当前蛋白身份：P10586
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1LAR CRYSTAL STRUCTURE OF THE TANDEM PHOSPHATASE DOMAINS OF RPTP LAR 提交 1999-04-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1323–1897（575 aa）
片段：PHOSPHATASE
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突变：P1307M | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；pH 8.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.274 |
| 1LAR CRYSTAL STRUCTURE OF THE TANDEM PHOSPHATASE DOMAINS OF RPTP LAR 提交 1999-04-20 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1323–1897（575 aa）
片段：PHOSPHATASE
|
突变：P1307M | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；pH 8.0
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.274 |
| 2DJU Solution structures of the fn3 domain of human receptor-type tyrosine-protein phosphatase F 提交 2006-04-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
309–401（93 aa）
片段：Fibronectin type III domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient
NMR样品组成
1mM fn3 domain U-15N, 13C; 20mM d-Tris HCl; 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2DN7 Solution structures of the 6th fn3 domain of human receptor-type tyrosine-protein phosphatase F 提交 2006-04-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
811–904（94 aa）
片段：Fibronectin type III domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；296 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient
NMR样品组成
1mM fn3 domain U-15N,13C; 20mM d-Tris HCl; 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2EDY Solution structures of the fn3 domain of human receptor-type tyrosine-protein phosphatase F 提交 2007-02-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
905–1000（96 aa）
片段：Fibronectin type III domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient
NMR样品组成
1mM fn3 domain U-15N, 13C; 20mM d-Tris HCl; 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2YD5 Crystal structure of the N-terminal Ig1-2 module of Human Receptor Protein Tyrosine Phosphatase LAR 提交 2011-03-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
29–231（203 aa）
片段：IG1-2, RESIDUES 29-231
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.6；0.1 M SODIUM ACETATE TRIHYDRATE, 20% ISOPROPANOL, 20% (W/V) PEG 4000, 0.25 MM HEPARIN DP10, PH 5.6 .
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分辨率 2.20 Å R-free 0.233 |
| 2YD8 Crystal structure of the N-terminal Ig1-2 module of Human Receptor Protein Tyrosine Phosphatase LAR in complex with sucrose octasulphate 提交 2011-03-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
29–231（203 aa）
片段：IG1-2, RESIDUES 29-231
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未记录 | YYJ 1,3,4,6-tetra-O-sulfo-beta-D-fructofuranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；0.1 M MES, 30% PEG 6000, PH 6.0 .
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分辨率 2.05 Å R-free 0.227 |
| 4N5U Crystal structure of the 4th FN3 domain of human Protein Tyrosine phosphatase, receptor type F [PSI-NYSGRC-006240] 提交 2013-10-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
601–705（105 aa）
片段：Fibronectin type-III 4 domain, residues 601-705
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 10.5；298 K；Protein (20 mM Hepes, pH 7.5, 150 mM NaCl, 5% glycerol, Reservoir (0.2M Lithium Sulfate, 0.1M CAPS, 1.2M NaH2PO4/0.8M K2HPO4), Cryoprotection (2M Li2SO4), VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
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分辨率 1.46 Å R-free 0.198 |
| 6KR4 Crystal structure of the liprin-alpha3_SAM123/LAR_D1D2 complex 提交 2019-08-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1332–1907（576 aa）
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未记录 | PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；296 K；50mM Tris-HCl, 200mM NaCl, 1mM ethylenediaminetetraacetic acid, 1mM dithiothreitol
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分辨率 2.85 Å R-free 0.230 |
| 6KR4 Crystal structure of the liprin-alpha3_SAM123/LAR_D1D2 complex 提交 2019-08-20 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1332–1907（576 aa）
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未记录 | PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；296 K；50mM Tris-HCl, 200mM NaCl, 1mM ethylenediaminetetraacetic acid, 1mM dithiothreitol
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.230 |
| 6KR4 Crystal structure of the liprin-alpha3_SAM123/LAR_D1D2 complex 提交 2019-08-20 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1332–1907（576 aa）
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未记录 | PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；296 K；50mM Tris-HCl, 200mM NaCl, 1mM ethylenediaminetetraacetic acid, 1mM dithiothreitol
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.230 |
| 6KR4 Crystal structure of the liprin-alpha3_SAM123/LAR_D1D2 complex 提交 2019-08-20 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1332–1907（576 aa）
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未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；296 K；50mM Tris-HCl, 200mM NaCl, 1mM ethylenediaminetetraacetic acid, 1mM dithiothreitol
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.230 |
| 6TPT Crystal structures of FNIII domain three and four of the human leucocyte common antigen-related protein, LAR 提交 2019-12-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
512–706（195 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；0.2 M Sodium fluoride, 0.1 M Bis-tris propane pH 6.5, and 20% PEG3350
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分辨率 3.20 Å R-free 0.269 |
| 6TPU Crystal structures of FNIII domain three and four of the human leucocyte common antigen-related protein, LAR 提交 2019-12-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
513–706（194 aa）
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未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；277 K；1.8 M Ammonium citrate tribasic pH 7.0
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分辨率 1.55 Å R-free 0.193 |
| 6TPU Crystal structures of FNIII domain three and four of the human leucocyte common antigen-related protein, LAR 提交 2019-12-14 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
513–706（194 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；277 K；1.8 M Ammonium citrate tribasic pH 7.0
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.193 |
| 6TPV Crystal structures of FNIII domain one and two of the human leucocyte common antigen-related protein, LAR 提交 2019-12-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
319–512（194 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；277 K；0.2 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 8.3, 20 % PEG 3,350
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分辨率 1.80 Å R-free 0.220 |
| 6TPV Crystal structures of FNIII domain one and two of the human leucocyte common antigen-related protein, LAR 提交 2019-12-14 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
319–512（194 aa）
|
未记录 | IMD IMIDAZOLE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；277 K；0.2 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 8.3, 20 % PEG 3,350
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.220 |
| 6TPW Crystal structures of FNIII domain one through four of the human leucocyte common antigen-related protein ( LAR) 提交 2019-12-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
319–706（388 aa）
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；277 K；0.2 M Ammonium sulfate and 30% PEG8000
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分辨率 2.90 Å R-free 0.301 |