当前蛋白身份：P09132
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1JID Human SRP19 in complex with helix 6 of Human SRP RNA 提交 2001-07-02 | Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–120（120 aa）
片段：24 C-TERMINAL RESIDUES TRUNCATED
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；291 K；potassium chloride, magnesium chloride, sodium chloride, PEG 3350, isopropanol, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
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分辨率 1.80 Å R-free 0.222 |
| 1MFQ Crystal Structure Analysis of a Ternary S-Domain Complex of Human Signal Recognition Particle 提交 2002-08-13 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 B
14–120（107 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 5 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；300.5 K；14% (w/v) PEG8000, 100mM Na-cacodylate, 400mM lithium sulfate, 80mM magnesium chloride, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300.5K
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分辨率 3.10 Å R-free 0.267 |
| 2J37 MODEL OF MAMMALIAN SRP BOUND TO 80S RNCS 提交 2006-08-18 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 B
14–120（107 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 8.70 Å |
| 3KTV Crystal structure of the human SRP19/S-domain SRP RNA complex 提交 2009-11-26 | Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–120（120 aa）
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未记录 | K POTASSIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291 K；100 mM NaOAc, 0.75 M KF, 2.2 M (NH4)2SO4, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
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分辨率 3.80 Å R-free 0.329 |
| 3KTV Crystal structure of the human SRP19/S-domain SRP RNA complex 提交 2009-11-26 | Assembly 2 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric（2） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–120（120 aa）
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未记录 | K POTASSIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291 K；100 mM NaOAc, 0.75 M KF, 2.2 M (NH4)2SO4, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.329 |
| 4P3E Structure of the human SRP S domain 提交 2014-03-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–120（120 aa）
片段：UNP residues 1-120
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.2；291 K；Ammonium sulfate, Sodium malonate
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分辨率 3.50 Å R-free 0.285 |
| 5M73 Structure of the human SRP S domain with SRP72 RNA-binding domain 提交 2016-10-26 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
11–118（108 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 30 K POTASSIUM ION × 5 GOL GLYCEROL × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；17 % (w/v) PEG3350
0.1 M KF
0.1 M Tris pH 8.5
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分辨率 3.40 Å R-free 0.280 |
| 5M73 Structure of the human SRP S domain with SRP72 RNA-binding domain 提交 2016-10-26 | Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 F
11–118（108 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 15 K POTASSIUM ION × 5 GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；17 % (w/v) PEG3350
0.1 M KF
0.1 M Tris pH 8.5
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.280 |
| 7NFX Mammalian ribosome nascent chain complex with SRP and SRP receptor in early state A 提交 2021-02-08 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物一致 |
链 q
1–144（144 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
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分辨率 3.20 Å |
| 7QWQ Ternary complex of ribosome nascent chain with SRP and NAC 提交 2022-01-25 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：52-meric（52） 与全部聚合物一致 |
链 q
1–144（144 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
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分辨率 2.83 Å |