当前蛋白身份:P09547
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1KKX Solution structure of the DNA-binding domain of ADR6 提交 2001-12-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
405–506(102 aa)
片段:ARID domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 4.9;300 K;离子强度(mmCIF原始值)50mM phosphate buffer;压力 ambient
NMR样品组成
1mM ADR6 ARID domain
U-15N, U-13C,
50mM phosphate buffer at pH4.9,
90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 1KN5 SOLUTION STRUCTURE OF ARID DOMAIN OF ADR6 FROM SACCHAROMYCES CEREVISIAE 提交 2001-12-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
405–506(102 aa)
片段:ARID domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 4.9;300 K;离子强度(mmCIF原始值)50mM PHOSPHATE BUFFER;压力 ambient
NMR样品组成
1MM ADR6 ARID DOMAIN U-15N, U-13C, 50MM PHOSPHATE BUFFER PH4.9, 90% H2O, 10%D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2LI6 1H, 13C, and 15N Chemical Shift Assignments for yeast protein 提交 2011-08-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
390–505(116 aa)
片段:UNP residues 390-505
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5;293 K;离子强度(mmCIF原始值)0.1;压力 ambient
NMR样品组成
100 mM sodium chloride-1, 2 mM sodium phosphate-2, 1.5 mM EDTA-3, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 6UXV SWI/SNF Body Module 提交 2019-11-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric(15) 与蛋白数一致 |
链 B
1–1314(1314 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9;10 mM HEPES, pH 7.9, 10 mM MgCl2, 50 mM KCl, 1 mM DTT, 5% glycerol, 0.05% NP-40
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.70 Å |
| 6UXW SWI/SNF nucleosome complex with ADP-BeFx 提交 2019-11-08 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 26 PDB 声明:28-meric(28) 与全部聚合物一致 |
链 B
1–1314(1314 aa)
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未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 12 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9;10 mM HEPES, pH 7.9, 10 mM MgCl2, 50 mM KCl, 1 mM DTT, 5% glycerol, 0.05% NP-40
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.96 Å |
| 7C4J Cryo-EM structure of the yeast Swi/Snf complex in a nucleosome free state 提交 2020-05-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致 |
链 I
1–1314(1314 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.89 Å |
| 7EGM The SRM module of SWI/SNF-nucleosome complex 提交 2021-03-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致 |
链 B
251–1314(1064 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.60 Å |
| 7EGP The structure of SWI/SNF-nucleosome complex 提交 2021-03-24 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 19 PDB 声明:21-meric(21) 与全部聚合物一致 |
链 B
251–1314(1064 aa)
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未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 6.90 Å |