当前蛋白身份：P11802
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2W96 Crystal Structure of CDK4 in complex with a D-type cyclin 提交 2009-01-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–44（44 aa）
片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 1-44,48-303
链 B
48–303（256 aa）
片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 1-44,48-303
|
突变：YES 突变：YES | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.30 Å R-free 0.259 |
| 2W99 Crystal Structure of CDK4 in complex with a D-type cyclin 提交 2009-01-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–44（44 aa）
片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 1-44,48-303
链 B
48–303（256 aa）
片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 1-44,48-303
|
突变：YES 突变：YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.80 Å R-free 0.270 |
| 2W9F Crystal Structure of CDK4 in complex with a D-type cyclin 提交 2009-01-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–44（44 aa）
片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 1-44,48-303
链 B
48–303（256 aa）
片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 1-44,48-303
|
突变：YES 突变：YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.85 Å R-free 0.300 |
| 2W9Z Crystal Structure of CDK4 in complex with a D-type cyclin 提交 2009-01-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–44（44 aa）
链 B
48–303（256 aa）
|
突变：YES 突变：YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.45 Å R-free 0.272 |
| 3G33 Crystal structure of CDK4/cyclin D3 提交 2009-02-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–303（303 aa）
链 C
1–303（303 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.6；298 K；0.1 M Hepes, 15% PEG 3,350, 10% tacsimate, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.314 |
| 5FWK Atomic cryoEM structure of Hsp90-Cdc37-Cdk4 complex 提交 2016-02-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 K
1–303（303 aa）
片段：FULL LENGTH
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20MM TRIS-HCL (PH 7.5), 150 MM NACL, 10 MM KCL, 10 MM MGCL2, 20 MM NA2MOO4, 2MM DTT, 0.085MM DDM；pH 7.5；20MM TRIS-HCL (PH 7.5), 150 MM NACL, 10 MM KCL, 10 MM MGCL2, 20 MM NA2MOO4, 2MM DTT, 0.085MM DDM
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 5FWL Atomic cryoEM structure of Hsp90-Cdc37-Cdk4 complex 提交 2016-02-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 K
1–303（303 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20MM TRIS-HCL, 150 MM NACL, 10MM KCL, 10MM MGCL2, 20MM NA2MOO4, 2MM DTT, 0.085MM DDM；pH 7.5；20MM TRIS-HCL, 150 MM NACL, 10MM KCL, 10MM MGCL2, 20MM NA2MOO4, 2MM DTT, 0.085MM DDM
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 9.00 Å |
| 5FWM Atomic cryoEM structure of Hsp90-Cdc37-Cdk4 complex 提交 2016-02-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 K
1–303（303 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20MM TRIS-HCL (PH 7.5), 150 MM NACL, 10 MM KCL, 10 MM MGCL2, 20 MM NA2MOO4, 2MM DTT, 0.085MM DDM；pH 7.5；20MM TRIS-HCL (PH 7.5), 150 MM NACL, 10 MM KCL, 10 MM MGCL2, 20 MM NA2MOO4, 2MM DTT, 0.085MM DDM
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
|
分辨率 8.00 Å |
| 5FWP Atomic cryoEM structure of Hsp90-Cdc37-Cdk4 complex 提交 2016-02-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 K
1–303（303 aa）
片段：KINASE DOMAIN
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20mM Tris-HCl (pH 7.5), 150 mM NaCl, 10 mM KCl, 10 mM MgCl2, 20 mM Na2MoO4, 2mM DTT, 0.085mM DDM
cryo-EM玻璃化条件
Single blot from 4 to 6 seconds, at 20C；95 K；冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
|
分辨率 7.20 Å |
| 6P8E Crystal structure of CDK4 in complex with CyclinD1 and P27 提交 2019-06-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
2–303（302 aa）
|
突变：G48E, G49E | MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；295 K；100mM Tris (7.0)
200mM MgCl2
25%PEG 8000
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.222 |
| 6P8F Crystal structure of CDK4 in complex with CyclinD1 and P27 提交 2019-06-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
2–303（302 aa）
|
突变：G48E, G49E | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；100mM Tris (7.0)
17% PEG 3350
100 mM CaCl2
10 mM MgCl2
|
分辨率 2.89 Å R-free 0.242 |
| 6P8G Crystal structure of CDK4 in complex with CyclinD1 and P27 提交 2019-06-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
2–303（302 aa）
|
突变：G48E, G49E | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；295 K；100mM Tris (7.0)
200mM MgCl2
10% PEG 8000
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.275 |
| 6P8H Crystal structure of CDK4 in complex with CyclinD1 and P21 提交 2019-06-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
2–303（302 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 7；295 K；100mM Tris (7.0),
10% PEG 8000
200mM MgCl2
|
分辨率 3.19 Å R-free 0.258 |
| 7SJ3 Structure of CDK4-Cyclin D3 bound to abemaciclib 提交 2021-10-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–303（302 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 6ZV N-{5-[(4-ethylpiperazin-1-yl)methyl]pyridin-2-yl}-5-fluoro-4-[4-fluoro-2-methyl-1-(propan-2-yl)-1H-benzimidazol-6-yl]py rimidin-2-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；294 K；100mM MES pH 6.5, 10% PEG 8000, 200mM sodium acetate, 10mM TCEP
|
分辨率 2.51 Å R-free 0.234 |
| 9CSK Crystal structure of CDK4 cyclin D1 in complex with atirmociclib 提交 2024-07-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–303（303 aa）
|
突变：DELTA(43-47)EE | A1AZ4 Atirmociclib × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294.15 K；Salt: 0.1 M DL-Malic acid
Polymer: 12.4642857143 %w/v PEG 3350
Buffer: 0.1 M HEPES (pH 6.91)
Additive: 10mM DTT
[protein] 6mg/ml
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.270 |
| 9CSK Crystal structure of CDK4 cyclin D1 in complex with atirmociclib 提交 2024-07-24 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1–303（303 aa）
|
突变：DELTA(43-47)EE | A1AZ4 Atirmociclib × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294.15 K；Salt: 0.1 M DL-Malic acid
Polymer: 12.4642857143 %w/v PEG 3350
Buffer: 0.1 M HEPES (pH 6.91)
Additive: 10mM DTT
[protein] 6mg/ml
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.270 |