当前蛋白身份:P0CG53 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1E0Q Mutant Peptide from the first N-terminal 17 amino-acid of Ubiquitin 提交 2000-04-05 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–17(17 aa) 片段:RESIDUES 1-17
突变:YES 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 3.8;275 K
NMR样品组成 10% WATER/90% D2O AND 90% WATER/10% D2O
分辨率未提供
2XBB Nedd4 HECT:Ub complex 提交 2010-04-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 1–76(76 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5;100 MM NA-HEPES, PH 7.5, 10% PEG 2000 MME, 5 MM TCEP.
分辨率 2.68 Å R-free 0.249
2XBB Nedd4 HECT:Ub complex 提交 2010-04-08 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 1–76(76 aa)
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5;100 MM NA-HEPES, PH 7.5, 10% PEG 2000 MME, 5 MM TCEP.
分辨率 2.68 Å R-free 0.249
4BBN NEDD4 HECT-Ub:Ub complex 提交 2012-09-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 1–76(76 aa) 片段:RESIDUES 1-76
链 F 229–304(76 aa) 片段:RESIDUES 229-304
突变:YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6;2.5 SODIUM MALONATE, PH 6.0
分辨率 2.51 Å R-free 0.224
5TR4 Structure of Ubiquitin activating enzyme (Uba1) in complex with ubiquitin and TAK-243 提交 2016-10-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 1–76(76 aa)
未记录 61T [(1~{R},2~{R},3~{S},4~{R})-2,3-bis(oxidanyl)-4-[[2-[3-(trifluoromethylsulfanyl)phenyl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-7-yl]amino]cyclopentyl]methyl sulfamate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;298 K;70 mM Na malonate pH 6.0, 70 mM malic acid, 70 mM Na citrate, 10-15% peg-3350
分辨率 2.20 Å R-free 0.256
5TR4 Structure of Ubiquitin activating enzyme (Uba1) in complex with ubiquitin and TAK-243 提交 2016-10-25 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 1–76(76 aa)
未记录 61T [(1~{R},2~{R},3~{S},4~{R})-2,3-bis(oxidanyl)-4-[[2-[3-(trifluoromethylsulfanyl)phenyl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-7-yl]amino]cyclopentyl]methyl sulfamate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;298 K;70 mM Na malonate pH 6.0, 70 mM malic acid, 70 mM Na citrate, 10-15% peg-3350
分辨率 2.20 Å R-free 0.256