当前蛋白身份:P0DOY2 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
4EOW Crystal structure of a disease-associated anti-human GM-CSF autoantibody MB007 提交 2012-04-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 L 2–106(105 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 3.4;277 K;19% PEG 4000, 0.1M ammonium sulphate, 0.1M sodium acetate, pH 3.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.97 Å R-free 0.257
6UMX Structural basis for specific inhibition of extracellular activation of pro/latent myostatin by SRK-015 提交 2019-10-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 L 2–106(105 aa)
链 l 2–106(105 aa)
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;296 K;0.1 M sodium citrate, pH 5.5, 20% PEG3350, 15% 2-propanol, 3% trimethylamine N-oxide
分辨率 2.79 Å R-free 0.264
8ECQ Bovine Fab 2G3 提交 2022-09-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 L 16–106(91 aa)
未记录 GOL GLYCEROL × 3 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;277.15 K;10% glycerol, 0.1M Mes, 5% Peg1000, 30% Peg600
分辨率 2.00 Å R-free 0.253
8ECV Bovine Fab 2F12 提交 2022-09-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 L 16–106(91 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.2;293.15 K;0.2M sodium chloride, 0.1M phosphate-citrate buffer, 20% Peg6000
分辨率 1.81 Å R-free 0.261
8ECV Bovine Fab 2F12 提交 2022-09-02 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 16–106(91 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.2;293.15 K;0.2M sodium chloride, 0.1M phosphate-citrate buffer, 20% Peg6000
分辨率 1.81 Å R-free 0.261
8ECZ Bovine Fab 4C1 提交 2022-09-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 L 16–106(91 aa)
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293.15 K;0.1M Tris, 50% MPD, 0.2M ammonium dihydrogen phosphate
分辨率 2.82 Å R-free 0.258
8ECZ Bovine Fab 4C1 提交 2022-09-02 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 16–106(91 aa)
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293.15 K;0.1M Tris, 50% MPD, 0.2M ammonium dihydrogen phosphate
分辨率 2.82 Å R-free 0.258
8ED1 Bovine Fab 5C1 提交 2022-09-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 L 16–106(91 aa)
未记录 GOL GLYCEROL × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;277.15 K;0.1M Tris, 10% glycerol, 20% Peg300, 5% Peg8000
分辨率 2.31 Å R-free 0.267
8EDF Bovine Fab SKD in complex with Sars COV-2 receptor binding domain 提交 2022-09-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 L 16–106(91 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.2;293.15 K;0.4M Lithium chloride, 10% Peg6000, 0.1M sodium citrate
分辨率 3.40 Å R-free 0.299
8XLC Clamda1 domain of human immunoglobulin 提交 2023-12-25 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 2–104(103 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6;298 K;离子强度(mmCIF原始值)Not defined;压力 1
NMR样品组成 1.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Clamda1 domain of human immunoglobulin, 5 mM NaPi, 50 mM sodium chloride, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供