当前蛋白身份：P0DTC5
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7VGR SARS-CoV-2 M protein dimer (long form) in complex with YN7756_1 Fab 提交 2021-09-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–222（222 aa）
链 B
1–222（222 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 7VGS SARS-CoV-2 M protein dimer (short form) in complex with YN7717_9 Fab 提交 2021-09-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–222（222 aa）
链 B
1–222（222 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 8CME Human Leukocyte Antigen class II allotype DR1 presenting SARS-CoV-2 Membrane peptide M176-190 提交 2023-02-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
176–190（15 aa）
|
未记录 | MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；291 K；0.1 M MES pH 5.0, 20 % PEG3350
|
分辨率 2.26 Å R-free 0.240 |
| 8CME Human Leukocyte Antigen class II allotype DR1 presenting SARS-CoV-2 Membrane peptide M176-190 提交 2023-02-19 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 F
176–190（15 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；291 K；0.1 M MES pH 5.0, 20 % PEG3350
|
分辨率 2.26 Å R-free 0.240 |
| 8CME Human Leukocyte Antigen class II allotype DR1 presenting SARS-CoV-2 Membrane peptide M176-190 提交 2023-02-19 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 I
176–190（15 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；291 K；0.1 M MES pH 5.0, 20 % PEG3350
|
分辨率 2.26 Å R-free 0.240 |
| 8CTK Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 M protein in a lipid nanodisc 提交 2022-05-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–222（222 aa）
链 B
1–222（222 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot force 1, wait time 5s, blot time 3s
|
分辨率 3.52 Å |
| 8W2E SARS-CoV-2 M protein dimer in complex with JNJ-9676 and Fab-B 提交 2024-02-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–222（222 aa）
链 B
1–222（222 aa）
|
未记录 | A1AE8 (6S,8R)-N-(3-cyanophenyl)-5-{4-[difluoro(phenyl)methyl]phenyl}-6-methyl-4-oxo-4,5,6,7-tetrahydropyrazolo[1,5-a]pyrazine-3-carboxamide × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.06 Å |
| 9BF9 Human LAG-3-HLA-DR1 complex 提交 2024-04-17 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：tetrameric（4） 待复核 |
链 G
177–189（13 aa）
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；22% PEG 8000, 0.16M Li2SO4, 0.1M HEPES pH 7.6
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分辨率 3.40 Å R-free 0.253 |
| 9CTU Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 M (short conformation)bound to C1P 提交 2024-07-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–222（222 aa）
链 B
1–222（222 aa）
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未记录 | 1PX (2S,3R,4E)-2-(hexadecanoylamino)-3-hydroxyoctadec-4-en-1-yl dihydrogen phosphate × 2 K POTASSIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.03 Å |
| 9CTW Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 M (long conformation) in the presence of C1P 提交 2024-07-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–222（222 aa）
链 B
1–222（222 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.01 Å |
| 9EXA SARS-CoV-2 M protein dimer (short form) in complex with Fab-B and CIM-834 提交 2024-04-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
17–204（188 aa）
链 B
17–204（188 aa）
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未记录 | A1H7W 6-[[1-[4,6-dimethyl-5-(2-methylpropyl)pyrimidin-2-yl]piperidin-4-yl]-methyl-amino]-N-(2-pyrrolidin-1-ylethyl)pyridazine-4-carboxamide × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |