当前蛋白身份：P11974
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1A49 BIS MG-ATP-K-OXALATE COMPLEX OF PYRUVATE KINASE 提交 1998-02-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–530（530 aa）
链 B
1–530（530 aa）
链 C
1–530（530 aa）
链 D
1–530（530 aa）
|
未记录 | K POTASSIUM ION × 4 OXL OXALATE ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；pH 6.0
|
分辨率 2.10 Å |
| 1A49 BIS MG-ATP-K-OXALATE COMPLEX OF PYRUVATE KINASE 提交 1998-02-12 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
1–530（530 aa）
链 F
1–530（530 aa）
链 G
1–530（530 aa）
链 H
1–530（530 aa）
|
未记录 | K POTASSIUM ION × 4 OXL OXALATE ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；pH 6.0
|
分辨率 2.10 Å |
| 1A5U PYRUVATE KINASE COMPLEX WITH BIS MG-ATP-NA-OXALATE 提交 1998-02-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–530（530 aa）
链 B
1–530（530 aa）
链 C
1–530（530 aa）
链 D
1–530（530 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 4 OXL OXALATE ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；pH 6.0
|
分辨率 2.35 Å |
| 1A5U PYRUVATE KINASE COMPLEX WITH BIS MG-ATP-NA-OXALATE 提交 1998-02-18 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
1–530（530 aa）
链 F
1–530（530 aa）
链 G
1–530（530 aa）
链 H
1–530（530 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 4 OXL OXALATE ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；pH 6.0
|
分辨率 2.35 Å |
| 1AQF PYRUVATE KINASE FROM RABBIT MUSCLE WITH MG, K, AND L-PHOSPHOLACTATE 提交 1997-07-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–530（530 aa）
链 B
1–530（530 aa）
链 C
1–530（530 aa）
链 D
1–530（530 aa）
|
未记录 | K POTASSIUM ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 PEQ L-PHOSPHOLACTATE × 4 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.70 Å |
| 1AQF PYRUVATE KINASE FROM RABBIT MUSCLE WITH MG, K, AND L-PHOSPHOLACTATE 提交 1997-07-29 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
1–530（530 aa）
链 F
1–530（530 aa）
链 G
1–530（530 aa）
链 H
1–530（530 aa）
|
未记录 | K POTASSIUM ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 PEQ L-PHOSPHOLACTATE × 4 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.70 Å |
| 1F3W RECOMBINANT RABBIT MUSCLE PYRUVATE KINASE 提交 2000-06-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–530（530 aa）
链 B
1–530（530 aa）
链 C
1–530（530 aa）
链 D
1–530（530 aa）
|
未记录 | K POTASSIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 PYR PYRUVIC ACID × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；PEG 8000, manganese chloride, potassium chloride, sodium pyruvate, succinate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.257 |
| 1F3W RECOMBINANT RABBIT MUSCLE PYRUVATE KINASE 提交 2000-06-06 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
1–530（530 aa）
链 F
1–530（530 aa）
链 G
1–530（530 aa）
链 H
1–530（530 aa）
|
未记录 | K POTASSIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 PYR PYRUVIC ACID × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；PEG 8000, manganese chloride, potassium chloride, sodium pyruvate, succinate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.257 |
| 1F3X S402P MUTANT OF RABBIT MUSCLE PYRUVATE KINASE 提交 2000-06-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–530（530 aa）
链 B
1–530（530 aa）
链 C
1–530（530 aa）
链 D
1–530（530 aa）
|
突变：S402P 突变：S402P 突变：S402P 突变：S402P | K POTASSIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 PYR PYRUVIC ACID × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；PEG 8000, manganese chloride, potassium chloride, sodium pyruvate, succinate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.270 |
| 1F3X S402P MUTANT OF RABBIT MUSCLE PYRUVATE KINASE 提交 2000-06-06 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
1–530（530 aa）
链 F
1–530（530 aa）
链 G
1–530（530 aa）
链 H
1–530（530 aa）
|
突变：S402P 突变：S402P 突变：S402P 突变：S402P | K POTASSIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 PYR PYRUVIC ACID × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；PEG 8000, manganese chloride, potassium chloride, sodium pyruvate, succinate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.270 |
| 1PKN STRUCTURE OF RABBIT MUSCLE PYRUVATE KINASE COMPLEXED WITH MN2+, K+, AND PYRUVATE 提交 1994-03-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–530（530 aa）
|
未记录 | K POTASSIUM ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1 PYR PYRUVIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.90 Å |
| 2G50 The location of the allosteric amino acid binding site of muscle pyruvate kinase. 提交 2006-02-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–530（530 aa）
链 B
1–530（530 aa）
链 C
1–530（530 aa）
链 D
1–530（530 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 6 ALA ALANINE × 4 PYR PYRUVIC ACID × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 13 GOL GLYCEROL × 12 ETE 2-{2-[2-2-(METHOXY-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；60 mM Succinate (pH 5.5), 5.8 mM sodium pyruvate, 2.4 mM MnCl2, 450 mM KCl, and a range of 18 to 20% PEG 8000, 150 mM Alanine, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.174 |
| 2G50 The location of the allosteric amino acid binding site of muscle pyruvate kinase. 提交 2006-02-22 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
1–530（530 aa）
链 F
1–530（530 aa）
链 G
1–530（530 aa）
链 H
1–530（530 aa）
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 6 ALA ALANINE × 4 PYR PYRUVIC ACID × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 16 GOL GLYCEROL × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；60 mM Succinate (pH 5.5), 5.8 mM sodium pyruvate, 2.4 mM MnCl2, 450 mM KCl, and a range of 18 to 20% PEG 8000, 150 mM Alanine, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.174 |
| 3N25 The structure of muscle pyruvate kinase in complex with proline, pyruvate, and Mn2+ 提交 2010-05-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–531（531 aa）
链 B
1–531（531 aa）
链 C
1–531（531 aa）
链 D
1–531（531 aa）
|
未记录 | PRO PROLINE × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 PYR PYRUVIC ACID × 4 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 6 GOL GLYCEROL × 11 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
hanging drop vapor diffusion；pH 5.5；298 K；60 mM Succinate (pH 5.5), 5.8 mM sodium pyruvate, 2.4 mM MnCl2, 450 mM KCl, 444 mM Proline and a range of 18 to 20% PEG 8000., hanging drop vapor diffusion, temperature 298K
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.268 |
| 3N25 The structure of muscle pyruvate kinase in complex with proline, pyruvate, and Mn2+ 提交 2010-05-17 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
1–531（531 aa）
链 F
1–531（531 aa）
链 G
1–531（531 aa）
链 H
1–531（531 aa）
|
未记录 | PRO PROLINE × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 PYR PYRUVIC ACID × 4 K POTASSIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 6 GOL GLYCEROL × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
hanging drop vapor diffusion；pH 5.5；298 K；60 mM Succinate (pH 5.5), 5.8 mM sodium pyruvate, 2.4 mM MnCl2, 450 mM KCl, 444 mM Proline and a range of 18 to 20% PEG 8000., hanging drop vapor diffusion, temperature 298K
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.268 |
| 7R6Y E117K mutant pyruvate kinase from rabbit muscle 提交 2021-06-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–531（531 aa）
链 B
1–531（531 aa）
链 C
1–531（531 aa）
链 D
1–531（531 aa）
|
突变：E117K 突变：E117K 突变：E117K 突变：E117K | ACT ACETATE ION × 9 OXL OXALATE ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；291.15 K；0.2 M magnesium acetate, 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, and 18% w/v Polyethylene Glycol 8000
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.250 |
| 8F5T Rabbit muscle pyruvate kinase in complex with sodium and magnesium 提交 2022-11-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–531（531 aa）
链 B
1–531（531 aa）
链 C
1–531（531 aa）
链 D
1–531（531 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 4 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；298 K；50 mM Tris 50 mM NaCl and a range of 7.5 to 10% PEG 20,000
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.232 |
| 8F5T Rabbit muscle pyruvate kinase in complex with sodium and magnesium 提交 2022-11-15 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
1–531（531 aa）
链 F
1–531（531 aa）
链 G
1–531（531 aa）
链 H
1–531（531 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 4 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 4 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；298 K；50 mM Tris 50 mM NaCl and a range of 7.5 to 10% PEG 20,000
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.232 |
| 8F5U Rabbit muscle pyruvate kinase in complex with magnesium, potassium and pyruvate 提交 2022-11-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–531（531 aa）
链 B
1–531（531 aa）
链 C
1–531（531 aa）
链 D
1–531（531 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 K POTASSIUM ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 4 PYR PYRUVIC ACID × 2 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；282 K；50 mM Tris 50 mM NaCl and a range of 7.5 to 10% PEG 20,000
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.220 |
| 8F6M Complex of Rabbit muscle pyruvate kinase with ADP and the phosphonate analogue of PEP mimicking the Michaelis complex. 提交 2022-11-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–531（531 aa）
链 F
1–531（531 aa）
链 G
1–531（531 aa）
链 H
1–531（531 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 SIN SUCCINIC ACID × 5 MN MANGANESE (II) ION × 7 K POTASSIUM ION × 4 ALA ALANINE × 4 GOL GLYCEROL × 13 GZ3 (E)-2-METHYL-3-PHOSPHONOACRYLATE × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；15 mM succinate, 50 mM KCl, 19 to 24% PEG 8,000 well solution
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.205 |
| 8F6M Complex of Rabbit muscle pyruvate kinase with ADP and the phosphonate analogue of PEP mimicking the Michaelis complex. 提交 2022-11-16 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–531（531 aa）
链 C
1–531（531 aa）
链 D
1–531（531 aa）
链 E
1–531（531 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 SIN SUCCINIC ACID × 7 MN MANGANESE (II) ION × 8 K POTASSIUM ION × 4 ALA ALANINE × 4 GOL GLYCEROL × 13 GZ3 (E)-2-METHYL-3-PHOSPHONOACRYLATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；15 mM succinate, 50 mM KCl, 19 to 24% PEG 8,000 well solution
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.205 |