当前蛋白身份：P10826
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1HRA THE SOLUTION STRUCTURE OF THE HUMAN RETINOIC ACID RECEPTOR-BETA DNA-BINDING DOMAIN 提交 1993-07-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
75–153（79 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1XAP Structure of the ligand binding domain of the Retinoic Acid Receptor beta 提交 2004-08-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
176–421（246 aa）
片段：ligand binding domain
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未记录 | TTB 4-[(1E)-2-(5,5,8,8-TETRAMETHYL-5,6,7,8-TETRAHYDRONAPHTHALEN-2-YL)PROP-1-ENYL]BENZOIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；290 K；PEG 8000, potassium chloride, magnesium chloride, MES, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290K
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分辨率 2.10 Å R-free 0.253 |
| 4DM6 Crystal structure of RARb LBD homodimer in complex with TTNPB 提交 2012-02-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
176–421（246 aa）
片段：unp residues 176-421
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未记录 | TTB 4-[(1E)-2-(5,5,8,8-TETRAMETHYL-5,6,7,8-TETRAHYDRONAPHTHALEN-2-YL)PROP-1-ENYL]BENZOIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；290 K；5% polyethylene glycol 8000, 0.2 M KCl, 0.01 M MgCl2 and 0.05 M MES, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K, pH 5.6
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分辨率 1.90 Å R-free 0.239 |
| 4DM6 Crystal structure of RARb LBD homodimer in complex with TTNPB 提交 2012-02-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
176–421（246 aa）
片段：unp residues 176-421
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未记录 | TTB 4-[(1E)-2-(5,5,8,8-TETRAMETHYL-5,6,7,8-TETRAHYDRONAPHTHALEN-2-YL)PROP-1-ENYL]BENZOIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；290 K；5% polyethylene glycol 8000, 0.2 M KCl, 0.01 M MgCl2 and 0.05 M MES, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K, pH 5.6
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.239 |
| 4DM8 Crystal structure of RARb LBD in complex with 9cis retinoic acid 提交 2012-02-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
176–421（246 aa）
片段：unp residues 176-421
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未记录 | REA RETINOIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；290 K；5% polyethylene glycol 8000, 0.2 M
KCl, 0.01 M MgCl2 and 0.05 M MES pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
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分辨率 2.30 Å R-free 0.277 |
| 4DM8 Crystal structure of RARb LBD in complex with 9cis retinoic acid 提交 2012-02-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
176–421（246 aa）
片段：unp residues 176-421
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未记录 | REA RETINOIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；290 K；5% polyethylene glycol 8000, 0.2 M
KCl, 0.01 M MgCl2 and 0.05 M MES pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.277 |
| 4JYG Crystal structure of RARbeta LBD in complex with agonist BMS411 [4-{[(5,5-dimethyl-8-phenyl-5,6-dihydronaphthalen-2-yl)carbonyl]amino}benzoic acid] 提交 2013-03-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
176–421（246 aa）
片段：Ligand binding domain, UNP residues 176-421
链 B
176–421（246 aa）
片段：Ligand binding domain, UNP residues 176-421
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未记录 | 1NY 4-{[(5,5-dimethyl-8-phenyl-5,6-dihydronaphthalen-2-yl)carbonyl]amino}benzoic acid × 2 PE4 2-{2-[2-(2-{2-[2-(2-ETHOXY-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANOL × 1 FLC CITRATE ANION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；291 K；200 mM Tri Sodium Citrate pH 5.5, 25 % PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.257 |
| 4JYH Crystal structure of RARbeta LBD in complex with selective agonist BMS948 [4-{[(8-phenylnaphthalen-2-yl)carbonyl]amino}benzoic acid] 提交 2013-03-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
176–421（246 aa）
片段：Ligand binding domain, UNP residues 176-421
链 B
176–421（246 aa）
片段：Ligand binding domain, UNP residues 176-421
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未记录 | JYH 4-{[(8-phenylnaphthalen-2-yl)carbonyl]amino}benzoic acid × 2 FLC CITRATE ANION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；291 K；200 mM Tri Sodium Citrate pH 5.5, 25% PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K
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分辨率 2.60 Å R-free 0.267 |
| 4JYI Crystal structure of RARbeta LBD in complex with selective partial agonist BMS641 [3-chloro-4-[(E)-2-(5,5-dimethyl-8-phenyl-5,6-dihydronaphthalen-2-yl)ethenyl]benzoic acid] 提交 2013-03-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
176–421（246 aa）
片段：Ligand binding domain, UNP residues 176-421
链 B
176–421（246 aa）
片段：Ligand binding domain, UNP residues 176-421
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未记录 | JYI 3-chloro-4-[(E)-2-(5,5-dimethyl-8-phenyl-5,6-dihydronaphthalen-2-yl)ethenyl]benzoic acid × 2 FLC CITRATE ANION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；291 K；200 mM Tri Sodium Citrate pH 5.5, 25% PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.227 |
| 5UAN Crystal structure of multi-domain RAR-beta-RXR-alpha heterodimer on DNA 提交 2016-12-19 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 B
80–455（376 aa）
片段：UNP residues 98-462
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未记录 | ZN ZINC ION × 4 9CR (9cis)-retinoic acid × 1 REA RETINOIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；MES, PEG300
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分辨率 3.51 Å R-free 0.270 |
| 6SSQ Crystal structure of RARbeta LBD in complex with LG 100754 提交 2019-09-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
176–421（246 aa）
链 B
176–421（246 aa）
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未记录 | 754 (2E,4E,6Z)-3-methyl-7-(5,5,8,8-tetramethyl-3-propoxy-5,6,7,8-tetrahydronaphthalen-2-yl)octa-2,4,6-trienoic acid × 2 FLC CITRATE ANION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；200 mM Tri Sodium Citrate pH 5.5, 25 % PEG 4000
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分辨率 2.30 Å R-free 0.208 |