当前蛋白身份：P0AGA2
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3J45 Structure of a non-translocating SecY protein channel with the 70S ribosome 提交 2013-06-18 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：undecameric（11） 与全部聚合物一致 |
链 y
6–440（435 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
50 mM HEPES-KOH, 100 mM KOAc, 10 mM Mg(OAc)2, 0.05% DDM；pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, 100 mM KOAc, 10 mM Mg(OAc)2, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件
90 K；冷冻剂 ETHANE；Blot 1 second before plunging into liquid ethane (HOMEMADE PLUNGER).
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分辨率 9.50 Å |
| 3J46 Structure of the SecY protein translocation channel in action 提交 2013-06-18 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：tetradecameric（14） 与全部聚合物一致 |
链 y
6–440（435 aa）
|
突变：S68C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
50 mM Tris-acetate, 10 mM Mg(OAc)2, 80 mM KOAc, 0.06% DDM；pH 7.2；50 mM Tris-acetate, 10 mM Mg(OAc)2, 80 mM KOAc, 0.06% DDM
cryo-EM玻璃化条件
77 K；冷冻剂 ETHANE；Blot 1-2 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
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分辨率 10.10 Å |
| 5GAE RNC in complex with a translocating SecYEG 提交 2015-11-25 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物一致 |
链 g
1–443（443 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 323 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.33 Å |
| 5MG3 EM fitted model of bacterial holo-translocon 提交 2016-11-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 Y
1–443（443 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 14.00 Å |
| 5NCO Quaternary complex between SRP, SR, and SecYEG bound to the translating ribosome 提交 2017-03-06 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：40-meric（40） 与全部聚合物一致 |
链 g
14–429（416 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.80 Å |
| 6R7L Ribosome-bound SecYEG translocon in a nanodisc 提交 2019-03-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 Y
1–443（443 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 6.00 Å |
| 9RBF Structure of a stalled E. coli 70S RNC-NuoK-86 in complex with the membrane protein insertase SecYEG-YidC 提交 2025-05-22 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：61-meric（61） 与全部聚合物一致 |
链 6
1–443（443 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.44 Å |