当前蛋白身份:P0DJM0 重新检索
本组结构的主要差异维度
配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
8H62 Crystal structure of Internalin A from Listeria monocytogenes with human E-cadherin EC12 提交 2022-10-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 36–496(461 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 4 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;0.2 M Ammonium acetate 45% MPD
分辨率 1.91 Å R-free 0.210
8H63 Crystal structure of Internalin A from Listeria monocytogenes with nanobody VHH10 bound 提交 2022-10-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 36–496(461 aa)
未记录 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;0.085 M HEPES sodium pH 7.0; 8.5% Isopropanol; 20% PEG 4,000
分辨率 1.53 Å R-free 0.190
8H64 Crystal structure of Internalin A from Listeria monocytogenes with nanobody VHH24 bound 提交 2022-10-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 36–496(461 aa)
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;0.2 M Amonium citrate tribasic pH 7.0; 14% PEG 4,000
分辨率 2.35 Å R-free 0.227
8H64 Crystal structure of Internalin A from Listeria monocytogenes with nanobody VHH24 bound 提交 2022-10-15 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 36–496(461 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;0.2 M Amonium citrate tribasic pH 7.0; 14% PEG 4,000
分辨率 2.35 Å R-free 0.227
8H64 Crystal structure of Internalin A from Listeria monocytogenes with nanobody VHH24 bound 提交 2022-10-15 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 E 36–496(461 aa)
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;0.2 M Amonium citrate tribasic pH 7.0; 14% PEG 4,000
分辨率 2.35 Å R-free 0.227
8H64 Crystal structure of Internalin A from Listeria monocytogenes with nanobody VHH24 bound 提交 2022-10-15 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 G 36–496(461 aa)
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;0.2 M Amonium citrate tribasic pH 7.0; 14% PEG 4,000
分辨率 2.35 Å R-free 0.227