当前蛋白身份：P14151
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2LGF Solution structure of Ca2+/calmodulin complexed with a peptide representing the calmodulin-binding domain of L-selectin 提交 2011-07-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
349–363（15 aa）
片段：sequence database residues 349-363
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.8；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.3；压力 ambient
NMR样品组成
0.5-0.8 mM [U-13C; U-15N] protein_1, 0.5-0.8 mM protein_2, 4 mM CALCIUM ION, 0.5 mM DSS, 100 mM potassium chloride, 0.03 % sodium azide, 20 mM Bis-Tris, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5-0.8 mM [U-2H; U-15N] protein_1, 0.5-0.8 mM protein_2, 4 mM CALCIUM ION, 0.5 mM DSS, 100 mM potassium chloride, 0.03 % sodium azide, 20 mM Bis-Tris, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5-0.8 mM [1H/13C-methyl Met; U-2H; U-15N] protein_1, 0.5-0.8 mM protein_2, 4 mM CALCIUM ION, 0.5 mM DSS, 100 mM potassium chloride, 0.03 % sodium azide, 20 mM Bis-Tris, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.5-0.8 mM [U-13C; U-15N] protein_1, 0.5-0.8 mM protein_2, 4 mM CALCIUM ION, 0.5 mM DSS, 300 mM potassium chloride, 0.03 % sodium azide, 20 mM Bis-Tris, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5-0.8 mM [U-13C; U-15N] protein_1, 0.5-0.8 mM protein_2, 4 mM CALCIUM ION, 0.5 mM DSS, 300 mM potassium chloride, 0.03 % sodium azide, 20 mM Bis-Tris, 16 w/v Pf1 phage, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 3CFW L-selectin lectin and EGF domains 提交 2008-03-04 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
39–194（156 aa）
片段：EGF domain (UNP residues 39-194)
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.17 M Sodium acetate trihydrate, 0.085 M Tris-HCl, pH 8.5, 25.5 % w/v PEG 4000,15% v/v Glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.248 |
| 5VC1 Crystal structure of L-selectin lectin/EGF domains 提交 2017-03-30 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
39–195（157 aa）
片段：UNP residues 39-195
|
突变：N22Q, N139Q | PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 GOL GLYCEROL × 1 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；100 mM sodium cacodylate pH 7.5, 200 mM calcium acetate, 40% (v/v) PEG 600
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分辨率 1.94 Å R-free 0.231 |