当前蛋白身份:P08661
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1BV4 APO-MANNOSE-BINDING PROTEIN-C 提交 1998-09-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
127–244(118 aa)
片段:SUBTILISIN FRAGMENT
链 B
127–244(118 aa)
片段:SUBTILISIN FRAGMENT
链 C
127–244(118 aa)
片段:SUBTILISIN FRAGMENT
链 D
127–244(118 aa)
片段:SUBTILISIN FRAGMENT
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.2;12% PEG 8000, 100 MM NAMES, PH 6.1, 200 MM LICL, 2 MM EDTA 0.02%, NAN3, pH 6.2
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.256 |
| 1KZA Complex of MBP-C and Man-a13-Man 提交 2002-02-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 1
129–243(115 aa)
片段:SUBTILISIN FRAGMENT (RESIDUES 129-243 of P08661)
链 2
129–243(115 aa)
片段:SUBTILISIN FRAGMENT (RESIDUES 129-243 of P08661)
|
未记录 | MAN alpha-D-mannopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;298 K;PEG 8000, Tris-Cl, NaCl, CaCl2, NaN3, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.235 |
| 1KZB Complex of MBP-C and trimannosyl core 提交 2002-02-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 1
129–243(115 aa)
片段:SUBTILISIN FRAGMENT (RESIDUES 129-243 of P08661)
链 2
129–243(115 aa)
片段:SUBTILISIN FRAGMENT (RESIDUES 129-243 of P08661)
|
未记录 | MAN alpha-D-mannopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;298 K;PEG 8000, Tris-Cl, NaCl, CaCl2, NaN3, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.259 |
| 1KZC Complex of MBP-C and high-affinity linear trimannose 提交 2002-02-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 1
129–243(115 aa)
片段:SUBTILISIN FRAGMENT (RESIDUES 129-243 of P08661)
链 2
129–243(115 aa)
片段:SUBTILISIN FRAGMENT (RESIDUES 129-243 of P08661)
|
未记录 | MAN alpha-D-mannopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;298 K;PEG 8000, Tris-Cl, NaCl, CaCl2, NaN3, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.242 |
| 1KZD Complex of MBP-C and GlcNAc-terminated core 提交 2002-02-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 1
129–243(115 aa)
片段:SUBTILISIN FRAGMENT (RESIDUES 129-243 of P08661)
链 2
129–243(115 aa)
片段:SUBTILISIN FRAGMENT (RESIDUES 129-243 of P08661)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;298 K;PEG 8000, Tris-Cl, NaCl, CaCl2, NaN3, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.239 |
| 1KZE Complex of MBP-C and bivalent Man-terminated glycopeptide 提交 2002-02-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 1
129–243(115 aa)
片段:SUBTILISIN FRAGMENT (RESIDUES 129-243 of P08661)
链 2
129–243(115 aa)
片段:SUBTILISIN FRAGMENT (RESIDUES 129-243 of P08661)
|
未记录 | MAN alpha-D-mannopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;298 K;PEG 8000, Tris-Cl, NaCl, CaCl2, NaN3, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.243 |
| 1RDI MANNOSE-BINDING PROTEIN, SUBTILISIN DIGEST FRAGMENT COMPLEX WITH ALPHA-METHYL-L-FUCOPYRANOSIDE 提交 1995-09-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 1
132–244(113 aa)
片段:SUBTILISIN FRAGMENT (RESIDUES 114 - 226)
链 2
132–244(113 aa)
片段:SUBTILISIN FRAGMENT (RESIDUES 114 - 226)
|
未记录 | MFU methyl alpha-L-fucopyranoside × 2 CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.4;pH 7.4, 20% MPD USED AS A CRYOPROTECTANT
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.244 |
| 1RDJ MANNOSE-BINDING PROTEIN, SUBTILISIN DIGEST FRAGMENT COMPLEX WITH BETA-METHYL-L-FUCOPYRANOSIDE 提交 1995-09-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 1
132–244(113 aa)
片段:SUBTILISIN FRAGMENT (RESIDUES 114 - 226)
链 2
132–244(113 aa)
片段:SUBTILISIN FRAGMENT (RESIDUES 114 - 226)
|
未记录 | MFB methyl beta-L-fucopyranoside × 2 CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.4;pH 7.4, 20% MPD USED AS A CRYOPROTECTANT
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.246 |
| 1RDK MANNOSE-BINDING PROTEIN, SUBTILISIN DIGEST FRAGMENT COMPLEX WITH D-GALACTOSE 提交 1995-09-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 1
132–244(113 aa)
片段:SUBTILISIN FRAGMENT (RESIDUES 114 - 226)
链 2
132–244(113 aa)
片段:SUBTILISIN FRAGMENT (RESIDUES 114 - 226)
|
未记录 | GAL beta-D-galactopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.4;pH 7.4
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.265 |
| 1RDL MANNOSE-BINDING PROTEIN, SUBTILISIN DIGEST FRAGMENT COMPLEX WITH ALPHA-METHYL-D-MANNOPYRANOSIDE (0.2 M) 提交 1995-09-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 1
132–244(113 aa)
片段:SUBTILISIN FRAGMENT (RESIDUES 114 - 226)
链 2
132–244(113 aa)
片段:SUBTILISIN FRAGMENT (RESIDUES 114 - 226)
|
未记录 | MMA methyl alpha-D-mannopyranoside × 2 CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.4;pH 7.4
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.230 |
| 1RDM MANNOSE-BINDING PROTEIN, SUBTILISIN DIGEST FRAGMENT COMPLEX WITH ALPHA-METHYL-D-MANNOPYRANOSIDE (1.3 M) 提交 1995-09-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 1
132–244(113 aa)
片段:SUBTILISIN FRAGMENT (RESIDUES 114 - 226)
链 2
132–244(113 aa)
片段:SUBTILISIN FRAGMENT (RESIDUES 114 - 226)
|
未记录 | MMA methyl alpha-D-mannopyranoside × 3 CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.4;pH 7.4
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.240 |
| 1RDN MANNOSE-BINDING PROTEIN, SUBTILISIN DIGEST FRAGMENT COMPLEX WITH ALPHA-METHYL-D-N-ACETYLGLUCOSAMINIDE 提交 1995-09-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 1
132–244(113 aa)
片段:SUBTILISIN FRAGMENT (RESIDUES 114 - 226)
链 2
132–244(113 aa)
片段:SUBTILISIN FRAGMENT (RESIDUES 114 - 226)
|
未记录 | NDG 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.4;pH 7.4
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.237 |
| 1RDO MANNOSE-BINDING PROTEIN, SUBTILISIN DIGEST FRAGMENT 提交 1995-09-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 1
132–244(113 aa)
片段:SUBTILISIN FRAGMENT (RESIDUES 114 - 226)
链 2
132–244(113 aa)
片段:SUBTILISIN FRAGMENT (RESIDUES 114 - 226)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.4;pH 7.4
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.238 |