当前蛋白身份：P11717
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1E6F Human MIR-receptor, repeat 11 提交 2000-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1508–1650（143 aa）
片段：IGF-II-BINDING DOMAIN, REPEAT 11, RESIDUES 1508-1650
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；PRECIPITANT: 0.2 M AMMONIUM ACETATE, 0.1 M CACODYLATE PH 5 28% PEG 4000. PROTEIN SOLUTION: 8 MG/ML IN 10 MM TRIS-HCL PH7.5, 150 MM N VAPOUR DIFFUSION, HANGING DROPS,1:1 RATIO.
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.273 |
| 1E6F Human MIR-receptor, repeat 11 提交 2000-08-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1508–1650（143 aa）
片段：IGF-II-BINDING DOMAIN, REPEAT 11, RESIDUES 1508-1650
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；PRECIPITANT: 0.2 M AMMONIUM ACETATE, 0.1 M CACODYLATE PH 5 28% PEG 4000. PROTEIN SOLUTION: 8 MG/ML IN 10 MM TRIS-HCL PH7.5, 150 MM N VAPOUR DIFFUSION, HANGING DROPS,1:1 RATIO.
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.273 |
| 1GP0 Human IGF2R domain 11 提交 2001-10-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1508–1650（143 aa）
片段：IGF-II-BINDING DOMAIN, REPEAT 11 RESIDUES 1508-1650
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 0.2 M LITHIUM SULFATE, 0.1 M TRIS HCL PH 8.5, 30 % PEG 4000
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.237 |
| 1GP3 Human IGF2R domain 11 提交 2001-10-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1508–1650（143 aa）
片段：IGF-II BINDING DOMAIN REPEAT 11 RESIDUES 1508-1650
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 0.2 M SODIUM ACETATE, 0.1 M TRIS HCL PH 8.5, 30 % W/V PEG 4000
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.255 |
| 1GQB HUMAN MIR-RECEPTOR, REPEAT 11 提交 2001-11-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1508–1650（143 aa）
片段：IGF-II-BINDING DOMAIN, REPEAT 11, RESIDUES 1508-1650
|
未记录 | BR BROMIDE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；PRECIPITANT: 0.2 M AMMONIUM ACETATE, 0.1 M CACODYLATE PH 5, 28% PEG 4000. PROTEIN SOLUTION: 8 MG/ML IN 10 MM TRIS-HCL PH7.5, 150 MM VAPOUR DIFFUSION, HANGING DROPS,1:1 RATIO.
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.253 |
| 1GQB HUMAN MIR-RECEPTOR, REPEAT 11 提交 2001-11-22 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1508–1650（143 aa）
片段：IGF-II-BINDING DOMAIN, REPEAT 11, RESIDUES 1508-1650
|
未记录 | BR BROMIDE ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；PRECIPITANT: 0.2 M AMMONIUM ACETATE, 0.1 M CACODYLATE PH 5, 28% PEG 4000. PROTEIN SOLUTION: 8 MG/ML IN 10 MM TRIS-HCL PH7.5, 150 MM VAPOUR DIFFUSION, HANGING DROPS,1:1 RATIO.
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.253 |
| 1JPL GGA3 VHS domain complexed with C-terminal peptide from cation-independent mannose 6-phosphate receptor 提交 2001-08-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
2480–2491（12 aa）
片段：C-terminal peptide
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.6；293 K；1.5M Sodium/Potassium Phosphate, 200mM Lithium Sulfate, pH 10.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.257 |
| 1JPL GGA3 VHS domain complexed with C-terminal peptide from cation-independent mannose 6-phosphate receptor 提交 2001-08-02 | Assembly 10 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
2480–2491（12 aa）
片段：C-terminal peptide
链 F
2480–2491（12 aa）
片段：C-terminal peptide
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.6；293 K；1.5M Sodium/Potassium Phosphate, 200mM Lithium Sulfate, pH 10.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.257 |
| 1JPL GGA3 VHS domain complexed with C-terminal peptide from cation-independent mannose 6-phosphate receptor 提交 2001-08-02 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
2480–2491（12 aa）
片段：C-terminal peptide
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.6；293 K；1.5M Sodium/Potassium Phosphate, 200mM Lithium Sulfate, pH 10.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.257 |
| 1JPL GGA3 VHS domain complexed with C-terminal peptide from cation-independent mannose 6-phosphate receptor 提交 2001-08-02 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
2480–2491（12 aa）
片段：C-terminal peptide
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.6；293 K；1.5M Sodium/Potassium Phosphate, 200mM Lithium Sulfate, pH 10.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.257 |
| 1JPL GGA3 VHS domain complexed with C-terminal peptide from cation-independent mannose 6-phosphate receptor 提交 2001-08-02 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
2480–2491（12 aa）
片段：C-terminal peptide
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.6；293 K；1.5M Sodium/Potassium Phosphate, 200mM Lithium Sulfate, pH 10.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.257 |
| 1JPL GGA3 VHS domain complexed with C-terminal peptide from cation-independent mannose 6-phosphate receptor 提交 2001-08-02 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 E
2480–2491（12 aa）
片段：C-terminal peptide
链 F
2480–2491（12 aa）
片段：C-terminal peptide
链 G
2480–2491（12 aa）
片段：C-terminal peptide
链 H
2480–2491（12 aa）
片段：C-terminal peptide
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.6；293 K；1.5M Sodium/Potassium Phosphate, 200mM Lithium Sulfate, pH 10.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.257 |
| 1JPL GGA3 VHS domain complexed with C-terminal peptide from cation-independent mannose 6-phosphate receptor 提交 2001-08-02 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 E
2480–2491（12 aa）
片段：C-terminal peptide
链 F
2480–2491（12 aa）
片段：C-terminal peptide
链 G
2480–2491（12 aa）
片段：C-terminal peptide
链 H
2480–2491（12 aa）
片段：C-terminal peptide
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.6；293 K；1.5M Sodium/Potassium Phosphate, 200mM Lithium Sulfate, pH 10.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.257 |
| 1JPL GGA3 VHS domain complexed with C-terminal peptide from cation-independent mannose 6-phosphate receptor 提交 2001-08-02 | Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 E
2480–2491（12 aa）
片段：C-terminal peptide
链 F
2480–2491（12 aa）
片段：C-terminal peptide
链 G
2480–2491（12 aa）
片段：C-terminal peptide
链 H
2480–2491（12 aa）
片段：C-terminal peptide
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.6；293 K；1.5M Sodium/Potassium Phosphate, 200mM Lithium Sulfate, pH 10.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.257 |
| 1JPL GGA3 VHS domain complexed with C-terminal peptide from cation-independent mannose 6-phosphate receptor 提交 2001-08-02 | Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 E
2480–2491（12 aa）
片段：C-terminal peptide
链 F
2480–2491（12 aa）
片段：C-terminal peptide
链 G
2480–2491（12 aa）
片段：C-terminal peptide
链 H
2480–2491（12 aa）
片段：C-terminal peptide
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.6；293 K；1.5M Sodium/Potassium Phosphate, 200mM Lithium Sulfate, pH 10.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.257 |
| 1JPL GGA3 VHS domain complexed with C-terminal peptide from cation-independent mannose 6-phosphate receptor 提交 2001-08-02 | Assembly 9 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 G
2480–2491（12 aa）
片段：C-terminal peptide
链 H
2480–2491（12 aa）
片段：C-terminal peptide
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.6；293 K；1.5M Sodium/Potassium Phosphate, 200mM Lithium Sulfate, pH 10.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.257 |
| 1JWG VHS Domain of human GGA1 complexed with cation-independent M6PR C-terminal Peptide 提交 2001-09-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
2479–2491（13 aa）
片段：C-terminal fragment
|
未记录 | IOD IODIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PEG 3350, ammonium iodide, Tris, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.261 |
| 1JWG VHS Domain of human GGA1 complexed with cation-independent M6PR C-terminal Peptide 提交 2001-09-04 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
2479–2491（13 aa）
片段：C-terminal fragment
|
未记录 | IOD IODIDE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PEG 3350, ammonium iodide, Tris, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.261 |
| 1LF8 Complex of GGA3-VHS Domain and CI-MPR C-terminal Phosphopeptide 提交 2002-04-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
2480–2491（12 aa）
片段：C-terminus (residues 2480-2491)
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100mM CAPS 10.2-11.0, 200 mM Lithium Sulfate, 1.3-2M Sodium/Potassium phosphate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.255 |
| 1LF8 Complex of GGA3-VHS Domain and CI-MPR C-terminal Phosphopeptide 提交 2002-04-10 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
2480–2491（12 aa）
片段：C-terminus (residues 2480-2491)
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100mM CAPS 10.2-11.0, 200 mM Lithium Sulfate, 1.3-2M Sodium/Potassium phosphate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.255 |
| 1LF8 Complex of GGA3-VHS Domain and CI-MPR C-terminal Phosphopeptide 提交 2002-04-10 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
2480–2491（12 aa）
片段：C-terminus (residues 2480-2491)
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100mM CAPS 10.2-11.0, 200 mM Lithium Sulfate, 1.3-2M Sodium/Potassium phosphate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.255 |
| 1LF8 Complex of GGA3-VHS Domain and CI-MPR C-terminal Phosphopeptide 提交 2002-04-10 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
2480–2491（12 aa）
片段：C-terminus (residues 2480-2491)
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100mM CAPS 10.2-11.0, 200 mM Lithium Sulfate, 1.3-2M Sodium/Potassium phosphate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.255 |
| 2CNJ NMR studies on the interaction of Insulin-Growth Factor II (IGF-II) with IGF2R domain 11 提交 2006-05-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1508–1650（143 aa）
片段：DOMAIN 11, RESIDUES 1508-1650
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.5；298 K；压力 1.0
NMR样品组成
5% D2O/ 95% H2O
|
分辨率未提供 |
| 2V5N STRUCTURE OF HUMAN IGF2R DOMAINS 11-12 提交 2007-07-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1508–1799（292 aa）
片段：DOMAINS 11 AND 12, RESIDUES 1508-1799
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；0.2 M POTASSIUM SODIUM TARTRATE, 20% (W/V) PEG 3350, pH 7.5
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.317 |
| 2V5O STRUCTURE OF HUMAN IGF2R DOMAINS 11-14 提交 2007-07-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1508–2128（621 aa）
片段：DOMAINS 11-14, RESIDUES 1508-2128
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.4；0.1 M MES PH6.4, 2.5% (W/V) PEG 3000
|
分辨率 2.91 Å R-free 0.304 |
| 2V5P COMPLEX STRUCTURE OF HUMAN IGF2R DOMAINS 11-13 BOUND TO IGF-II 提交 2007-07-06 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1508–1992（485 aa）
片段：DOMAINS 11-13, RESIDUES 1508-1992
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 9；0.1 M TRIS-HCL PH 9.0, 15% (V/V) MPD
|
分辨率 4.10 Å R-free 0.327 |
| 2V5P COMPLEX STRUCTURE OF HUMAN IGF2R DOMAINS 11-13 BOUND TO IGF-II 提交 2007-07-06 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1508–1992（485 aa）
片段：DOMAINS 11-13, RESIDUES 1508-1992
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 9；0.1 M TRIS-HCL PH 9.0, 15% (V/V) MPD
|
分辨率 4.10 Å R-free 0.327 |
| 5IEI X-ray crystallographic structure of a high affinity IGF2 antagonist (Domain11 AB5 RHH) based on human IGF2R domain 11 提交 2016-02-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1508–1649（142 aa）
片段：UNP residues 1508-1649
|
突变：Q1569R, P1597H, S1602H | GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；2.0 M Ammonium Sulphate, 0.1M Bis-(2-hydroxyethyl)imino-tris(hydroxymethyl methane, pH 7.0.
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.249 |
| 6N5X Crystal structure of the SNX5 PX domain in complex with the CI-MPR (space group P212121 - Form 1) 提交 2018-11-22 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2347–2377（31 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 JEF O-(O-(2-AMINOPROPYL)-O'-(2-METHOXYETHYL)POLYPROPYLENE GLYCOL 500) × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；75% of 0.2 M (NH4)SO4, 0.1 M MES pH 6.5, 30% (w/v) PEG5000 MME + 15% glycerol + 40% v/v Polypropylene glycol P400
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.234 |
| 6N5Y Crystal structure of the SNX5 PX domain in complex with the CI-MPR (space group P212121 - Form 1) 提交 2018-11-22 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2347–2377（31 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；75% of 0.2 M (NH4)SO4, 0.1 M MES pH 6.5, 30% (w/v) PEG5000 MME + 15% glycerol + 30% v/v (+/-)-2-Methyl-2,4-pentanediol
|
分辨率 2.26 Å R-free 0.235 |
| 6P8I N-terminal 5 domains of IGFIIR 提交 2019-06-07 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
36–763（728 aa）
片段：N-terminal 5 domains
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；292.15 K；100mM ammonium citrate dibasic, 20% PEG 3350
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.282 |
| 6V02 N-terminal 5 domains of CI-MPR 提交 2019-11-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
43–763（721 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292.15 K；100 mM HEPES pH 7.0, 30% Jeffamine ED-2003
|
分辨率 2.46 Å R-free 0.308 |
| 6Z30 Human cation-independent mannose 6-phosphate/ IGF2 receptor domains 9-10 提交 2020-05-19 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1222–1510（289 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；298 K；0.1 M SPG buffer (succinic acid, sodium dihydrogen phosphate monohydrate, glycine) pH 9, 25 % PEG 1500
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.228 |
| 6Z31 Human cation-independent mannose 6-phosphate/ IGF2 receptor domain 8 提交 2020-05-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1082–1220（139 aa）
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未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；1.5 M Ammonium sulphate, 0.1 M Tris pH 8.5, 12 % glycerol
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分辨率 2.56 Å R-free 0.251 |
| 6Z31 Human cation-independent mannose 6-phosphate/ IGF2 receptor domain 8 提交 2020-05-19 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1082–1220（139 aa）
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未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；1.5 M Ammonium sulphate, 0.1 M Tris pH 8.5, 12 % glycerol
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分辨率 2.56 Å R-free 0.251 |
| 6Z32 Human cation-independent mannose 6-phosphate/IGF2 receptor domains 7-11 提交 2020-05-19 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
927–1649（723 aa）
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M MES pH 6.5, 1.6 M MgSO4, 10 mM mannose 6-phosphate
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分辨率 3.47 Å R-free 0.300 |
| 6Z32 Human cation-independent mannose 6-phosphate/IGF2 receptor domains 7-11 提交 2020-05-19 | Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
927–1649（723 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M MES pH 6.5, 1.6 M MgSO4, 10 mM mannose 6-phosphate
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分辨率 3.47 Å R-free 0.300 |
| 8AFZ Architecture of the ESCPE-1 membrane coat 提交 2022-07-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
2347–2377（31 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Incubation time 30s
Blotting time 2s
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分辨率 10.00 Å |