当前蛋白身份：P12643
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1ES7 COMPLEX BETWEEN BMP-2 AND TWO BMP RECEPTOR IA ECTODOMAINS 提交 2000-04-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
283–396（114 aa）
链 C
283–396（114 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；296 K；sodium acetate, imidazole, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.229 |
| 1REU Structure of the bone morphogenetic protein 2 mutant L51P 提交 2003-11-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
294–396（103 aa）
片段：mature part
|
突变：L51P | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；lithium sulfate, tert-butanol, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.235 |
| 1REU Structure of the bone morphogenetic protein 2 mutant L51P 提交 2003-11-07 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
294–396（103 aa）
片段：mature part
|
突变：L51P | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；lithium sulfate, tert-butanol, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.235 |
| 1REW Structural refinement of the complex of bone morphogenetic protein 2 and its type IA receptor 提交 2003-11-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
283–396（114 aa）
片段：mature part
链 B
283–396（114 aa）
片段：mature part
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；280 K；sodium acetate, imidazole, glucose, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.229 |
| 2GOO Ternary Complex of BMP-2 bound to BMPR-Ia-ECD and ActRII-ECD 提交 2006-04-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
283–396（114 aa）
片段：Residues 283-396
链 D
283–396（114 aa）
片段：Residues 283-396
|
未记录 | NDG 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-glucopyranose × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；4M sodium formate, 100mM Hepes, 3% dioxane, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.259 |
| 2H62 Crystal structure of a ternary ligand-receptor complex of BMP-2 提交 2006-05-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
283–396（114 aa）
链 B
283–396（114 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.75；294 K；50% PPG400, 0.1M Bis-Tris, pH 5.75, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.225 |
| 2H64 Crystal structure of a ternary ligand-receptor complex of BMP-2 提交 2006-05-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
283–396（114 aa）
|
突变：L100K, N102D | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.75；294 K；30% PEG3350, 0.1M Tris-HCl pH 8.75, 0.2M NH4CH3COO, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.264 |
| 2QJ9 Crystal structure analysis of BMP-2 in complex with BMPR-IA variant B1 提交 2007-07-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
283–396（114 aa）
片段：mature part (residues 283-396)
链 B
283–396（114 aa）
片段：mature part (residues 283-396)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；298 K；0.8M K Na phosphate, 25% ethylene glycol, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.44 Å R-free 0.253 |
| 2QJA Crystal structure analysis of BMP-2 in complex with BMPR-IA variant B12 提交 2007-07-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
283–396（114 aa）
片段：mature part (residues 283-396)
链 B
283–396（114 aa）
片段：mature part (residues 283-396)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；298 K；0.8M K Na phosphate, 25% ethylene glycol, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.254 |
| 2QJB Crystal structure analysis of BMP-2 in complex with BMPR-IA variant IA/IB 提交 2007-07-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
283–396（114 aa）
片段：mature part (residues 283-396)
链 B
283–396（114 aa）
片段：mature part (residues 283-396)
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；298 K；0.8M K Na phosphate, 25% ethylene glycol, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.263 |
| 3BK3 Crystal structure of the complex of BMP-2 and the first Von Willebrand domain type C of Crossveinless-2 提交 2007-12-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
283–396（114 aa）
链 B
283–396（114 aa）
|
突变：F41M, Y91M 突变：F41M, Y91M | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；2.2M ammonium phosphate, 0.1M Tris pH 7.5, 8% glycerol, 5% sucrose, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.245 |
| 3BK3 Crystal structure of the complex of BMP-2 and the first Von Willebrand domain type C of Crossveinless-2 提交 2007-12-05 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
283–396（114 aa）
链 B
283–396（114 aa）
|
突变：F41M, Y91M 突变：F41M, Y91M | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；2.2M ammonium phosphate, 0.1M Tris pH 7.5, 8% glycerol, 5% sucrose, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.245 |
| 3BK3 Crystal structure of the complex of BMP-2 and the first Von Willebrand domain type C of Crossveinless-2 提交 2007-12-05 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
283–396（114 aa）
|
突变：F41M, Y91M | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；2.2M ammonium phosphate, 0.1M Tris pH 7.5, 8% glycerol, 5% sucrose, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.245 |
| 3BK3 Crystal structure of the complex of BMP-2 and the first Von Willebrand domain type C of Crossveinless-2 提交 2007-12-05 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
283–396（114 aa）
|
突变：F41M, Y91M | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；2.2M ammonium phosphate, 0.1M Tris pH 7.5, 8% glycerol, 5% sucrose, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.245 |
| 3BMP HUMAN BONE MORPHOGENETIC PROTEIN-2 (BMP-2) 提交 1999-03-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
283–396（114 aa）
|
未记录 | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.4；CRYSTALLIZATION CONDITIONS: PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 100 MM LITHIUM
SULFATE, 12% TERT-BUTANOL, 50 MM CITRATE, PH 5.4
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.278 |
| 4N1D Nodal/BMP2 chimera NB250 提交 2013-10-04 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
283–305（23 aa）
链 A
362–396（35 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；288 K；0.2M NaCl, 0.1 M Na acetate pH 4.6, 30% 2-Methyl-2,4-pentanediol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.204 |
| 4UHY Crystal structure of the human RGMA-BMP2 complex 提交 2015-03-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
283–396（114 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN SIGNALING DOMAIN, RESIDUES 283-396
链 B
283–396（114 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN SIGNALING DOMAIN, RESIDUES 283-396
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4；0.1 M CITRIC ACID, PH 4.0, 20% (V/V) 2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL (MPD), 0.2 M GLYCINE
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.264 |
| 4UHZ Crystal structure of the human RGMB-BMP2 complex, crystal form 1 提交 2015-03-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
283–396（114 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN SIGNALING DOMAIN, RESIDUES 283-396
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
2 M AMMONIUM SULPHATE, 8% (V/V) 2,5- HEXANEDIOL
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.229 |
| 4UI0 Crystal structure of the human RGMB-BMP2 complex, crystal form 2 提交 2015-03-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
283–396（114 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN SIGNALING DOMAIN, RESIDUES 283-396
链 B
283–396（114 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN SIGNALING DOMAIN, RESIDUES 283-396
|
未记录 | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 FLC CITRATE ANION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4；0.08 M CITRIC ACID PH 4.0, 15% (V/V) MPD
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.267 |
| 4UI1 Crystal structure of the human RGMC-BMP2 complex 提交 2015-03-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
283–396（114 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN SIGNALING DOMAIN, RESIDUES 283-396
|
未记录 | NO3 NITRATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；20% (W/V) PEG3350, 0.2 M AMMONIUM NITRATE, PH 7.5
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.238 |
| 4UI1 Crystal structure of the human RGMC-BMP2 complex 提交 2015-03-27 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
283–396（114 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN SIGNALING DOMAIN, RESIDUES 283-396
|
未记录 | NO3 NITRATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；20% (W/V) PEG3350, 0.2 M AMMONIUM NITRATE, PH 7.5
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.238 |
| 4UI2 Crystal structure of the ternary RGMB-BMP2-NEO1 complex 提交 2015-03-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
283–396（114 aa）
片段：C-TERMINAL DOMAIN SIGNALING DOMAIN
|
未记录 | SRT S,R MESO-TARTARIC ACID × 6 ACT ACETATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.1 M TRIS-HCL PH 8.5, 1.5 M AMMONIUM SULPHATE, 12% (V/V) GLYCEROL
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.236 |
| 6OMN Glycosylated BMP2 homodimer 提交 2019-04-19 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
289–396（108 aa）
链 F
289–396（108 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100mM TrisHCl pH 8.5, 100mM NaCl, 12% MPD
|
分辨率 2.68 Å R-free 0.243 |
| 6OMN Glycosylated BMP2 homodimer 提交 2019-04-19 | Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
289–396（108 aa）
链 H
289–396（108 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100mM TrisHCl pH 8.5, 100mM NaCl, 12% MPD
|
分辨率 2.68 Å R-free 0.243 |
| 7AG0 Complex between the bone morphogenetic protein 2 and its antagonist Noggin 提交 2020-09-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
283–396（114 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；1.4 M NaKPO4
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.280 |
| 8E3G BMP2/GDF5 heterodimer 提交 2022-08-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
283–396（114 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；Tris, magnesium formate
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.234 |
| 8E3G BMP2/GDF5 heterodimer 提交 2022-08-17 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
283–396（114 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；Tris, magnesium formate
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.234 |