当前蛋白身份:P08887 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1N26 Crystal Structure of the extra-cellular domains of Human Interleukin-6 Receptor alpha chain 提交 2002-10-22 Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 20–344(325 aa) 片段:IL-6R extral-cellular domains
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 SO4 SULFATE ION × 4 CYS CYSTEINE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;300 K;ammonium sulphate, PEG 3350, sodium citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 2.40 Å R-free 0.290
1P9M Crystal structure of the hexameric human IL-6/IL-6 alpha receptor/gp130 complex 提交 2003-05-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 C 115–315(201 aa) 片段:extracellular domains D2 - D3
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.5;293 K;Sodium formate, Sodium acetate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.65 Å R-free 0.334
2ARW The solution structure of the membrane proximal cytokine receptor domain of the human interleukin-6 receptor 提交 2005-08-22 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 212–336(125 aa) 片段:Third extracellular domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5;293 K;离子强度(mmCIF原始值)50mM phosphate;压力 ambient
NMR样品组成 20mM phosphatebuffer pH 5.0, 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
5FUC Biophysical and cellular characterisation of a junctional epitope antibody that locks IL-6 and gp80 together in a stable complex: implications for new therapeutic strategies 提交 2016-01-25 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 D 111–322(212 aa) 片段:RESIDUES 20-33 AND RESIDUES 111-322
突变:YES NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M MES, PH 6.5, 14% PEG20K
分辨率 2.70 Å R-free 0.287
5FUC Biophysical and cellular characterisation of a junctional epitope antibody that locks IL-6 and gp80 together in a stable complex: implications for new therapeutic strategies 提交 2016-01-25 Assembly 2 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 111–322(212 aa) 片段:RESIDUES 20-33 AND RESIDUES 111-322
突变:YES NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M MES, PH 6.5, 14% PEG20K
分辨率 2.70 Å R-free 0.287
7DC8 Crystal structure of Switch Ab Fab and hIL6R in complex with ATP 提交 2020-10-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 111–320(210 aa)
突变:C193S SO4 SULFATE ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;294 K;0.06 M Tris, 12.0 %(w/v) Polyethylene glycol 1500, 0.06 M Ammonium sulfate
分辨率 2.76 Å R-free 0.278
7DC8 Crystal structure of Switch Ab Fab and hIL6R in complex with ATP 提交 2020-10-23 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 F 111–320(210 aa)
突变:C193S SO4 SULFATE ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 7.5;294 K;0.06 M Tris, 12.0 %(w/v) Polyethylene glycol 1500, 0.06 M Ammonium sulfate
分辨率 2.76 Å R-free 0.278
8D82 Cryo-EM structure of human IL-6 signaling complex in detergent: model containing full extracellular domains 提交 2022-06-07 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 C 20–331(312 aa)
链 G 20–331(312 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 18 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.22 Å
8IOW Cryo-EM structure of the sarilumab Fab/IL-6R complex 提交 2023-03-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 D2 1–365(365 aa)
链 I 1–365(365 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8J6F Cryo-EM structure of the Tocilizumab Fab/IL-6R complex 提交 2023-04-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 B 122–131(10 aa)
链 I 1–365(365 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8QY5 Structure of interleukin 6. 提交 2023-10-25 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 C 1–468(468 aa)
链 F 1–468(468 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8QY6 Structure of interleukin 6 (gp130 P496L mutant). 提交 2023-10-25 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 C 1–468(468 aa)
链 F 1–468(468 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.16 Å