]AMINO]-PROPIONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；10-12% PEG 3350, 0.7 M MAGNESIUM ACETATE, 0.1 M IMIDAZOLE, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 277K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.217 |
| 2VDK Re-refinement of Integrin AlphaIIbBeta3 Headpiece 提交 2007-10-10 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
32–483（452 aa）
片段：HEADPIECE, RESIDUES 32-483
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 CA CALCIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CAC CACODYLATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；11% PEG 3350, 0.7 M MAGNESIUM ACETATE, 0.1 M SODIUM CACODYLATE, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 277K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.205 |
| 2VDL Re-refinement of Integrin AlphaIIbBeta3 Headpiece 提交 2007-10-10 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
32–483（452 aa）
片段：HEADPIECE, RESIDUES 32-483
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 CA CALCIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CAC CACODYLATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；11% PEG 3350, 0.7 M MAGNESIUM ACETATE, 0.1 M SODIUM CACODYLATE, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 277K
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.191 |
| 2VDM Re-refinement of Integrin AlphaIIbBeta3 Headpiece Bound to Antagonist Tirofiban 提交 2007-10-10 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
32–483（452 aa）
片段：HEADPIECE, RESIDUES 32-483
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 CA CALCIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 AGG TIROFIBAN × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；10-12% PEG3350, 0.7 M MAGNESIUM ACETATE, 0.1 M IMIDAZOLE, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 277K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.206 |
| 2VDN Re-refinement of Integrin AlphaIIbBeta3 Headpiece Bound to Antagonist Eptifibatide 提交 2007-10-10 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
32–483（452 aa）
片段：HEADPIECE, RESIDUES 32-483
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 CA CALCIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；11% PEG 3350, 0.7 M MAGNESIUM ACETATE, 0.1 M IMIDAZOLE, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 277K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.213 |
| 2VDO Integrin AlphaIIbBeta3 Headpiece Bound to Fibrinogen Gamma chain peptide, HHLGGAKQAGDV 提交 2007-10-10 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
32–483（452 aa）
片段：HEADPIECE, RESIDUES 32-483
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 CA CALCIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；11% PEG 3350, 0.7 M MAGNESIUM ACETATE, 0.1 M SODIUM CACODYLATE, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 277K
|
分辨率 2.51 Å R-free 0.190 |
| 2VDP Integrin AlphaIIbBeta3 Headpiece Bound to Fibrinogen Gamma chain peptide,LGGAKQAGDV 提交 2007-10-10 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
32–483（452 aa）
片段：HEADPIECE, RESIDUES 32-483
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 CA CALCIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；11% PEG 3350, 0.7 M MAGNESIUM ACETATE, 0.1 M SODIUM CACODYLATE, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 277K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.204 |
| 2VDQ Integrin AlphaIIbBeta3 Headpiece Bound to a Chimeric Fibrinogen Gamma chain peptide, HHLGGAKQRGDV 提交 2007-10-10 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
32–483（452 aa）
片段：HEADPIECE, RESIDUES 32-483
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 CA CALCIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；11% PEG 3350, 0.7 M MAGNESIUM ACETATE, 0.1 M SODIUM CACODYLATE, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 277K
|
分辨率 2.59 Å R-free 0.190 |
| 2VDR Integrin AlphaIIbBeta3 Headpiece Bound to a chimeric Fibrinogen Gamma chain peptide, LGGAKQRGDV 提交 2007-10-10 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
32–483（452 aa）
片段：HEADPIECE, RESIDUES 32-483
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 CA CALCIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；11% PEG 3350, 0.7 M MAGNESIUM ACETATE, 0.1 M SODIUM CACODYLATE, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 277K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.193 |
| 3NID The Closed Headpiece of Integrin alphaIIB beta3 and its Complex with an alpahIIB beta3 -Specific Antagonist That Does Not Induce Opening 提交 2010-06-15 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
32–488（457 aa）
片段：Integrin alpha-IIb, residues 32-488
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 GOL GLYCEROL × 7 SO4 SULFATE ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.215 |
| 3NID The Closed Headpiece of Integrin alphaIIB beta3 and its Complex with an alpahIIB beta3 -Specific Antagonist That Does Not Induce Opening 提交 2010-06-15 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
32–488（457 aa）
片段：Integrin alpha-IIb, residues 32-488
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.215 |
| 3NIF The Closed Headpiece of Integrin IIb 3 and its Complex with an IIb 3 -Specific Antagonist That Does Not Induce Opening 提交 2010-06-15 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
32–488（457 aa）
片段：Integrin alpha-IIb, residues 32-488
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 NIF 2-ethyl-7-piperazin-1-yl-5H-[1,3,4]thiadiazolo[3,2-a]pyrimidin-5-one × 1 GOL GLYCEROL × 7 SO4 SULFATE ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.216 |
| 3NIF The Closed Headpiece of Integrin IIb 3 and its Complex with an IIb 3 -Specific Antagonist That Does Not Induce Opening 提交 2010-06-15 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
32–488（457 aa）
片段：Integrin alpha-IIb, residues 32-488
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 NIF 2-ethyl-7-piperazin-1-yl-5H-[1,3,4]thiadiazolo[3,2-a]pyrimidin-5-one × 1 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.216 |
| 3NIG The Closed Headpiece of Integrin IIb 3 and its Complex with an IIb 3 -Specific Antagonist That Does Not Induce Opening 提交 2010-06-15 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
32–488（457 aa）
片段：Integrin alpha-IIb, residues 32-488
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.212 |
| 3NIG The Closed Headpiece of Integrin IIb 3 and its Complex with an IIb 3 -Specific Antagonist That Does Not Induce Opening 提交 2010-06-15 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
32–488（457 aa）
片段：Integrin alpha-IIb, residues 32-488
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.212 |
| 3T3M A Novel High Affinity Integrin alphaIIbbeta3 Receptor Antagonist That Unexpectedly Displaces Mg2+ from the beta3 MIDAS 提交 2011-07-25 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
32–488（457 aa）
片段：UNP residues 32-488
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 RC2 N-{3-[5-oxo-7-(piperazin-1-yl)-5H-[1,3,4]thiadiazolo[3,2-a]pyrimidin-2-yl]phenyl}glycinamide × 1 SO4 SULFATE ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.222 |
| 3T3M A Novel High Affinity Integrin alphaIIbbeta3 Receptor Antagonist That Unexpectedly Displaces Mg2+ from the beta3 MIDAS 提交 2011-07-25 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
32–488（457 aa）
片段：UNP residues 32-488
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 RC2 N-{3-[5-oxo-7-(piperazin-1-yl)-5H-[1,3,4]thiadiazolo[3,2-a]pyrimidin-2-yl]phenyl}glycinamide × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.222 |
| 3T3P A Novel High Affinity Integrin alphaIIbbeta3 Receptor Antagonist That Unexpectedly Displaces Mg2+ from the beta3 MIDAS 提交 2011-07-25 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
32–488（457 aa）
片段：UNP residues 32-488
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 1 CA CALCIUM ION × 6 CL CHLORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.220 |
| 3T3P A Novel High Affinity Integrin alphaIIbbeta3 Receptor Antagonist That Unexpectedly Displaces Mg2+ from the beta3 MIDAS 提交 2011-07-25 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
32–488（457 aa）
片段：UNP residues 32-488
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 CA CALCIUM ION × 6 CL CHLORIDE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.220 |
| 3ZDX Integrin alphaIIB beta3 headpiece and RGD peptide complex 提交 2012-12-03 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
32–488（457 aa）
片段：INTEGRIN HEADPIECE, RESIDUES 32-488
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 4 SO4 SULFATE ION × 3 CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.9；11% PEG 8000, 0.2 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M TRIS-HCL, PH 8.9
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.197 |
| 3ZDX Integrin alphaIIB beta3 headpiece and RGD peptide complex 提交 2012-12-03 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
32–488（457 aa）
片段：INTEGRIN HEADPIECE, RESIDUES 32-488
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 7 CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.9；11% PEG 8000, 0.2 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M TRIS-HCL, PH 8.9
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.197 |
| 3ZDY Integrin alphaIIB beta3 headpiece and RGD peptide complex 提交 2012-12-03 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
32–488（457 aa）
片段：RESIDUES 32-488
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 14 CA CALCIUM ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.9；11% PEG 8000, 0.2 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M TRIS-HCL, PH 8.9
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.216 |
| 3ZDY Integrin alphaIIB beta3 headpiece and RGD peptide complex 提交 2012-12-03 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
32–488（457 aa）
片段：RESIDUES 32-488
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 6 CA CALCIUM ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.9；11% PEG 8000, 0.2 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M TRIS-HCL, PH 8.9
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.216 |
| 3ZDZ Integrin alphaIIB beta3 headpiece and RGD peptide complex 提交 2012-12-03 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
32–488（457 aa）
片段：RESIDUES 32-488
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.9；11% PEG 8000, 0.2 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M TRIS-HCL, PH 8.9
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.221 |
| 3ZDZ Integrin alphaIIB beta3 headpiece and RGD peptide complex 提交 2012-12-03 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
32–488（457 aa）
片段：RESIDUES 32-488
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.9；11% PEG 8000, 0.2 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M TRIS-HCL, PH 8.9
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.221 |
| 3ZE0 Integrin alphaIIB beta3 headpiece and RGD peptide complex 提交 2012-12-03 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
32–488（457 aa）
片段：RESIDUES 32-488
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.9；11% PEG 8000, 0.2 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M TRIS-HCL, PH 8.9
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.243 |
| 3ZE0 Integrin alphaIIB beta3 headpiece and RGD peptide complex 提交 2012-12-03 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
32–488（457 aa）
片段：RESIDUES 32-488
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.9；11% PEG 8000, 0.2 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M TRIS-HCL, PH 8.9
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.243 |
| 3ZE1 Integrin alphaIIB beta3 headpiece and RGD peptide complex 提交 2012-12-03 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
32–488（457 aa）
片段：RESIDUES 32-488
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.9；11% PEG 8000, 0.2 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M TRIS-HCL PH 8.9
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.233 |
| 3ZE1 Integrin alphaIIB beta3 headpiece and RGD peptide complex 提交 2012-12-03 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
32–488（457 aa）
片段：RESIDUES 32-488
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.9；11% PEG 8000, 0.2 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M TRIS-HCL PH 8.9
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.233 |
| 3ZE2 Integrin alphaIIB beta3 headpiece and RGD peptide complex 提交 2012-12-03 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
32–488（457 aa）
片段：RESIDUE 32-488
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 5 SO4 SULFATE ION × 2 CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.9；11% PEG 8000, 0.2 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M TRIS-HCL, PH 8.9
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.204 |
| 3ZE2 Integrin alphaIIB beta3 headpiece and RGD peptide complex 提交 2012-12-03 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
32–488（457 aa）
片段：RESIDUE 32-488
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 5 CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.9；11% PEG 8000, 0.2 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M TRIS-HCL, PH 8.9
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.204 |
| 4CAK Three-dimensional reconstruction of intact human integrin alphaIIbbeta3 in a phospholipid bilayer nanodisc 提交 2013-10-08 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
32–990（959 aa）
片段：ECTODOMAIN, UNP RESIDUES 32-990
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
150 MM NACL, 10 MM HEPES, PH 7.4, 1 MM CACL2 AND 1 MM MGCL2；pH 7.4；150 MM NACL, 10 MM HEPES, PH 7.4, 1 MM CACL2 AND 1 MM MGCL2
cryo-EM玻璃化条件
VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- NONE, INSTRUMENT- NONE,
|
分辨率 20.50 Å |
| 4Z7N Integrin alphaIIbbeta3 in complex with AGDV peptide 提交 2015-04-07 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
32–486（455 aa）
片段：UNP residues 32-486
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 SO4 SULFATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 1 MN MANGANESE (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.253 |
| 4Z7N Integrin alphaIIbbeta3 in complex with AGDV peptide 提交 2015-04-07 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
32–486（455 aa）
片段：UNP residues 32-486
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 SO4 SULFATE ION × 3 MN MANGANESE (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.253 |
| 4Z7O Integrin alphaIIbbeta3 in complex with AGDV peptide 提交 2015-04-07 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
32–486（455 aa）
片段：UNP residues 32-486
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.257 |
| 4Z7O Integrin alphaIIbbeta3 in complex with AGDV peptide 提交 2015-04-07 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
32–486（455 aa）
片段：UNP residues 32-486
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.257 |
| 4Z7Q Integrin alphaIIbbeta3 in complex with AGDV-NH2 peptide 提交 2015-04-07 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：pentameric（5） 待复核 |
链 A
32–485（454 aa）
片段：UNP residues 32-486
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 1 MN MANGANESE (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.236 |
| 4Z7Q Integrin alphaIIbbeta3 in complex with AGDV-NH2 peptide 提交 2015-04-07 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：pentameric（5） 待复核 |
链 C
32–485（454 aa）
片段：UNP residues 32-486
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 SO4 SULFATE ION × 3 MN MANGANESE (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.236 |
| 5HDB Integrin alphaIIbbeta3 in complex with Ro-435054 提交 2016-01-05 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
32–485（454 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 1 CA CALCIUM ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 5YB N-(4-carbamimidoylbenzoyl)-beta-alanyl-L-alpha-aspartyl-L-phenylalanine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.237 |
| 5HDB Integrin alphaIIbbeta3 in complex with Ro-435054 提交 2016-01-05 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
32–485（454 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 CA CALCIUM ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 5YB N-(4-carbamimidoylbenzoyl)-beta-alanyl-L-alpha-aspartyl-L-phenylalanine × 1 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.237 |
| 6V4P Structure of the integrin AlphaIIbBeta3-Abciximab complex 提交 2019-11-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–963（963 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 2.80 Å |
| 7KN0 Structure of the integrin aIIb(W968V)b3 transmembrane complex 提交 2020-11-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
989–1029（41 aa）
|
突变：A963G, W968V | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.4；313.2 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 1
NMR样品组成
0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N; U-80% 2H] transmembrane complex, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
|
分辨率未提供 |
| 7L8P Integrin alphaIIbbeta3 in complex with sibrafiban 提交 2020-12-31 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
32–488（457 aa）
片段：UNP Residues 32-488
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 1 CA CALCIUM ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 XQS sibrafiban (active form) × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.245 |
| 7L8P Integrin alphaIIbbeta3 in complex with sibrafiban 提交 2020-12-31 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
32–488（457 aa）
片段：UNP Residues 32-488
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 CA CALCIUM ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 XQS sibrafiban (active form) × 1 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.245 |
| 7LA4 Integrin AlphaIIbBeta3-PT25-2 Complex 提交 2021-01-05 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1039（1039 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 7SC4 filamin complex-1 提交 2021-09-27 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1019–1039（21 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；2 M Ammonium Sulfate, 5% 2-propanol
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.261 |
| 7SC4 filamin complex-1 提交 2021-09-27 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1019–1039（21 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；2 M Ammonium Sulfate, 5% 2-propanol
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.261 |
| 7SFT Filamin complex-2 提交 2021-10-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1019–1039（21 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）61；压力 1
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] filamin Ig21, 2 mM Integrin alpha-IIb light chain, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-15N; U-2H] filamin Ig21, 2 mM Integrin alpha-IIb light chain, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
2 mM Integrin alpha-IIb light chain, 0.05 mM GST-filamin-Ig21, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 7TCT Integrin alpha IIB beta3 complex with UR2922 提交 2021-12-28 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
32–488（457 aa）
片段：UNP Residues 32-488
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 SO4 SULFATE ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 I1F {5-[N-(4-carbamimidoylbenzoyl)-4-nitro-L-phenylalanyl]-4,5,6,7-tetrahydro-2H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-2-yl}acetic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；11-13% PEG 8000, 0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.227 |
| 7TCT Integrin alpha IIB beta3 complex with UR2922 提交 2021-12-28 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
32–488（457 aa）
片段：UNP Residues 32-488
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 SO4 SULFATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 I1F {5-[N-(4-carbamimidoylbenzoyl)-4-nitro-L-phenylalanyl]-4,5,6,7-tetrahydro-2H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-2-yl}acetic acid × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；11-13% PEG 8000, 0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.227 |
| 7TD8 Integrin alpha IIB beta3 complex with Tirofiban 提交 2021-12-30 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
32–484（453 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 SO4 SULFATE ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 AGG TIROFIBAN × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；11-13% PEG 8000, 0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.210 |
| 7TD8 Integrin alpha IIB beta3 complex with Tirofiban 提交 2021-12-30 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
32–484（453 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 AGG TIROFIBAN × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；11-13% PEG 8000, 0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.210 |
| 7THO Integrin alpha IIB beta3 complex with Eptifibatide 提交 2022-01-11 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
32–485（454 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 SO4 SULFATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；11-13% PEG 8000, 0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.222 |
| 7THO Integrin alpha IIB beta3 complex with Eptifibatide 提交 2022-01-11 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
32–485（454 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 SO4 SULFATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；11-13% PEG 8000, 0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.222 |
| 7TMZ Integrin alpha IIB beta3 complex with BMS compound 4 提交 2022-01-20 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
32–485（454 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 6 CA CALCIUM ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 I7R (4-{[(5S)-3-{4-[(E)-imino(4-methylpiperazin-1-yl)methyl]phenyl}-4,5-dihydro-1,2-oxazol-5-yl]methyl}piperazin-1-yl)acetic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；11-13% PEG 8000, 0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.241 |
| 7TMZ Integrin alpha IIB beta3 complex with BMS compound 4 提交 2022-01-20 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
32–485（454 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 CA CALCIUM ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 I7R (4-{[(5S)-3-{4-[(E)-imino(4-methylpiperazin-1-yl)methyl]phenyl}-4,5-dihydro-1,2-oxazol-5-yl]methyl}piperazin-1-yl)acetic acid × 1 CL CHLORIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；11-13% PEG 8000, 0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.241 |
| 7TPD Integrin alpha IIB beta3 complex with EF5154 提交 2022-01-25 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
32–488（457 aa）
片段：UNP Residues 32-488
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 SO4 SULFATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 IR7 (4-{[2-oxo-4-(piperidin-4-yl)piperazin-1-yl]acetyl}phenoxy)acetic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；11-13% PEG 8000, 0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.194 |
| 7TPD Integrin alpha IIB beta3 complex with EF5154 提交 2022-01-25 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
32–488（457 aa）
片段：UNP Residues 32-488
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 SO4 SULFATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 IR7 (4-{[2-oxo-4-(piperidin-4-yl)piperazin-1-yl]acetyl}phenoxy)acetic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；11-13% PEG 8000, 0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.194 |
| 7U60 Integrin alpha IIB beta3 complex with cRGDfV 提交 2022-03-03 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
32–486（455 aa）
片段：UNP residues 32-486
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 GOL GLYCEROL × 8 SO4 SULFATE ION × 6 MN MANGANESE (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；11-13% PEG 8000, 0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.225 |
| 7U60 Integrin alpha IIB beta3 complex with cRGDfV 提交 2022-03-03 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
32–486（455 aa）
片段：UNP residues 32-486
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 GOL GLYCEROL × 3 SO4 SULFATE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；11-13% PEG 8000, 0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.225 |
| 7U9F Integrin alpha IIB beta3 complex with BMS compound 4 in Mn2+ 提交 2022-03-10 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
32–485（454 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 5 CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 I7R (4-{[(5S)-3-{4-[(E)-imino(4-methylpiperazin-1-yl)methyl]phenyl}-4,5-dihydro-1,2-oxazol-5-yl]methyl}piperazin-1-yl)acetic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；11-13% PEG 8000, 0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.237 |
| 7U9F Integrin alpha IIB beta3 complex with BMS compound 4 in Mn2+ 提交 2022-03-10 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
32–485（454 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 I7R (4-{[(5S)-3-{4-[(E)-imino(4-methylpiperazin-1-yl)methyl]phenyl}-4,5-dihydro-1,2-oxazol-5-yl]methyl}piperazin-1-yl)acetic acid × 1 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；11-13% PEG 8000, 0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.237 |
| 7U9V Integrin alpha IIB beta3 complex with BMS4-1 提交 2022-03-11 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
32–485（454 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 5 CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 M6K (4-{[(5S)-3-(4-carbamimidoylphenyl)-4,5-dihydro-1,2-oxazol-5-yl]methyl}piperazin-1-yl)acetic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；11-13% PEG 8000, 0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.226 |
| 7U9V Integrin alpha IIB beta3 complex with BMS4-1 提交 2022-03-11 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
32–485（454 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 M6K (4-{[(5S)-3-(4-carbamimidoylphenyl)-4,5-dihydro-1,2-oxazol-5-yl]methyl}piperazin-1-yl)acetic acid × 1 CL CHLORIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；11-13% PEG 8000, 0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.226 |
| 7UBR Integrin alpha IIB beta3 complex with GR144053 提交 2022-03-15 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
32–485（454 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 7 CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 MJX {4-[4-(4-carbamimidoylphenyl)piperazin-1-yl]piperidin-1-yl}acetic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.223 |
| 7UBR Integrin alpha IIB beta3 complex with GR144053 提交 2022-03-15 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
32–485（454 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 5 CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 MJX {4-[4-(4-carbamimidoylphenyl)piperazin-1-yl]piperidin-1-yl}acetic acid × 1 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.223 |
| 7UCY Integrin alpha IIB beta3 complex with gantofiban 提交 2022-03-17 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
32–488（457 aa）
片段：UNP Residues 32-488
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 5 CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 MV8 (4-{[(5R)-3-(4-carbamimidoylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}piperazin-1-yl)acetic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.231 |
| 7UCY Integrin alpha IIB beta3 complex with gantofiban 提交 2022-03-17 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
32–488（457 aa）
片段：UNP Residues 32-488
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 MV8 (4-{[(5R)-3-(4-carbamimidoylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}piperazin-1-yl)acetic acid × 1 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.231 |
| 7UDG Integrin alpha IIB beta3 complex with lotrafiban 提交 2022-03-19 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
32–488（457 aa）
片段：UNP Residues 32-488
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 5 CA CALCIUM ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 MWI Lotrafiban × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.235 |
| 7UDG Integrin alpha IIB beta3 complex with lotrafiban 提交 2022-03-19 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
32–488（457 aa）
片段：UNP Residues 32-488
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 CA CALCIUM ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 MWI Lotrafiban × 1 CL CHLORIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.235 |
| 7UDH Integrin alpha IIB beta3 complex with BMS4-3 提交 2022-03-19 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
32–488（457 aa）
片段：UNP Residues 32-488
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 5 CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 MWO (4-{[(5S)-3-(piperidin-4-yl)-4,5-dihydro-1,2-oxazol-5-yl]methyl}piperazin-1-yl)acetic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.214 |
| 7UDH Integrin alpha IIB beta3 complex with BMS4-3 提交 2022-03-19 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
32–488（457 aa）
片段：UNP Residues 32-488
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 MWO (4-{[(5S)-3-(piperidin-4-yl)-4,5-dihydro-1,2-oxazol-5-yl]methyl}piperazin-1-yl)acetic acid × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 CL CHLORIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.214 |
| 7UE0 Integrin alpha IIB beta3 complex with fradafiban 提交 2022-03-20 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
32–488（457 aa）
片段：UNP Residues 32-488
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 1 CA CALCIUM ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 MWX Fradafiban × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl
|
分辨率 2.74 Å R-free 0.253 |
| 7UE0 Integrin alpha IIB beta3 complex with fradafiban 提交 2022-03-20 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
32–488（457 aa）
片段：UNP Residues 32-488
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 CA CALCIUM ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 MWX Fradafiban × 1 CL CHLORIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl
|
分辨率 2.74 Å R-free 0.253 |
| 7UFH Integrin alpha IIB beta3 complex with fradafiban (Mn/Ca) 提交 2022-03-22 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
32–488（457 aa）
片段：UNP Residues 32-488
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 1 CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 MWX Fradafiban × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.245 |
| 7UFH Integrin alpha IIB beta3 complex with fradafiban (Mn/Ca) 提交 2022-03-22 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
32–488（457 aa）
片段：UNP Residues 32-488
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 MWX Fradafiban × 1 CL CHLORIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.245 |
| 7UH8 Integrin alpha IIB beta3 complex with roxifiban (Mn/Ca) 提交 2022-03-25 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
32–488（457 aa）
片段：UNP Residues 32-488
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 5 CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 N9U Roxifiban × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.248 |
| 7UH8 Integrin alpha IIB beta3 complex with roxifiban (Mn/Ca) 提交 2022-03-25 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
32–488（457 aa）
片段：UNP Residues 32-488
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 N9U Roxifiban × 1 CL CHLORIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.248 |
| 7UJE Integrin alpha IIB beta3 complex with UR2922 in Mn2+ 提交 2022-03-30 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
32–485（454 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 6 CA CALCIUM ION × 4 GOL GLYCEROL × 1 MN MANGANESE (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 I1F {5-[N-(4-carbamimidoylbenzoyl)-4-nitro-L-phenylalanyl]-4,5,6,7-tetrahydro-2H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-2-yl}acetic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；11-13% PEG 8000, 0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.239 |
| 7UJE Integrin alpha IIB beta3 complex with UR2922 in Mn2+ 提交 2022-03-30 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
32–485（454 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 I1F {5-[N-(4-carbamimidoylbenzoyl)-4-nitro-L-phenylalanyl]-4,5,6,7-tetrahydro-2H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-2-yl}acetic acid × 1 CL CHLORIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；11-13% PEG 8000, 0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.9
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.239 |
| 7UJK Integrin alpha IIB beta3 complex with lamifiban 提交 2022-03-30 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
32–488（457 aa）
片段：UNP Residues 32-488
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 1 CA CALCIUM ION × 6 CL CHLORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 NB9 Lamifiban × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.247 |
| 7UJK Integrin alpha IIB beta3 complex with lamifiban 提交 2022-03-30 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
32–488（457 aa）
片段：UNP Residues 32-488
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 CA CALCIUM ION × 6 CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 NB9 Lamifiban × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.247 |
| 7UK9 Integrin alpha IIB beta3 complex with lamifiban (Mn) 提交 2022-03-31 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
32–488（457 aa）
片段：UNP Residues 32-488
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 5 CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 NB9 Lamifiban × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.242 |
| 7UK9 Integrin alpha IIB beta3 complex with lamifiban (Mn) 提交 2022-03-31 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
32–488（457 aa）
片段：UNP Residues 32-488
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 NB9 Lamifiban × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.242 |
| 7UKO Integrin alpha IIB beta3 complex with sibrafiban (Mn) 提交 2022-04-01 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
32–488（457 aa）
片段：UNP Residues 32-488
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 CA CALCIUM ION × 4 GOL GLYCEROL × 2 MN MANGANESE (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 XQS sibrafiban (active form) × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.239 |
| 7UKO Integrin alpha IIB beta3 complex with sibrafiban (Mn) 提交 2022-04-01 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
32–488（457 aa）
片段：UNP Residues 32-488
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 XQS sibrafiban (active form) × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.239 |
| 7UKP Integrin alpha IIB beta3 complex with a gantofiban analog 提交 2022-04-01 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
32–488（457 aa）
片段：UNP Residues 32-488
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 3 CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 NJ9 3-(4-{[(5S)-3-(4-carbamimidoylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}piperazin-1-yl)propanoic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.241 |
| 7UKP Integrin alpha IIB beta3 complex with a gantofiban analog 提交 2022-04-01 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
32–488（457 aa）
片段：UNP Residues 32-488
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 NJ9 3-(4-{[(5S)-3-(4-carbamimidoylphenyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-5-yl]methyl}piperazin-1-yl)propanoic acid × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.241 |
| 7UKT Integrin alpha IIB beta3 complex with BMS4.2 提交 2022-04-01 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
32–488（457 aa）
片段：UNP Residues 32-488
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 5 CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 NJF (1-{[(5S)-3-(4-carbamimidoylphenyl)-4,5-dihydro-1,2-oxazol-5-yl]methyl}piperidin-4-yl)acetic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl
|
分辨率 2.37 Å R-free 0.218 |
| 7UKT Integrin alpha IIB beta3 complex with BMS4.2 提交 2022-04-01 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
32–488（457 aa）
片段：UNP Residues 32-488
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 NJF (1-{[(5S)-3-(4-carbamimidoylphenyl)-4,5-dihydro-1,2-oxazol-5-yl]methyl}piperidin-4-yl)acetic acid × 1 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；277 K；11% PEG 8000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl
|
分辨率 2.37 Å R-free 0.218 |
| 8GCD Full length Integrin AlphaIIbBeta3 in inactive state 提交 2023-03-01 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1039（1039 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 7 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.97 Å |
| 8GCE The Extracellular Domain of Integrin AlphaIIbBeta3 in Intermediate State 提交 2023-03-01 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1039（1039 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.12 Å |
| 8T2U Cryo-EM Structures of Full-length Integrin alphaIIbbeta3 in Native Lipids complexed with Eptifibatide 提交 2023-06-06 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
32–1039（1008 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；TBS/1mM CaCl2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8T2V Cryo-EM Structures of Full-length Integrin alphaIIbbeta3 in Native Lipids 提交 2023-06-06 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
32–1039（1008 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 7 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 CLR CHOLESTEROL × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；TBS/1mM CaCl2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9AXL Structure of the semi-extended AlphaIIbBeta3 in complex with R21D10 Fab 提交 2024-03-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1039（1039 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9DAO AlphaIIbbeta3 in fully-extended conformation in complex with R6H8 Fab 提交 2024-08-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
32–1039（1008 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 9DAX The structure of AlphaIIbbeta3 in apo state 提交 2024-08-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
32–1039（1008 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9DEQ Cryo-EM structures of full-length integrin alphaIIbbeta3 in native lipids complexed with modified tirofiban 提交 2024-08-29 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
32–1039（1008 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 7 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 A1A5G N-(1,3-benzoxazole-2-carbonyl)-O-[4-(piperidin-4-yl)butyl]-L-tyrosine × 1 CLR CHOLESTEROL × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；TBS/1mM CaCl2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 9DER Cryo-EM Structures of Full-Length Integrin alphaIIbbeta3 in Native Lipids Complexed with Tirofiban 提交 2024-08-29 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
32–1039（1008 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 AGG TIROFIBAN × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；TBS/1mM CaCl2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 9E8A Integrin aIIbb3 bent conformation from human platelet membrane crude preparation 提交 2024-11-05 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1039（1039 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 7 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.75 Å |
| 9E8B Integrin aIIbb3 intermediate conformation from human platelet membrane crude preparation 提交 2024-11-05 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
32–631（600 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.67 Å |
| 9E8C Integrin aIIbb3 dimer conformation from human platelet membrane crude preparation 提交 2024-11-05 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1039（1039 aa）
链 C
1–1039（1039 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 12 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9TD2 Integrin AlphaIIbBeta3 bound to Fab of the anti-HPA-1a antibody 26.4 提交 2025-11-22 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
32–994（963 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.64 Å |