当前蛋白身份:P12263
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4MO3 Crystal Structure of Porcine C2 Domain of Blood Coagulation Factor VIII 提交 2013-09-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 M
1971–2129(159 aa)
片段:C2 domain (UNP residues 1971-2129)
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未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 10.4;277 K;2:1 crystallization buffer (0.1 M magnesium acetate, 10% ethanol) to protein, crystals formed overnight with 0.1 M CHES buffer and 220 uL Hampton Research Al's oil over 400 uL reservoir, pH 10.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.209 |
| 6MF0 Crystal Structure Determination of Human/Porcine Chimera Coagulation Factor VIII 提交 2018-09-07 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:monomeric(1) 待复核 |
链 A
1–386(386 aa)
片段:UNP residues 1-386 (pig), 387-761 (human), 762-771,1438-1820 (pig), 2039-2351 (human)
链 A
762–771(10 aa)
片段:UNP residues 1-386 (pig), 387-761 (human), 762-771,1438-1820 (pig), 2039-2351 (human)
链 A
1438–1820(383 aa)
片段:UNP residues 1-386 (pig), 387-761 (human), 762-771,1438-1820 (pig), 2039-2351 (human)
链 B
1–386(386 aa)
片段:UNP residues 1-386 (pig), 387-761 (human), 762-771,1438-1820 (pig), 2039-2351 (human)
链 B
762–771(10 aa)
片段:UNP residues 1-386 (pig), 387-761 (human), 762-771,1438-1820 (pig), 2039-2351 (human)
链 B
1438–1820(383 aa)
片段:UNP residues 1-386 (pig), 387-761 (human), 762-771,1438-1820 (pig), 2039-2351 (human)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 CU1 COPPER (I) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;16% PEG3350, 0.025 M magnesium chloride, 0.025 M HEPES
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分辨率 3.20 Å R-free 0.287 |
| 6MF0 Crystal Structure Determination of Human/Porcine Chimera Coagulation Factor VIII 提交 2018-09-07 | Assembly 2 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
1–386(386 aa)
片段:UNP residues 1-386 (pig), 387-761 (human), 762-771,1438-1820 (pig), 2039-2351 (human)
链 A
762–771(10 aa)
片段:UNP residues 1-386 (pig), 387-761 (human), 762-771,1438-1820 (pig), 2039-2351 (human)
链 A
1438–1820(383 aa)
片段:UNP residues 1-386 (pig), 387-761 (human), 762-771,1438-1820 (pig), 2039-2351 (human)
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未记录 | CA CALCIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 CU1 COPPER (I) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;16% PEG3350, 0.025 M magnesium chloride, 0.025 M HEPES
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.287 |
| 7K66 Structure of Blood Coagulation Factor VIII in Complex with an Anti-C1 Domain Pathogenic Antibody Inhibitor 提交 2020-09-18 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
1–405(405 aa)
链 A
1438–1820(383 aa)
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CU COPPER (II) ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.7;293 K;17.5 %(w/v) PEG 1500, 50 mM HEPES (pH 7.7)
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分辨率 3.92 Å R-free 0.322 |
| 7KBT Factor VIII in complex with the anti-C2 domain antibody, G99 提交 2020-10-02 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
1–386(386 aa)
链 A
762–771(10 aa)
链 A
1438–1820(383 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CU COPPER (II) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;8 - 18% PEG 1500, PEG 6K, or PEG 10K and 50mM malic acid, pH 7.
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分辨率 4.15 Å R-free 0.338 |
| 7S0P Crystal structure of Porcine Factor VIII C2 Domain Bound to Phosphatidylserine 提交 2021-08-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 M
1974–2129(156 aa)
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未记录 | SEP PHOSPHOSERINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;2:1 drop ratio
0.1 M CHES (pH 7.4)
0.1M magnesium acetate
10% ethanol (v/v)
Crystal soaked with 5 mM OPLS
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分辨率 1.30 Å R-free 0.156 |
| 8G6I Coagulation factor VIII bound to a patient-derived anti-C1 domain antibody inhibitor 提交 2023-02-15 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
1–405(405 aa)
链 A
1438–1820(383 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;150 mM NaCl, 20 mM HEPES pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.23 Å |
| 8TY1 Cryo-EM structure of coagulation factor VIII bound to NB2E9 提交 2023-08-24 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
1–391(391 aa)
链 A
1438–1820(383 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;20 mM HEPES (pH 7.4) and 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.46 Å |