当前蛋白身份：P0A881
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1CO0 NMR STUDY OF TRP REPRESSOR-MTR OPERATOR DNA COMPLEX 提交 1999-05-30 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–107（107 aa）
链 B
1–107（107 aa）
|
未记录 | TRP TRYPTOPHAN × 2 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.7
|
分辨率未提供 |
| 1JHG TRP REPRESSOR MUTANT V58I 提交 1996-07-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
7–107（101 aa）
|
突变：CHAIN A, V58I | PO4 PHOSPHATE ION × 2 TRP TRYPTOPHAN × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；HANGING DROP VAPOR DIFFUSION 2.0 M SODIUM PHOSPHATE, PH 5.0 600 MM AMMONIUM CHLORIDE 5 MM L-TRYPTOPHAN, vapor diffusion - hanging drop
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.172 |
| 1MI7 Crystal Structure of Domain Swapped trp Aporepressor in 30%(v/v) Isopropanol 提交 2002-08-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 R
1–107（107 aa）
|
未记录 | IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；100 mM Na HEPES, 100 mM sodium chloride, 30%(v/v) isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.288 |
| 1RCS NMR STUDY OF TRP REPRESSOR-OPERATOR DNA COMPLEX 提交 1995-05-12 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
3–106（104 aa）
链 B
3–106（104 aa）
|
未记录 | TRP TRYPTOPHAN × 2 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1TRO CRYSTAL STRUCTURE OF TRP REPRESSOR OPERATOR COMPLEX AT ATOMIC RESOLUTION 提交 1992-08-30 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
0–107（108 aa）
链 C
0–107（108 aa）
|
未记录 | TRP TRYPTOPHAN × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；VAPOR DIFFUSION
|
分辨率 1.90 Å |
| 1TRO CRYSTAL STRUCTURE OF TRP REPRESSOR OPERATOR COMPLEX AT ATOMIC RESOLUTION 提交 1992-08-30 | Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 E
0–107（108 aa）
链 G
0–107（108 aa）
|
未记录 | TRP TRYPTOPHAN × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；VAPOR DIFFUSION
|
分辨率 1.90 Å |
| 1TRR TANDEM BINDING IN CRYSTALS OF A TRP REPRESSOR/OPERATOR HALF-SITE COMPLEX 提交 1993-10-21 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–107（107 aa）
链 B
1–107（107 aa）
链 G
1–107（107 aa）
链 H
1–107（107 aa）
|
未记录 | TRP TRYPTOPHAN × 4 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.40 Å |
| 1TRR TANDEM BINDING IN CRYSTALS OF A TRP REPRESSOR/OPERATOR HALF-SITE COMPLEX 提交 1993-10-21 | Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–107（107 aa）
链 E
1–107（107 aa）
链 J
1–107（107 aa）
链 K
1–107（107 aa）
|
未记录 | TRP TRYPTOPHAN × 4 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.40 Å |
| 1WRP FLEXIBILITY OF THE DNA-BINDING DOMAINS OF TRP REPRESSOR 提交 1987-12-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 R
1–107（107 aa）
|
未记录 | TRP TRYPTOPHAN × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å |
| 1WRS NMR STUDY OF HOLO TRP REPRESSOR 提交 1995-05-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 R
3–107（105 aa）
链 S
3–107（105 aa）
|
未记录 | TRP TRYPTOPHAN × 2 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1WRT NMR STUDY OF APO TRP REPRESSOR 提交 1995-05-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 R
3–107（105 aa）
链 S
3–107（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1ZT9 E. coli trp repressor, tetragonal crystal form 提交 2005-05-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
链 B
1–107（107 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 TRP TRYPTOPHAN × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.6；294 K；2.8 M ammonium sulfate plus 50 mM sodium, potassium phosphate buffer, 5 mM L-tryptophan, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K, pH 5.60
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.219 |
| 1ZT9 E. coli trp repressor, tetragonal crystal form 提交 2005-05-26 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1–107（107 aa）
链 E
1–107（107 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 TRP TRYPTOPHAN × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.6；294 K；2.8 M ammonium sulfate plus 50 mM sodium, potassium phosphate buffer, 5 mM L-tryptophan, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K, pH 5.60
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.219 |
| 1ZT9 E. coli trp repressor, tetragonal crystal form 提交 2005-05-26 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
链 B
1–107（107 aa）
链 D
1–107（107 aa）
链 E
1–107（107 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 8 TRP TRYPTOPHAN × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.6；294 K；2.8 M ammonium sulfate plus 50 mM sodium, potassium phosphate buffer, 5 mM L-tryptophan, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K, pH 5.60
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.219 |
| 1ZT9 E. coli trp repressor, tetragonal crystal form 提交 2005-05-26 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
链 B
1–107（107 aa）
链 D
1–107（107 aa）
链 E
1–107（107 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 8 TRP TRYPTOPHAN × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.6；294 K；2.8 M ammonium sulfate plus 50 mM sodium, potassium phosphate buffer, 5 mM L-tryptophan, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K, pH 5.60
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.219 |
| 1ZT9 E. coli trp repressor, tetragonal crystal form 提交 2005-05-26 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
链 B
1–107（107 aa）
链 D
1–107（107 aa）
链 E
1–107（107 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 8 TRP TRYPTOPHAN × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.6；294 K；2.8 M ammonium sulfate plus 50 mM sodium, potassium phosphate buffer, 5 mM L-tryptophan, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K, pH 5.60
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.219 |
| 2OZ9 E. coli TRP holorepressor, orthorhombic crystal form 提交 2007-02-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 R
2–108（107 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 TRP TRYPTOPHAN × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5；298 K；crystallization conditions:
2.5 M sodium phosphate, 0.6 M ammonium chloride, 2.5 mM L-tryptophan. Prior
to data collection the crystal was equilibrated to 2.4 M ammonium sulfate, 0.4 M sodium chloride, 2.4 mM L-tryptophan, 50 mM sodium acetate., pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 1.65 Å |
| 3SSW E. coli trp aporepressor 提交 2011-07-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 N
2–108（107 aa）
链 R
2–108（107 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；294 K；Hampton Research Crystal Screen condition #6: 30% (w/v) PEG 4000, 200 mM MgCl2, 100 mM Tris HCl pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 1.67 Å R-free 0.219 |
| 3SSX E. coli trp aporeporessor L75F mutant 提交 2011-07-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 N
2–108（107 aa）
链 R
2–108（107 aa）
|
突变：L75F 突变：L75F | TAM TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；294 K；Hampton Research Crystal Screen condition #6: 30% (w/v) PEG 4000, 200 mM MgCl2, 100 mM Tris HCl pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.218 |
| 3WRP FLEXIBILITY OF THE DNA-BINDING DOMAINS OF TRP REPRESSOR 提交 1987-12-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.80 Å |
| 6EJW Tryptophan Repressor TrpR from E.coli wildtype with Indole-3-acetic acid as ligand 提交 2017-09-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–108（108 aa）
链 B
1–108（108 aa）
|
未记录 | IAC 1H-INDOL-3-YLACETIC ACID × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5
2 M Ammonium sulfate
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.243 |
| 6EJW Tryptophan Repressor TrpR from E.coli wildtype with Indole-3-acetic acid as ligand 提交 2017-09-23 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–108（108 aa）
链 D
1–108（108 aa）
|
未记录 | IAC 1H-INDOL-3-YLACETIC ACID × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5
2 M Ammonium sulfate
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.243 |
| 6EKP Tryptophan Repressor TrpR from E.coli variant T44L T81M S88Y with Indole-3-acetic acid as ligand 提交 2017-09-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–108（108 aa）
链 B
1–108（108 aa）
|
未记录 | IAC 1H-INDOL-3-YLACETIC ACID × 2 P3G 3,6,9,12,15-PENTAOXAHEPTADECANE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.05 Calcium Chloride
0.1M Bis-Tris pH 6.5
30% PEG 550 MME
|
分辨率 1.46 Å R-free 0.190 |
| 6ELB Tryptophan Repressor TrpR from E.coli variant M42F T44L T81M N87G S88Y with Indole-3-acetic acid as ligand 提交 2017-09-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–108（108 aa）
链 B
1–108（108 aa）
|
未记录 | IAC 1H-INDOL-3-YLACETIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；25% PEG 3350
0.17M KCl
3% D-(+) Trehalose dihydrate
|
分辨率 1.44 Å R-free 0.193 |
| 6ELF Tryptophan Repressor TrpR from E.coli variant M42F T44L T81I S88Y with Indole-3-acetic acid as ligand 提交 2017-09-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–108（108 aa）
链 B
1–108（108 aa）
|
未记录 | IAC 1H-INDOL-3-YLACETIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M MES pH 6.5
12 % PEG 20000
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.217 |
| 6ELG Tryptophan Repressor TrpR from E.coli variant M42F T44L T81I S88Y with Indole-3-acetonitrile 提交 2017-09-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–108（108 aa）
链 B
1–108（108 aa）
|
未记录 | 3BO 1H-indol-3-ylacetonitrile × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 M Ammonium Formate
20% PEG 3350
|
分辨率 1.38 Å R-free 0.176 |
| 6ENI Tryptophan Repressor TrpR from E.coli variant T44L S88Y with Indole-3-acetic acid as ligand 提交 2017-10-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–108（108 aa）
链 B
1–108（108 aa）
|
未记录 | IAC 1H-INDOL-3-YLACETIC ACID × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；0.1 M MMT buffer pH 4
25 % PEG 1500
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.175 |
| 6ENN Tryptophan Repressor TrpR from E.coli variant T44L T81M N87G S88Y with Indole-3-acetic acid as ligand 提交 2017-10-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–108（108 aa）
链 B
1–108（108 aa）
|
未记录 | IAC 1H-INDOL-3-YLACETIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；0.1 M MMT buffer pH 5
25 % PEG 1500
|
分辨率 1.17 Å R-free 0.180 |
| 6F7F Tryptophan Repressor TrpR from E.coli with 3-Indolepropionic acid 提交 2017-12-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
4–106（103 aa）
链 B
4–106（103 aa）
|
未记录 | IOP INDOLYLPROPIONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 M Calcium Chloride
0.1 M HEPES pH7.5
30% PEG 4000
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.229 |
| 6F7F Tryptophan Repressor TrpR from E.coli with 3-Indolepropionic acid 提交 2017-12-08 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
4–106（103 aa）
链 D
4–106（103 aa）
|
未记录 | IOP INDOLYLPROPIONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 M Calcium Chloride
0.1 M HEPES pH7.5
30% PEG 4000
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.229 |
| 6F7G Tryptophan Repressor TrpR from E.coli with 5-Methyltryptamine 提交 2017-12-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
4–106（103 aa）
链 C
4–106（103 aa）
|
未记录 | CVW 2-(5-methyl-1~{H}-indol-3-yl)ethanamine × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 Sodium Chloride
0.1 M HEPES pH7.5
25% PEG 3350
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.226 |
| 6F9K Tryptophan Repressor TrpR from E.coli with 5-methyl-L-tryptophan as ligand 提交 2017-12-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
|
未记录 | D0Q 5-methyl-L-tryptophan × 8 SO4 SULFATE ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；0.1M Citric acid pH3.5, 2.4M Ammonium sulfate, pH4.0
cryo: +25% glycerol
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.206 |
| 6FAL Tryptophan Repressor TrpR from E.coli with 3-Indolepropionic acid as ligand 提交 2017-12-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–108（107 aa）
链 B
2–108（107 aa）
|
未记录 | IOP INDOLYLPROPIONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.2M MgCl2
0.1M Tris HCl, pH8.5
30% PEG 4000
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.179 |
| 6ST6 Crystal Structure of Domain Swapped Trp Repressor V58I Variant 提交 2019-09-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–105（105 aa）
|
突变：V58I | IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；100 mM Na HEPES, 100 mM sodium chloride, 27.5-35%(v/v) isopropanol, pH 7.5
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.311 |
| 6ST7 Crystal Structure of Domain Swapped Trp Repressor V58I Variant with bound L-trp 提交 2019-09-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–105（105 aa）
|
突变：V58I | TRP TRYPTOPHAN × 2 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；100 mM Na HEPES, 100 mM sodium chloride, 27.5-35%(v/v) isopropanol, pH 7.5
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.287 |