当前蛋白身份:P14598 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1GD5 SOLUTION STRUCTURE OF THE PX DOMAIN FROM HUMAN P47PHOX NADPH OXIDASE 提交 2000-09-14 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–128(128 aa) 片段:PX DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5.5;293 K;离子强度(mmCIF原始值)0;压力 1
NMR样品组成 0.6mM PX domain U-15N,13C; 5mM Na-MES buffer; 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
1K4U Solution structure of the C-terminal SH3 domain of p67phox complexed with the C-terminal tail region of p47phox 提交 2001-10-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 P 359–390(32 aa) 片段:TAIL PEPTIDE (RESIDUES 359-390)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.1;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100mM KCl;压力 1
NMR样品组成 0.7mM p67SH3(C) U-15N,13C; 0.77mM p47 tail peptide; 5mM MOPSO buffer; 30 mM d10-DTT; 100mM KCl | 90% H2O, 10% D2O; 100% D2O
NMR样品组成 0.5mM p47 tail peptide U-15N,13C; 0.55mM p67SH3(C); 5mM MOPSO buffer; 30mM d10-DTT; 100mM KCl | 90% H2O, 10% D2O; 100% D2O
分辨率未提供
1KQ6 p47phox PX domain 提交 2002-01-04 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–141(141 aa) 片段:PX domain
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.6;291 K;PEG 550 DME, glycerol, ammonium sulfate, natrium citrate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.18 Å R-free 0.185
1NG2 Structure of autoinhibited p47phox 提交 2002-12-16 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 156–340(185 aa) 片段:residues 156-340
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;291 K;PEG 3000, sodium citrate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.70 Å R-free 0.233
1NG2 Structure of autoinhibited p47phox 提交 2002-12-16 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 156–340(185 aa) 片段:residues 156-340
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;291 K;PEG 3000, sodium citrate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.70 Å R-free 0.233
1O7K human p47 PX domain complex with sulphates 提交 2002-11-07 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–123(123 aa) 片段:PX DOMAIN, RESIDUES 1-123
链 B 1–123(123 aa) 片段:PX DOMAIN, RESIDUES 1-123
链 C 1–123(123 aa) 片段:PX DOMAIN, RESIDUES 1-123
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) SO4 SULFATE ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5;1 M AMMONIUM SULPHATE, 0.1M TRIS PH 8.5, 12% GLYCEROL
分辨率 2.00 Å R-free 0.254
1OV3 Structure of the p22phox-p47phox complex 提交 2003-03-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 156–285(130 aa) 片段:Residues 156-285
链 B 156–285(130 aa) 片段:Residues 156-285
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;1 M Na-Citrate, 0.1 M Na-cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.80 Å R-free 0.275
1OV3 Structure of the p22phox-p47phox complex 提交 2003-03-25 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 156–285(130 aa) 片段:Residues 156-285
链 B 156–285(130 aa) 片段:Residues 156-285
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;1 M Na-Citrate, 0.1 M Na-cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.80 Å R-free 0.275
1UEC Crystal structure of autoinhibited form of tandem SH3 domain of p47phox 提交 2003-05-11 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 151–340(190 aa) 片段:autoinhibited tandem SH3 domain, redidues 151-340
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.4;293 K;16% PEG 6000, 0.1M soduim citrate, 50mM sodium fluoride, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.82 Å R-free 0.236
1UEC Crystal structure of autoinhibited form of tandem SH3 domain of p47phox 提交 2003-05-11 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 151–340(190 aa) 片段:autoinhibited tandem SH3 domain, redidues 151-340
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.4;293 K;16% PEG 6000, 0.1M soduim citrate, 50mM sodium fluoride, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.82 Å R-free 0.236
1W70 SH3 domain of p40phox complexed with C-terminal polyProline region of p47phox 提交 2004-08-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 360–372(13 aa) 片段:POLYPROLINE MOTIF, RESIDUES 360-372
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;293 K;VAPOR DIFFUSION AT 20 DEGRE C AT 14MG/ML OF P40PHOX SH3 WITH A1/5 RATIO WITH POLYPROLINE PEPTIDE, 20 MM HEPES PH 7.5, 150 MM NACL MIXED WITH 100 MM NA-CITRATE/CITRIC ACID PH5, 2.4 M SA
分辨率 1.46 Å R-free 0.207
1W70 SH3 domain of p40phox complexed with C-terminal polyProline region of p47phox 提交 2004-08-26 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 360–372(13 aa) 片段:POLYPROLINE MOTIF, RESIDUES 360-372
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) SO4 SULFATE ION × 3 TFA trifluoroacetic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;293 K;VAPOR DIFFUSION AT 20 DEGRE C AT 14MG/ML OF P40PHOX SH3 WITH A1/5 RATIO WITH POLYPROLINE PEPTIDE, 20 MM HEPES PH 7.5, 150 MM NACL MIXED WITH 100 MM NA-CITRATE/CITRIC ACID PH5, 2.4 M SA
分辨率 1.46 Å R-free 0.207
1WLP Solution Structure Of The P22Phox-P47Phox Complex 提交 2004-06-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 151–286(136 aa) 片段:Tandem SH3 domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
7YXW Structure of the p22phox A200G mutant in complex with p47phox peptide 提交 2022-02-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 156–285(130 aa)
突变:A200G 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;0.1 M HEPES pH 7.5, 1.2 M sodium citrate tribasic dihydrate, 1:1 protein:precipitant ratio
分辨率 2.50 Å R-free 0.269
8WEJ Structure of human phagocyte NADPH oxidase in the activated state 提交 2023-09-18 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 C 1–286(286 aa)
未记录 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 NDP NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 1 FDA DIHYDROFLAVINE-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å