当前蛋白身份：P0A672
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1B1B IRON DEPENDENT REGULATOR 提交 1998-11-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–140（140 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.50
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.360 |
| 1FX7 CRYSTAL STRUCTURE OF THE IRON-DEPENDENT REGULATOR (IDER) FROM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS 提交 2000-09-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–230（230 aa）
链 B
1–230（230 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 11 CO COBALT (II) ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；2.0 M lithium sulfate 0.01 M magnesium chloride 0.1 M MES buffer ~0.1 mM 21 bp duplex DNA oligomer, pH 5.6, VAPOR
DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 20K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.272 |
| 1FX7 CRYSTAL STRUCTURE OF THE IRON-DEPENDENT REGULATOR (IDER) FROM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS 提交 2000-09-25 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–230（230 aa）
链 D
1–230（230 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 6 CO COBALT (II) ION × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；2.0 M lithium sulfate 0.01 M magnesium chloride 0.1 M MES buffer ~0.1 mM 21 bp duplex DNA oligomer, pH 5.6, VAPOR
DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 20K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.272 |
| 1FX7 CRYSTAL STRUCTURE OF THE IRON-DEPENDENT REGULATOR (IDER) FROM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS 提交 2000-09-25 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–230（230 aa）
链 B
1–230（230 aa）
链 C
1–230（230 aa）
链 D
1–230（230 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 17 CO COBALT (II) ION × 13 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；2.0 M lithium sulfate 0.01 M magnesium chloride 0.1 M MES buffer ~0.1 mM 21 bp duplex DNA oligomer, pH 5.6, VAPOR
DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 20K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.272 |
| 1FX7 CRYSTAL STRUCTURE OF THE IRON-DEPENDENT REGULATOR (IDER) FROM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS 提交 2000-09-25 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–230（230 aa）
链 B
1–230（230 aa）
链 C
1–230（230 aa）
链 D
1–230（230 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 17 CO COBALT (II) ION × 13 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；2.0 M lithium sulfate 0.01 M magnesium chloride 0.1 M MES buffer ~0.1 mM 21 bp duplex DNA oligomer, pH 5.6, VAPOR
DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 20K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.272 |
| 1FX7 CRYSTAL STRUCTURE OF THE IRON-DEPENDENT REGULATOR (IDER) FROM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS 提交 2000-09-25 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–230（230 aa）
链 B
1–230（230 aa）
链 C
1–230（230 aa）
链 D
1–230（230 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 17 CO COBALT (II) ION × 13 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；2.0 M lithium sulfate 0.01 M magnesium chloride 0.1 M MES buffer ~0.1 mM 21 bp duplex DNA oligomer, pH 5.6, VAPOR
DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 20K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.272 |
| 1U8R Crystal Structure of an IdeR-DNA Complex Reveals a Conformational Change in Activated IdeR for Base-specific Interactions 提交 2004-08-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–230（230 aa）
链 B
1–230（230 aa）
链 C
1–230（230 aa）
链 D
1–230（230 aa）
|
未记录 | CO COBALT (II) ION × 12 NA SODIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；7% w/v PEG 8000, 0.2 M calcium acetate, 0.1 M imidazole, 0.01 M cobalt chloride, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.265 |
| 1U8R Crystal Structure of an IdeR-DNA Complex Reveals a Conformational Change in Activated IdeR for Base-specific Interactions 提交 2004-08-06 | Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 G
1–230（230 aa）
链 H
1–230（230 aa）
链 I
1–230（230 aa）
链 J
1–230（230 aa）
|
未记录 | CO COBALT (II) ION × 12 NA SODIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；7% w/v PEG 8000, 0.2 M calcium acetate, 0.1 M imidazole, 0.01 M cobalt chloride, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.265 |
| 2ISY Crystal structure of the nickel-activated two-domain iron-dependent regulator (IdeR) 提交 2006-10-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NI NICKEL (II) ION × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；298 K；0.6 M Na/K phosphate pH 8.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.211 |
| 2ISZ Crystal structure of a two-domain IdeR-DNA complex crystal form I 提交 2006-10-18 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
|
未记录 | NI NICKEL (II) ION × 12 NA SODIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；28% PEG 3350, 0.2 M ammonium acetate, 0.1 M Bis-Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.239 |
| 2IT0 Crystal structure of a two-domain IdeR-DNA complex crystal form II 提交 2006-10-18 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–140（140 aa）
链 B
1–140（140 aa）
链 C
1–140（140 aa）
链 D
1–140（140 aa）
|
未记录 | NI NICKEL (II) ION × 12 ACT ACETATE ION × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；26% PEG 4000, 0.2 M sodium acetate, 0.1 M Tris HCl pH 8.5, 5% glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
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分辨率 2.60 Å R-free 0.273 |