当前蛋白身份:P0ABP8 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1A69 PURINE NUCLEOSIDE PHOSPHORYLASE IN COMPLEX WITH FORMYCIN B AND SULPHATE (PHOSPHATE) 提交 1998-03-08 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–238(238 aa)
链 B 1–238(238 aa)
链 C 1–238(238 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 6 FMB FORMYCIN B × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.3;28-35% AMMONIUM SULPHATE, 50 MM CITRATE BUFFER, PH 5.2-5.4, pH 5.3
分辨率 2.10 Å
1ECP PURINE NUCLEOSIDE PHOSPHORYLASE 提交 1995-07-13 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–238(238 aa)
链 B 1–238(238 aa)
链 C 1–238(238 aa)
链 D 1–238(238 aa)
链 E 1–238(238 aa)
链 F 1–238(238 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.00 Å R-free 0.290
1K9S PURINE NUCLEOSIDE PHOSPHORYLASE FROM E. COLI IN COMPLEX WITH FORMYCIN A DERIVATIVE AND PHOSPHATE 提交 2001-10-30 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–237(237 aa)
链 B 1–237(237 aa)
链 C 1–237(237 aa)
链 D 1–237(237 aa)
链 E 1–237(237 aa)
链 F 1–237(237 aa)
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 6 FM2 2-(7-AMINO-6-METHYL-3H-PYRAZOLO[4,3-D]PYRIMIDIN-3-YL)-5-HYDROXYMETHYL-TETRAHYDRO-FURAN-3,4-DIOL × 3 FM1 2-HYDROXYMETHYL-5-(7-METHYLAMINO-3H-PYRAZOLO[4,3-D]PYRIMIDIN-3-YL)-TETRAHYDRO-FURAN-3,4-DIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;295 K;28-35% ammonium sulphate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.00 Å R-free 0.184
1OTX Purine Nucleoside Phosphorylase M64V mutant 提交 2003-03-23 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–238(238 aa)
链 B 1–238(238 aa)
链 C 1–238(238 aa)
突变:M64V 突变:M64V 突变:M64V PO4 PHOSPHATE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.4;295 K;50mM sodium citrate, 30%ammonium sulfate, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.70 Å R-free 0.247
1OTY Native PNP +ALLO 提交 2003-03-23 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–238(238 aa)
链 B 1–238(238 aa)
链 C 1–238(238 aa)
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 6 6MP 6-METHYLPURINE × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.4;295 K;50mM sodium citrate, 30% ammonium sulfate, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.50 Å R-free 0.236
1OU4 Native PNP +Talo 提交 2003-03-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–238(238 aa)
链 B 1–238(238 aa)
链 C 1–238(238 aa)
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 6 6MP 6-METHYLPURINE × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.4;295 K;50mM sodium Citrate, 30% ammonium sulfate, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.50 Å R-free 0.244
1OUM M64V PNP +Talo 提交 2003-03-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–238(238 aa)
链 B 1–238(238 aa)
链 C 1–238(238 aa)
突变:M64V 突变:M64V 突变:M64V TAL 9-(6-DEOXY-ALPHA-L-TALOFURANOSYL)-6-METHYLPURINE × 6 PO4 PHOSPHATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.4;295 K;50mM sodium citrate, 30% ammonium sulfate, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.40 Å R-free 0.260
1OV6 M64V PNP + ALLO 提交 2003-03-25 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–238(238 aa) 片段:Purine Nuleoside Phosphorylase
链 B 1–238(238 aa) 片段:Purine Nuleoside Phosphorylase
链 C 1–238(238 aa) 片段:Purine Nuleoside Phosphorylase
突变:M64V 突变:M64V 突变:M64V PO4 PHOSPHATE ION × 6 DBM 9-(6-DEOXY-BETA-D-ALLOFURANOSYL)-6-METHYLPURINE × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.4;295 K;50mM sodium citrate, 30% ammonium sulfate, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.40 Å R-free 0.258
1OVG M64V PNP +MePdr 提交 2003-03-26 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–238(238 aa)
链 B 1–238(238 aa)
链 C 1–238(238 aa)
突变:M64V 突变:M64V 突变:M64V PO4 PHOSPHATE ION × 6 MDR 9-(2-DEOXY-BETA-D-RIBOFURANOSYL)-6-METHYLPURINE × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.4;295 K;50mM sodium citrate, 30% ammonium sulfate , pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.20 Å R-free 0.259
3UT6 Crystal structure of E. Coli PNP complexed with PO4 and formycin A 提交 2011-11-25 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 2–238(237 aa)
链 B 2–238(237 aa)
链 C 2–238(237 aa)
未记录 FMC (1S)-1-(7-amino-1H-pyrazolo[4,3-d]pyrimidin-3-yl)-1,4-anhydro-D-ribitol × 6 PO4 PHOSPHATE ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 hanging drop;pH 5.2;291 K;50mM citrate buffer, 35% ammonium phosphate (w/v), pH 5.2, hanging drop, temperature 291K
分辨率 1.90 Å R-free 0.187
4TTI Crystal structure of double mutant E. Coli purine nucleoside phosphorylase with 4 FMC molecules 提交 2014-06-21 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:Hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 2–238(237 aa)
链 B 2–238(237 aa)
链 C 2–238(237 aa)
链 D 2–238(237 aa)
链 E 2–238(237 aa)
链 F 2–238(237 aa)
未记录 FMC (1S)-1-(7-amino-1H-pyrazolo[4,3-d]pyrimidin-3-yl)-1,4-anhydro-D-ribitol × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 6 SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.2;291 K;50 mM citric buffer, 34 % ammonium sulphate
分辨率 1.89 Å R-free 0.210
4TTJ Crystal structure of double mutant E. Coli purine nucleoside phosphorylase with 6 FMC molecules 提交 2014-06-21 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:Hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 2–238(237 aa)
链 B 2–238(237 aa)
链 D 2–238(237 aa)
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 6 FMC (1S)-1-(7-amino-1H-pyrazolo[4,3-d]pyrimidin-3-yl)-1,4-anhydro-D-ribitol × 6 SO4 SULFATE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.2;291 K;50 mM citric buffer, 32 % ammonium sulphate
分辨率 1.87 Å R-free 0.194
5IU6 Crystal structure of E.coli purine nucleoside phosphorylase with 7-deazahypoxanthine 提交 2016-03-17 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 2–238(237 aa)
链 B 2–238(237 aa)
链 C 2–238(237 aa)
未记录 7HX 7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-ol × 6 SO4 SULFATE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIQUID DIFFUSION;294 K;AMMONIUM SULPHATE
分辨率 2.51 Å R-free 0.200
6XZ2 Crystal structure of E. Coli purine nucleoside phosphorylase mutant Y160W with SO4 and Formycin A 提交 2020-01-31 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 2–238(237 aa)
链 B 2–238(237 aa)
链 C 2–238(237 aa)
突变:Y160W 突变:Y160W 突变:Y160W SO4 SULFATE ION × 6 FMC (1S)-1-(7-amino-1H-pyrazolo[4,3-d]pyrimidin-3-yl)-1,4-anhydro-D-ribitol × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.2;291 K;50 mM citrate buffer pH 5.2, 14 % ammonium sulphate (w/v)
分辨率 1.65 Å R-free 0.192
6XZ2 Crystal structure of E. Coli purine nucleoside phosphorylase mutant Y160W with SO4 and Formycin A 提交 2020-01-31 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 2–238(237 aa)
链 B 2–238(237 aa)
链 C 2–238(237 aa)
突变:Y160W 突变:Y160W 突变:Y160W SO4 SULFATE ION × 3 FMC (1S)-1-(7-amino-1H-pyrazolo[4,3-d]pyrimidin-3-yl)-1,4-anhydro-D-ribitol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.2;291 K;50 mM citrate buffer pH 5.2, 14 % ammonium sulphate (w/v)
分辨率 1.65 Å R-free 0.192
9FPE Wild type Purine Nucleoside Phosphorylase from E.coli in complex with N2,3-etheno-2-aminopurine 提交 2024-06-13 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–239(239 aa)
链 B 1–239(239 aa)
链 C 1–239(239 aa)
未记录 GOL GLYCEROL × 6 A1IEC N,2,3-etheno-2-aminopurine × 6 PO4 PHOSPHATE ION × 6 SO4 SULFATE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.2;291 K;Citrate buffer pH 5.2, amonium sulphate 15% w/v
分辨率 1.35 Å R-free 0.213
9FXE D204N mutant of Purine Nucleoside Phosphorylase from E.coli in complex with N2,3-etheno-2-aminopurine 提交 2024-07-01 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–239(239 aa)
链 B 1–239(239 aa)
链 C 1–239(239 aa)
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 6 A1IEC N,2,3-etheno-2-aminopurine × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.2;291 K;Citrate buffer pH 5.2, amonium sulphate 24% w/v
分辨率 2.12 Å R-free 0.233