当前蛋白身份:P0AG99 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
3J45 Structure of a non-translocating SecY protein channel with the 70S ribosome 提交 2013-06-18 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:undecameric(11) 与全部聚合物一致
链 G 9–73(65 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES-KOH, 100 mM KOAc, 10 mM Mg(OAc)2, 0.05% DDM;pH 7.5;50 mM HEPES-KOH, 100 mM KOAc, 10 mM Mg(OAc)2, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 90 K;冷冻剂 ETHANE;Blot 1 second before plunging into liquid ethane (HOMEMADE PLUNGER).
分辨率 9.50 Å
3J46 Structure of the SecY protein translocation channel in action 提交 2013-06-18 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:tetradecameric(14) 与全部聚合物一致
链 G 9–73(65 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM Tris-acetate, 10 mM Mg(OAc)2, 80 mM KOAc, 0.06% DDM;pH 7.2;50 mM Tris-acetate, 10 mM Mg(OAc)2, 80 mM KOAc, 0.06% DDM
cryo-EM玻璃化条件 77 K;冷冻剂 ETHANE;Blot 1-2 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 10.10 Å
5MG3 EM fitted model of bacterial holo-translocon 提交 2016-11-20 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 G 1–110(110 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 14.00 Å
5NCO Quaternary complex between SRP, SR, and SecYEG bound to the translating ribosome 提交 2017-03-06 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 36 PDB 声明:40-meric(40) 与全部聚合物一致
链 j 1–71(71 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
9RBF Structure of a stalled E. coli 70S RNC-NuoK-86 in complex with the membrane protein insertase SecYEG-YidC 提交 2025-05-22 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 54 PDB 声明:61-meric(61) 与全部聚合物一致
链 8 1–110(110 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.44 Å