当前蛋白身份：P08773
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1B49 DCMP HYDROXYMETHYLASE FROM T4 (PHOSPHATE-BOUND) 提交 1999-01-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–246（246 aa）
链 C
1–246（246 aa）
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；pH 8.0
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.202 |
| 1B5D DCMP Hydroxymethylase from T4 (Intact) 提交 1999-01-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–246（246 aa）
链 B
1–246（246 aa）
|
未记录 | DCM 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；pH 8.0
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.208 |
| 1B5D DCMP Hydroxymethylase from T4 (Intact) 提交 1999-01-06 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–246（246 aa）
链 B
1–246（246 aa）
|
未记录 | DCM 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；pH 8.0
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.208 |
| 1B5E DCMP HYDROXYMETHYLASE FROM T4 提交 1999-01-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–246（246 aa）
链 B
1–246（246 aa）
|
未记录 | DCM 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；pH 8.0
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.208 |
| 1B5E DCMP HYDROXYMETHYLASE FROM T4 提交 1999-01-06 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–246（246 aa）
链 B
1–246（246 aa）
|
未记录 | DCM 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；pH 8.0
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.208 |
| 6A9A Ternary complex crystal structure of dCH with dCMP and THF 提交 2018-07-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–246（246 aa）
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突变：C148S, D179N | IOD IODIDE ION × 2 DCM 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 THG (6S)-5,6,7,8-TETRAHYDROFOLATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；Tris-HCl pH 8.0, Sodium citrate
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分辨率 1.90 Å R-free 0.187 |
| 6A9B T4 dCMP hydroxymethylase structure solved by I-SAD using a home source 提交 2018-07-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–246（246 aa）
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未记录 | IOD IODIDE ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；0.1 M Tris-HCl pH 8.5 0.96 M sodium citrate
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分辨率 2.01 Å R-free 0.192 |
| 6L18 XFEL structure of T4dCH D179N mutant complex with natively expressed dTMP 提交 2019-09-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–246（246 aa）
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突变：D179N | TMP THYMIDINE-5'-PHOSPHATE × 2 IOD IODIDE ION × 2 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
SMALL TUBES；pH 8.5；293 K；2 ul of 1.0 M Tris-HCl pH 8.5
2 ul of 1.0 M NaI
17 ul of C6H5Na3 2H2O
10 ul of 40mg/ml D179N mutant protein
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分辨率 1.90 Å R-free 0.191 |