当前蛋白身份：P10145
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1ICW INTERLEUKIN-8, MUTANT WITH GLU 38 REPLACED BY CYS AND CYS 50 REPLACED BY ALA 提交 1996-09-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
28–99（72 aa）
链 B
28–99（72 aa）
|
突变：E38C, C50A 突变：E38C, C50A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.01 Å R-free 0.266 |
| 1IKL NMR study of monomeric human interleukin-8 (minimized average structure) 提交 1995-08-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
28–99（72 aa）
|
突变：DEL(1-3), H LEU 25 MODIFIED TO N-METHYL 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1IKM NMR study of monomeric human interleukin-8 (30 structures) 提交 1995-08-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
28–99（72 aa）
|
突变：DEL(1-3), THE AMIDE PROTON OF LEU 25 MODIFIED TO N-METHYL 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1IL8 THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF INTERLEUKIN 8 IN SOLUTION 提交 1990-03-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
28–99（72 aa）
链 B
28–99（72 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1ILP CXCR-1 N-TERMINAL PEPTIDE BOUND TO INTERLEUKIN-8 提交 1998-12-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
28–99（72 aa）
链 B
28–99（72 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.5；308 K；离子强度（mmCIF原始值）0.15 M；压力 1
|
分辨率未提供 |
| 1ILQ CXCR-1 N-TERMINAL PEPTIDE BOUND TO INTERLEUKIN-8 (MINIMIZED MEAN) 提交 1998-12-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
28–99（72 aa）
链 B
28–99（72 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.5；308 K；离子强度（mmCIF原始值）0.15 M；压力 1
|
分辨率未提供 |
| 1QE6 INTERLEUKIN-8 WITH AN ADDED DISULFIDE BETWEEN RESIDUES 5 AND 33 (L5C/H33C) 提交 1999-07-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
28–99（72 aa）
链 B
28–99（72 aa）
|
突变：L5C, H33C 突变：L5C, H33C | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；292 K；NACL, AMMONIUM SULFATE, PEG 8000, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 19K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.278 |
| 1QE6 INTERLEUKIN-8 WITH AN ADDED DISULFIDE BETWEEN RESIDUES 5 AND 33 (L5C/H33C) 提交 1999-07-13 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
28–99（72 aa）
链 D
28–99（72 aa）
|
突变：L5C, H33C 突变：L5C, H33C | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；292 K；NACL, AMMONIUM SULFATE, PEG 8000, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 19K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.278 |
| 1QE6 INTERLEUKIN-8 WITH AN ADDED DISULFIDE BETWEEN RESIDUES 5 AND 33 (L5C/H33C) 提交 1999-07-13 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
28–99（72 aa）
链 B
28–99（72 aa）
链 C
28–99（72 aa）
链 D
28–99（72 aa）
|
突变：L5C, H33C 突变：L5C, H33C 突变：L5C, H33C 突变：L5C, H33C | SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；292 K；NACL, AMMONIUM SULFATE, PEG 8000, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 19K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.278 |
| 1ROD CHIMERIC PROTEIN OF INTERLEUKIN 8 AND HUMAN MELANOMA GROWTH STIMULATING ACTIVITY PROTEIN, NMR 提交 1995-11-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
28–80（53 aa）
片段：INTERLEUKIN 8 RESIDUES 1 - 53, HUMAN MELANOMA GROWTH STIMULATING ACTIVITY PROTEIN RESIDUES 54 - 72
链 B
28–80（53 aa）
片段：INTERLEUKIN 8 RESIDUES 1 - 53, HUMAN MELANOMA GROWTH STIMULATING ACTIVITY PROTEIN RESIDUES 54 - 72
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 2IL8 THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF INTERLEUKIN 8 IN SOLUTION 提交 1990-03-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
28–99（72 aa）
链 B
28–99（72 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 3IL8 CRYSTAL STRUCTURE OF INTERLEUKIN 8: SYMBIOSIS OF NMR AND CRYSTALLOGRAPHY 提交 1990-12-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
28–99（72 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å |
| 4XDX The crystal structure of soluble human interleukin 8 expressed in Pichia pastoris 提交 2014-12-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
30–99（70 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；291 K；0.17 M Ammonium acetate, 0.085 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 20% w/v Polyethylene glycol 4,000, 15% v/v Glycerol
|
分辨率 0.95 Å R-free 0.136 |
| 5D14 The atomic resolution crystal structure of human IL-8 提交 2015-08-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
30–99（70 aa）
片段：unp residues 30-99
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；291 K；0.17 M Ammonium acetate, 0.085 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 20% w/v Polyethylene glycol 4,000, 15% v/v Glycerol. All crystals were grown at 18 deg C.
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.135 |
| 5WDZ Structure of monomeric Interleukin-8 (1-66) 提交 2017-07-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
28–93（66 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.3；313 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 1
NMR样品组成
20 mM [U-13C; U-15N] IL-8 1-66, 20 mM HEPES, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
20 mM [U-15N] IL-8, 20 mM HEPES, 70 mM sodium chloride, 13.5 mg/L Y21M bacteriophage, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
20 mM [U-15N] IL-8 1-66, 20 mM HEPES, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 6LFM Cryo-EM structure of a class A GPCR 提交 2019-12-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 D
28–99（72 aa）
链 E
28–99（72 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 6LFO Cryo-EM structure of a class A GPCR monomer 提交 2019-12-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 D
28–92（65 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 6N2U IL-8 Structure from Bacterial Expression Source 提交 2018-11-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–99（99 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.4 M Ammonium Phosphate dibasic, 0.1 M Tris HCl pH 8.5
|
分辨率 1.25 Å R-free 0.223 |
| 6WZM LY3041658 Fab bound to CXCL8 提交 2020-05-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
28–93（66 aa）
链 F
28–93（66 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；20% PEG 3350, 200mM Magnesium Chloride
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.229 |
| 6XMN Solution NMR CXCL8-CXCR1 N-domain complex structure 提交 2020-06-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
28–93（66 aa）
片段：residues 28-93
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6；303 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1
NMR样品组成
0.4 mM [U-13C; U-15N] CXCL8, 1.2 mM CXCR1, 50 mM sodium phosphate, 0.01 % sodium azide, 10 % [U-100% 2H] D2O, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1.2 mM CXCL8, 0.5 mM [U-13C; U-15N] CXCR1, 50 mM sodium phosphate, 0.01 % sodium azide, 10 % [U-100% 2H] D2O, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 8IC0 Cryo-EM structure of CXCL8 bound C-X-C chemokine receptor 1 in complex with Gi heterotrimer 提交 2023-02-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 F
28–99（72 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；50 mM HEPES pH8.0, 100 mM NaCl, 1 mM MgCl2, 0.5 mM TCEP, 0.001% LMNG, 0.0001% CHS, 1 uM IL8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.41 Å |
| 8XWN Structure of CXCR2 bound to CXCL8 (Ligand-receptor focused map) 提交 2024-01-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
21–99（79 aa）
链 E
21–99（79 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.29 Å |
| 8XX6 Structure of CXCR2 bound to CXCL8 (CXCR2-CXCL8-Go Full map) 提交 2024-01-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 D
21–99（79 aa）
链 E
21–99（79 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.99 Å |
| 8YNF Structure of Duffy Antigen Receptor for Chemokines (DARC)/ACKR1 in complex with the chemokine, CXCL8 提交 2024-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 D
21–99（79 aa）
链 E
21–99（79 aa）
链 G
21–99（79 aa）
链 H
21–99（79 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.65 Å |