当前蛋白身份:P0C0V0 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1KY9 Crystal Structure of DegP (HtrA) 提交 2002-02-04 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 27–474(448 aa)
突变:S210A 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;291 K;Isopropanol, PEG 2000 MME, Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 2.80 Å R-free 0.275
1KY9 Crystal Structure of DegP (HtrA) 提交 2002-02-04 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 B 27–474(448 aa)
突变:S210A 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;291 K;Isopropanol, PEG 2000 MME, Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 2.80 Å R-free 0.275
2ZLE Cryo-EM structure of DegP12/OMP 提交 2008-04-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:tridecameric(13) 与蛋白数一致
链 A 27–474(448 aa)
链 B 27–474(448 aa)
链 C 27–474(448 aa)
链 E 27–474(448 aa)
链 F 27–474(448 aa)
链 G 27–474(448 aa)
链 H 27–474(448 aa)
链 I 27–474(448 aa)
链 J 27–474(448 aa)
链 K 27–474(448 aa)
链 L 27–474(448 aa)
链 M 27–474(448 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Embedded in vitreous ice using C-flat holey carbon grids (CF-2/2-4C-100, Protochip) and a Vitrobot (FEI) at 20 temperature and 100% relative humidity
分辨率 28.00 Å
3CS0 Crystal structure of DegP24 提交 2008-04-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 48 PDB 声明:48-meric(48) 与蛋白数一致
链 A 27–474(448 aa)
突变:S210A 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 8.5;292 K;PEG 550 MME, NaCl, pH 8.5, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 3.00 Å R-free 0.274
3MH4 HtrA proteases are activated by a conserved mechanism that can be triggered by distinct molecular cues 提交 2010-04-07 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 27–474(448 aa)
突变:S210A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 8.5;293 K;12% Isopropanol, 0.1M Tris, 12% PEG 2000 MME, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 3.10 Å R-free 0.309
3MH4 HtrA proteases are activated by a conserved mechanism that can be triggered by distinct molecular cues 提交 2010-04-07 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 B 27–474(448 aa)
突变:S210A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 8.5;293 K;12% Isopropanol, 0.1M Tris, 12% PEG 2000 MME, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 3.10 Å R-free 0.309
3MH5 HtrA proteases are activated by a conserved mechanism that can be triggered by distinct molecular cues 提交 2010-04-07 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 27–474(448 aa)
未记录 DFP DIISOPROPYL PHOSPHONATE × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 8.5;293 K;12% Isopropanol, 0.1M Tris, 12% PEG 2000 MME, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 3.00 Å R-free 0.309
3MH5 HtrA proteases are activated by a conserved mechanism that can be triggered by distinct molecular cues 提交 2010-04-07 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 B 27–474(448 aa)
未记录 DFP DIISOPROPYL PHOSPHONATE × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 8.5;293 K;12% Isopropanol, 0.1M Tris, 12% PEG 2000 MME, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 3.00 Å R-free 0.309
3MH6 HtrA proteases are activated by a conserved mechanism that can be triggered by distinct molecular cues 提交 2010-04-07 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 24 PDB 声明:24-meric(24) 与蛋白数一致
链 A 27–474(448 aa)
未记录 DFP DIISOPROPYL PHOSPHONATE × 24 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 8.5;293 K;12% Isopropanol, 0.1M Tris, 12% PEG 2000 MME, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 3.60 Å R-free 0.309
3MH7 HtrA proteases are activated by a conserved mechanism that can be triggered by distinct molecular cues 提交 2010-04-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 72 PDB 声明:72-meric(72) 与蛋白数一致
链 A 27–474(448 aa)
突变:S210A 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 8.5;292 K;PEG 550 MME, NaCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 292K
分辨率 2.96 Å R-free 0.249
3OTP Crystal structure of the DegP dodecamer with a model substrate 提交 2010-09-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 24 PDB 声明:24-meric(24) 与蛋白数一致
链 A 27–474(448 aa) 片段:UNP residues 27-474
链 B 27–474(448 aa) 片段:UNP residues 27-474
链 C 27–474(448 aa) 片段:UNP residues 27-474
链 D 27–474(448 aa) 片段:UNP residues 27-474
链 E 27–474(448 aa) 片段:UNP residues 27-474
链 F 27–474(448 aa) 片段:UNP residues 27-474
突变:S210A 突变:S210A 突变:S210A 突变:S210A 突变:S210A 突变:S210A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 3.6;291 K;65 mM citric acid, 35 mM Bis-Tris propane, 8% PEG3350, pH 3.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 18K, temperature 291K
分辨率 3.76 Å R-free 0.251
3OU0 re-refined 3CS0 提交 2010-09-14 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 24 PDB 声明:24-meric(24) 与蛋白数一致
链 A 27–474(448 aa) 片段:DegP, UNP residues 27-474
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.00 Å R-free 0.229
4A8D DegP dodecamer with bound OMP 提交 2011-11-20 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:tridecameric(13) 与蛋白数一致
链 A 27–474(448 aa) 片段:DEGP
链 B 27–474(448 aa) 片段:DEGP
链 C 27–474(448 aa) 片段:DEGP
链 D 27–474(448 aa) 片段:DEGP
链 E 27–474(448 aa) 片段:DEGP
链 F 27–474(448 aa) 片段:DEGP
链 G 27–474(448 aa) 片段:DEGP
链 H 27–474(448 aa) 片段:DEGP
链 I 27–474(448 aa) 片段:DEGP
链 J 27–474(448 aa) 片段:DEGP
链 K 27–474(448 aa) 片段:DEGP
链 L 27–474(448 aa) 片段:DEGP
突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 突变:YES 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 300MM NACL, 50MM HEPES- NAOH;pH 8;300MM NACL, 50MM HEPES- NAOH
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;EMBEDDED IN VITREOUS ICE USING C-FLAT HOLEY CARBON GRIDS AND A VITROBOT AT 20C.
分辨率 28.00 Å
6JJK Crystal structure of the DegP dodecamer with a modulator 提交 2019-02-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 36 PDB 声明:36-meric(36) 与蛋白数一致
链 A 35–474(440 aa)
链 B 35–474(440 aa)
链 C 35–474(440 aa)
链 D 35–474(440 aa)
链 E 35–474(440 aa)
链 F 35–474(440 aa)
突变:S210A 突变:S210A 突变:S210A 突变:S210A 突变:S210A 突变:S210A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;10% PEG3350 and 0.1 M tacsimate pH 3.4
分辨率 3.60 Å R-free 0.265
6JJL Crystal structure of the DegP dodecamer with a modulator 提交 2019-02-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 36 PDB 声明:36-meric(36) 与蛋白数一致
链 A 35–474(440 aa)
链 B 35–474(440 aa)
链 C 35–474(440 aa)
链 D 35–474(440 aa)
链 E 35–474(440 aa)
链 F 35–474(440 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;11% PEG3350, 0.1 M tacsimate pH 3.5
分辨率 4.20 Å R-free 0.326
6JJO Crystal structure of the DegP dodecamer with a modulator 提交 2019-02-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 36 PDB 声明:36-meric(36) 与蛋白数一致
链 A 27–474(448 aa)
链 B 27–474(448 aa)
链 C 27–474(448 aa)
链 D 27–474(448 aa)
链 E 27–474(448 aa)
链 F 27–474(448 aa)
突变:S210A 突变:S210A 突变:S210A 突变:S210A 突变:S210A 突变:S210A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;295 K;11% PEG3350 and 0.1 M tacsimate pH 3.5
分辨率 4.16 Å R-free 0.278
8F0A Client-bound structure of a DegP trimer within a 12mer cage 提交 2022-11-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致
链 A 38–385(348 aa) 片段:protease and PDZ1 domains (UNP residues 38-385)
链 B 38–385(348 aa) 片段:protease and PDZ1 domains (UNP residues 38-385)
链 C 38–385(348 aa) 片段:protease and PDZ1 domains (UNP residues 38-385)
链 D 400–474(75 aa) 片段:PDZ2 domain (UNP residues 400-474)
链 E 400–474(75 aa) 片段:PDZ2 domain (UNP residues 400-474)
链 F 400–474(75 aa) 片段:PDZ2 domain (UNP residues 400-474)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.60 Å
8F0U Structure of a 12mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 36 PDB 声明:36-meric(36) 与蛋白数一致
链 A 38–385(348 aa) 片段:protease and PDZ1 domains (UNP residues 38-385)
链 D 400–474(75 aa) 片段:PDZ2 domain (UNP residues 400-474)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
8F0U Structure of a 12mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-04 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 38–385(348 aa) 片段:protease and PDZ1 domains (UNP residues 38-385)
链 D 400–474(75 aa) 片段:PDZ2 domain (UNP residues 400-474)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
8F0U Structure of a 12mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-04 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 38–385(348 aa) 片段:protease and PDZ1 domains (UNP residues 38-385)
链 D 400–474(75 aa) 片段:PDZ2 domain (UNP residues 400-474)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
8F1T Structure of an 18mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-06 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 54 PDB 声明:54-meric(54) 与蛋白数一致
链 A 38–385(348 aa) 片段:protease and PDZ1 domains (UNP residues 38-385)
链 B 38–385(348 aa) 片段:protease and PDZ1 domains (UNP residues 38-385)
链 C 38–385(348 aa) 片段:protease and PDZ1 domains (UNP residues 38-385)
链 D 400–474(75 aa) 片段:PDZ2 domain (UNP residues 400-474)
链 E 400–474(75 aa) 片段:PDZ2 domain (UNP residues 400-474)
链 F 400–474(75 aa) 片段:PDZ2 domain (UNP residues 400-474)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 12.10 Å
8F1T Structure of an 18mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-06 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致
链 A 38–385(348 aa) 片段:protease and PDZ1 domains (UNP residues 38-385)
链 B 38–385(348 aa) 片段:protease and PDZ1 domains (UNP residues 38-385)
链 C 38–385(348 aa) 片段:protease and PDZ1 domains (UNP residues 38-385)
链 D 400–474(75 aa) 片段:PDZ2 domain (UNP residues 400-474)
链 E 400–474(75 aa) 片段:PDZ2 domain (UNP residues 400-474)
链 F 400–474(75 aa) 片段:PDZ2 domain (UNP residues 400-474)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 12.10 Å
8F1T Structure of an 18mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-06 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致
链 A 38–385(348 aa) 片段:protease and PDZ1 domains (UNP residues 38-385)
链 B 38–385(348 aa) 片段:protease and PDZ1 domains (UNP residues 38-385)
链 C 38–385(348 aa) 片段:protease and PDZ1 domains (UNP residues 38-385)
链 D 400–474(75 aa) 片段:PDZ2 domain (UNP residues 400-474)
链 E 400–474(75 aa) 片段:PDZ2 domain (UNP residues 400-474)
链 F 400–474(75 aa) 片段:PDZ2 domain (UNP residues 400-474)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 12.10 Å
8F1U Structure of a 24mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-06 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 72 PDB 声明:72-meric(72) 与蛋白数一致
链 A 38–385(348 aa) 片段:protease and PDZ1 domains (UNP residues 38-385)
链 B 38–385(348 aa) 片段:protease and PDZ1 domains (UNP residues 38-385)
链 C 38–385(348 aa) 片段:protease and PDZ1 domains (UNP residues 38-385)
链 D 400–474(75 aa) 片段:PDZ2 domain (UNP residues 400-474)
链 E 400–474(75 aa) 片段:PDZ2 domain (UNP residues 400-474)
链 F 400–474(75 aa) 片段:PDZ2 domain (UNP residues 400-474)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 13.80 Å
8F1U Structure of a 24mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-06 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致
链 A 38–385(348 aa) 片段:protease and PDZ1 domains (UNP residues 38-385)
链 B 38–385(348 aa) 片段:protease and PDZ1 domains (UNP residues 38-385)
链 C 38–385(348 aa) 片段:protease and PDZ1 domains (UNP residues 38-385)
链 D 400–474(75 aa) 片段:PDZ2 domain (UNP residues 400-474)
链 E 400–474(75 aa) 片段:PDZ2 domain (UNP residues 400-474)
链 F 400–474(75 aa) 片段:PDZ2 domain (UNP residues 400-474)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 13.80 Å
8F1U Structure of a 24mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-06 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致
链 A 38–385(348 aa) 片段:protease and PDZ1 domains (UNP residues 38-385)
链 B 38–385(348 aa) 片段:protease and PDZ1 domains (UNP residues 38-385)
链 C 38–385(348 aa) 片段:protease and PDZ1 domains (UNP residues 38-385)
链 D 400–474(75 aa) 片段:PDZ2 domain (UNP residues 400-474)
链 E 400–474(75 aa) 片段:PDZ2 domain (UNP residues 400-474)
链 F 400–474(75 aa) 片段:PDZ2 domain (UNP residues 400-474)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 13.80 Å
8F21 Structure of a 30mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-06 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 90 PDB 声明:90-meric(90) 与蛋白数一致
链 A 38–385(348 aa) 片段:protease and PDZ1 domains (UNP residues 38-385)
链 B 38–385(348 aa) 片段:protease and PDZ1 domains (UNP residues 38-385)
链 C 38–385(348 aa) 片段:protease and PDZ1 domains (UNP residues 38-385)
链 D 400–474(75 aa) 片段:PDZ2 domain (UNP residues 400-474)
链 E 400–474(75 aa) 片段:PDZ2 domain (UNP residues 400-474)
链 F 400–474(75 aa) 片段:PDZ2 domain (UNP residues 400-474)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 14.10 Å
8F21 Structure of a 30mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-06 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致
链 A 38–385(348 aa) 片段:protease and PDZ1 domains (UNP residues 38-385)
链 B 38–385(348 aa) 片段:protease and PDZ1 domains (UNP residues 38-385)
链 C 38–385(348 aa) 片段:protease and PDZ1 domains (UNP residues 38-385)
链 D 400–474(75 aa) 片段:PDZ2 domain (UNP residues 400-474)
链 E 400–474(75 aa) 片段:PDZ2 domain (UNP residues 400-474)
链 F 400–474(75 aa) 片段:PDZ2 domain (UNP residues 400-474)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 14.10 Å
8F21 Structure of a 30mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-06 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致
链 A 38–385(348 aa) 片段:protease and PDZ1 domains (UNP residues 38-385)
链 B 38–385(348 aa) 片段:protease and PDZ1 domains (UNP residues 38-385)
链 C 38–385(348 aa) 片段:protease and PDZ1 domains (UNP residues 38-385)
链 D 400–474(75 aa) 片段:PDZ2 domain (UNP residues 400-474)
链 E 400–474(75 aa) 片段:PDZ2 domain (UNP residues 400-474)
链 F 400–474(75 aa) 片段:PDZ2 domain (UNP residues 400-474)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 14.10 Å
8F26 Structure of a 60mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 180 PDB 声明:180-meric(180) 与蛋白数一致
链 A 38–385(348 aa) 片段:protease and PDZ1 domains (UNP residues 38-385)
链 D 400–474(75 aa) 片段:PDZ2 domain (UNP residues 400-474)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 9.70 Å
8F26 Structure of a 60mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-07 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 38–385(348 aa) 片段:protease and PDZ1 domains (UNP residues 38-385)
链 D 400–474(75 aa) 片段:PDZ2 domain (UNP residues 400-474)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 9.70 Å
8F26 Structure of a 60mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-07 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric(15) 与蛋白数一致
链 A 38–385(348 aa) 片段:protease and PDZ1 domains (UNP residues 38-385)
链 D 400–474(75 aa) 片段:PDZ2 domain (UNP residues 400-474)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 9.70 Å
8F26 Structure of a 60mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-07 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric(18) 与蛋白数一致
链 A 38–385(348 aa) 片段:protease and PDZ1 domains (UNP residues 38-385)
链 D 400–474(75 aa) 片段:PDZ2 domain (UNP residues 400-474)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 9.70 Å
8F26 Structure of a 60mer DegP cage bound to the client protein hTRF1 提交 2022-11-07 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 38–385(348 aa) 片段:protease and PDZ1 domains (UNP residues 38-385)
链 D 400–474(75 aa) 片段:PDZ2 domain (UNP residues 400-474)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 9.70 Å