当前蛋白身份：P08669
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相关结构差异明细
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5FT2 Sub-tomogram averaging of Lassa virus glycoprotein spike from virus- like particles at pH 5 提交 2016-01-09 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
75–237（163 aa）
片段：RECEPTOR BINDING DOMAIN, UNP RESIDUES 75-237
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
50 MM BUFFER OF SUCCINIC ACID, DIHYDROGEN PHOSPHATE AND GLYCINE (SPG)；pH 5.2；50 MM BUFFER OF SUCCINIC ACID, DIHYDROGEN PHOSPHATE AND GLYCINE (SPG)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 80, TEMPERATURE- 120, INSTRUMENT- GATAN CRYOPLUNGE 3, METHOD- BLOT FOR 3 SECONDS BEFORE PLUNGING.,
|
分辨率 16.40 Å |
| 5VK2 Structural basis for antibody-mediated neutralization of Lassa virus 提交 2017-04-20 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–259（259 aa）
片段：UNP residues 1-259
链 B
1–259（259 aa）
片段：UNP residues 1-259
链 C
1–259（259 aa）
片段：UNP residues 1-259
链 a
260–423（164 aa）
片段：UNP residues 260-423
链 b
260–423（164 aa）
片段：UNP residues 260-423
链 c
260–423（164 aa）
片段：UNP residues 260-423
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 11 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；296 K；0.1M Tris pH 8, 15-18% PEG 3350 and 0.1M-0.3M magnesium acetate
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.231 |
| 6P95 Structure of Lassa virus glycoprotein in complex with Fab 25.6A 提交 2019-06-09 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–259（259 aa）
链 B
1–259（259 aa）
链 C
1–259（259 aa）
链 a
260–433（174 aa）
链 b
260–433（174 aa）
链 c
260–433（174 aa）
|
突变：R207C, L258R, L259RG 突变：R207C, L258R, L259RG 突变：R207C, L258R, L259RG 突变：G360P, M332T, E329C 突变：G360P, M332T, E329C 突变：G360P, M332T, E329C | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；0.1 M Tris pH 8, 15-18% PEG 3350 and 0.1 M-0.3 M magnesium acetate
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.247 |
| 7PUY Structure of the membrane soluble spike complex from the Lassa virus in a C3-symmetric map 提交 2021-10-01 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–259（259 aa）
链 B
1–259（259 aa）
链 C
1–259（259 aa）
链 a
260–491（232 aa）
链 b
260–491（232 aa）
链 c
260–491（232 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 7PVD Structure of the membrane soluble spike complex from the Lassa virus in a C1-symmetric map focused on the ectodomain 提交 2021-10-02 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–259（259 aa）
链 B
1–259（259 aa）
链 C
1–259（259 aa）
链 a
260–491（232 aa）
链 b
260–491（232 aa）
链 c
260–491（232 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 7S8H Structure of Lassa virus glycoprotein bound to Fab 18.5C and Fab 36.1F 提交 2021-09-17 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 A
59–259（201 aa）
链 a
260–424（165 aa）
|
突变：G243C, Residues 256-259 mutated from RRLL to RRRR 突变：E329P, M332T, I350C | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293.15 K；0.1 M Tris, pH 8.0, 1.25 M LiCl and 15% PEG 8k
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.251 |
| 7TYV Structure of Lassa Virus glycoprotein (Josiah) bound to Fab 25.10C 提交 2022-02-14 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–259（259 aa）
链 B
1–259（259 aa）
链 C
1–259（259 aa）
链 a
260–423（164 aa）
链 b
260–423（164 aa）
链 c
260–423（164 aa）
|
突变：R207C, Residues 256-259 mutated from RRLL to RRRR 突变：R207C, Residues 256-259 mutated from RRLL to RRRR 突变：R207C, Residues 256-259 mutated from RRLL to RRRR 突变：E329P, M332T, G360C 突变：E329P, M332T, G360C 突变：E329P, M332T, G360C | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 13 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 7UOT Native Lassa glycoprotein in complex with neutralizing antibodies 8.9F and 37.2D 提交 2022-04-13 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 A
1–259（259 aa）
链 B
1–259（259 aa）
链 C
1–259（259 aa）
链 a
260–491（232 aa）
链 b
260–491（232 aa）
链 c
260–491（232 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.77 Å |
| 7UOV Native Lassa glycoprotein in complex with neutralizing antibodies 12.1F and 37.2D 提交 2022-04-14 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 A
1–259（259 aa）
链 B
1–259（259 aa）
链 C
1–259（259 aa）
链 a
260–491（232 aa）
链 b
260–491（232 aa）
链 c
260–491（232 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.75 Å |
| 8EJD Structure of lineage IV Lassa virus glycoprotein complex (strain Josiah) 提交 2022-09-16 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–259（259 aa）
链 B
1–259（259 aa）
链 C
1–259（259 aa）
链 a
260–424（165 aa）
链 b
260–424（165 aa）
链 c
260–424（165 aa）
|
突变：R207C, L258R, L259R 突变：R207C, L258R, L259R 突变：R207C, L258R, L259R 突变：E329P, G360C 突变：E329P, G360C 突变：E329P, G360C | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；TBS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s; blotting time varied between 3-7 s; blotting force of 0
|
分辨率 3.80 Å |
| 8EJH Lassa virus glycoprotein complex (Josiah) bound to 12.1F Fab 提交 2022-09-16 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–259（259 aa）
链 B
1–259（259 aa）
链 C
1–259（259 aa）
链 a
260–424（165 aa）
链 b
260–424（165 aa）
链 c
260–424（165 aa）
|
突变：R207C, L258R, L259R 突变：R207C, L258R, L259R 突变：R207C, L258R, L259R 突变：E329P, G360C 突变：E329P, G360C 突变：E329P, G360C | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 MAN alpha-D-mannopyranose × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；TBS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s; blotting time varied between 3-7 s; blotting force of 0
|
分辨率 3.71 Å |
| 8EJI Lassa virus glycoprotein complex (Josiah) bound to 19.7E Fab 提交 2022-09-16 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–259（259 aa）
链 B
1–259（259 aa）
链 C
1–259（259 aa）
链 a
260–424（165 aa）
链 b
260–424（165 aa）
链 c
260–424（165 aa）
|
突变：R207C, L258R, L259R 突变：R207C, L258R, L259R 突变：R207C, L258R, L259R 突变：E328P, G359C 突变：E328P, G359C 突变：E328P, G359C | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 14 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；TBS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s; blotting time varied between 3-7 s; blotting force of 0
|
分辨率 3.81 Å |
| 8T5C Lassa GPC Trimer in complex with Fab 8.11G and nanobody D5 提交 2023-06-13 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白数一致 |
链 A
59–257（199 aa）
链 B
59–257（199 aa）
链 C
59–257（199 aa）
链 a
260–418（159 aa）
链 b
260–418（159 aa）
链 c
260–418（159 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 23 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；PBS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.70 Å |
| 8TYC Lassa GPC (strain Josiah) bound to rabbit polyclonal base-targeting antibody Base-1 提交 2023-08-24 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–259（259 aa）
链 B
1–259（259 aa）
链 C
1–259（259 aa）
链 a
260–423（164 aa）
链 b
260–423（164 aa）
链 c
260–423（164 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8TYE Lassa GPC (strain Josiah) bound to rabbit polyclonal fusion-peptide-targeting antibody FP-1 提交 2023-08-25 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–259（259 aa）
链 B
1–259（259 aa）
链 C
1–259（259 aa）
链 a
260–424（165 aa）
链 b
260–424（165 aa）
链 c
260–424（165 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 14 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 8VCV Lineage IV Lassa virus glycoprotein (Josiah) in complex with rabbit polyclonal antibody (GPC-C epitope) 提交 2023-12-14 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–259（259 aa）
链 B
1–259（259 aa）
链 C
1–259（259 aa）
链 a
260–424（165 aa）
链 b
260–424（165 aa）
链 c
260–424（165 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 8VE8 Lineage IV Lassa virus glycoprotein (Josiah) in complex with rabbit polyclonal antibody (GP1-A epitope) 提交 2023-12-18 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–259（259 aa）
链 B
1–259（259 aa）
链 C
1–259（259 aa）
链 a
260–424（165 aa）
链 b
260–424（165 aa）
链 c
260–424（165 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 13 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 9CJ7 Lineage IV Lassa virus glycoprotein (Josiah) in complex with monoclonal antibody 8.9F 提交 2024-07-05 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–259（259 aa）
链 B
1–259（259 aa）
链 C
1–259（259 aa）
链 a
260–424（165 aa）
链 b
260–424（165 aa）
链 c
260–424（165 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；TBS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9CJ8 Lineage IV Lassa virus glycoprotein (Josiah) in complex with rabbit polyclonal antibody (LAVA01-like epitope) 提交 2024-07-05 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–259（259 aa）
链 B
1–259（259 aa）
链 C
1–259（259 aa）
链 a
260–424（165 aa）
链 b
260–424（165 aa）
链 c
260–424（165 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.74 Å |
| 9CK7 Lineage IV Lassa virus glycoprotein (Josiah) in complex with polyclonal antibody (GPC-A epitope) from rabbit 187 提交 2024-07-08 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–259（259 aa）
链 B
1–259（259 aa）
链 C
1–259（259 aa）
链 a
260–424（165 aa）
链 b
260–424（165 aa）
链 c
260–424（165 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.45 Å |
| 9CK8 Lineage IV Lassa virus glycoprotein (Josiah) in complex with polyclonal antibody (GPC-A epitope) from rabbit 189 提交 2024-07-08 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–259（259 aa）
链 B
1–259（259 aa）
链 C
1–259（259 aa）
链 a
260–424（165 aa）
链 b
260–424（165 aa）
链 c
260–424（165 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 17 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.04 Å |
| 9MHE Native tagless Lassa virus spike complex bound to ARN-75039 at pH 8.0 提交 2024-12-11 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–259（259 aa）
链 B
1–259（259 aa）
链 C
1–259（259 aa）
链 a
260–491（232 aa）
链 b
260–491（232 aa）
链 c
260–491（232 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 UNX UNKNOWN LIGAND × 2 A1BK9 (4S)-3-(4-tert-butoxyphenyl)-7-methyl-6-{4-[(propan-2-yl)oxy]phenyl}imidazo[1,2-a]pyridine × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.01 Å |
| 9MIV Native tagless Lassa virus spike complex pH 6.0 提交 2024-12-13 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–259（259 aa）
链 B
1–259（259 aa）
链 C
1–259（259 aa）
链 a
260–491（232 aa）
链 b
260–491（232 aa）
链 c
260–491（232 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 UNX UNKNOWN LIGAND × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.02 Å |
| 9MIY Focused reconstruction of the transmembrane region of the Lassa virus spike complex 提交 2024-12-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–58（58 aa）
链 B
1–58（58 aa）
链 C
1–58（58 aa）
链 a
260–491（232 aa）
链 b
260–491（232 aa）
链 c
260–491（232 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.72 Å |
| 9MJ1 Native tagless Lassa virus spike complex bound at pH 8.0 提交 2024-12-13 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–259（259 aa）
链 B
1–259（259 aa）
链 C
1–259（259 aa）
链 a
260–491（232 aa）
链 b
260–491（232 aa）
链 c
260–491（232 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 UNX UNKNOWN LIGAND × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.90 Å |
| 9MJ2 Flag-tag Lassa virus spike complex at pH 6.0 提交 2024-12-13 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
59–259（201 aa）
链 B
59–259（201 aa）
链 C
59–259（201 aa）
链 a
260–491（232 aa）
链 b
260–491（232 aa）
链 c
260–491（232 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 UNX UNKNOWN LIGAND × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.58 Å |
| 9R8U Flag-tag LASV spike acidified to pH 5.0 and re-equilibrated to pH 8.0 提交 2025-05-16 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–259（259 aa）
链 B
1–259（259 aa）
链 C
1–259（259 aa）
链 a
260–491（232 aa）
链 b
260–491（232 aa）
链 c
260–491（232 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 UNX UNKNOWN LIGAND × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.30 Å |