当前蛋白身份：P13255
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1BHJ CRYSTAL STRUCTURE OF APO-GLYCINE N-METHYLTRANSFERASE (GNMT) 提交 1998-06-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–292（292 aa）
链 B
1–292（292 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.8；pH 6.8
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.318 |
| 1D2C METHYLTRANSFERASE 提交 1999-09-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–293（292 aa）
链 B
2–293（292 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；277 K；PEG 3400, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 4.0K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.233 |
| 1D2C METHYLTRANSFERASE 提交 1999-09-23 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–293（292 aa）
链 B
2–293（292 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；277 K；PEG 3400, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 4.0K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.233 |
| 1D2G CRYSTAL STRUCTURE OF R175K MUTANT GLYCINE N-METHYLTRANSFERASE FROM RAT LIVER 提交 1999-10-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–293（292 aa）
片段：WHOLE ENZYME
链 B
2–293（292 aa）
片段：WHOLE ENZYME
|
突变：R175K 突变：R175K | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；PEG-4000, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.266 |
| 1D2G CRYSTAL STRUCTURE OF R175K MUTANT GLYCINE N-METHYLTRANSFERASE FROM RAT LIVER 提交 1999-10-08 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–293（292 aa）
片段：WHOLE ENZYME
链 B
2–293（292 aa）
片段：WHOLE ENZYME
|
突变：R175K 突变：R175K | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；PEG-4000, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.266 |
| 1D2H CRYSTAL STRUCTURE OF R175K MUTANT GLYCINE N-METHYLTRANSFERASE COMPLEXED WITH S-ADENOSYLHOMOCYSTEINE 提交 1999-10-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–293（292 aa）
片段：WHOLE ENZYME
链 B
2–293（292 aa）
片段：WHOLE ENZYME
链 C
2–293（292 aa）
片段：WHOLE ENZYME
链 D
2–293（292 aa）
片段：WHOLE ENZYME
|
突变：R175K 突变：R175K 突变：R175K 突变：R175K | SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；PEG-4000, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.247 |
| 1KIA Crystal structure of glycine N-methyltransferase complexed with S-adenosylmethionine and acetate 提交 2001-12-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–292（292 aa）
链 B
1–292（292 aa）
链 C
1–292（292 aa）
链 D
1–292（292 aa）
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 4 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；PEG 6000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.286 |
| 1NBH Structure of glycine N-methyltransferase complexed with S-adenosylmethionine and acetate, GNMT:SAM:Ace 提交 2002-12-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–292（292 aa）
链 B
1–292（292 aa）
链 C
1–292（292 aa）
链 D
1–292（292 aa）
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 4 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；296 K；PEG 3400, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.278 |
| 1NBI Structure of R175K mutated glycine N-methyltransferase complexed with S-adenosylmethionine, R175K:SAM. 提交 2002-12-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–292（292 aa）
链 B
1–292（292 aa）
链 C
1–292（292 aa）
链 D
1–292（292 aa）
|
突变：R175K 突变：R175K 突变：R175K 突变：R175K | SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；296 K；PEG 3400, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.295 |
| 1XVA METHYLTRANSFERASE 提交 1996-07-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–292（292 aa）
链 B
1–292（292 aa）
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 4 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.6；pH 5.6
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.262 |
| 2IDJ Crystal Structure of Rat Glycine N-Methyltransferase Apoprotein, Monoclinic Form 提交 2006-09-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–292（292 aa）
链 B
1–292（292 aa）
链 C
1–292（292 aa）
链 D
1–292（292 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；20% PEG 3350, 0.1 M Ca acetate, 0.025 M Tris, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.272 |
| 2IDK Crystal Structure of Rat Glycine N-Methyltransferase Complexed With Folate 提交 2006-09-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–292（292 aa）
链 B
1–292（292 aa）
链 C
1–292（292 aa）
链 D
1–292（292 aa）
|
未记录 | C2F 5-METHYL-5,6,7,8-TETRAHYDROFOLIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；20% PEG 3350, 0.1 M Ca acetate, 0.025 M Tris, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.298 |
| 3THR Crystal structure of rat native liver Glycine N-methyltransferase complexed with 5-methyltetrahydrofolate monoglutamate 提交 2011-08-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–293（292 aa）
链 B
2–293（292 aa）
链 C
2–293（292 aa）
链 D
2–293（292 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | C2F 5-METHYL-5,6,7,8-TETRAHYDROFOLIC ACID × 4 TAM TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；20% PEG 3350, 0.2 M Na-fluoride or Ca-acetate, 100 mM Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.241 |
| 3THS Crystal structure of rat native liver Glycine N-methyltransferase complexed with 5-methyltetrahydrofolate pentaglutamate 提交 2011-08-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
2–293（292 aa）
链 B
2–293（292 aa）
链 C
2–293（292 aa）
链 D
2–293（292 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 1 TAM TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；20% PEG 3350, 0.2 M Na-fluoride or Ca-acetate, 100 mM Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.280 |