当前蛋白身份:P14859
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1CQT CRYSTAL STRUCTURE OF A TERNARY COMPLEX CONTAINING AN OCA-B PEPTIDE, THE OCT-1 POU DOMAIN, AND AN OCTAMER ELEMENT 提交 1999-08-11 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致 |
链 A
277–439(163 aa)
片段:OCT-1 POU DOMAIN, RESIDUES 278-439
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;pH 7.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.326 |
| 1CQT CRYSTAL STRUCTURE OF A TERNARY COMPLEX CONTAINING AN OCA-B PEPTIDE, THE OCT-1 POU DOMAIN, AND AN OCTAMER ELEMENT 提交 1999-08-11 | Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致 |
链 B
277–439(163 aa)
片段:OCT-1 POU DOMAIN, RESIDUES 278-439
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;pH 7.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.326 |
| 1E3O Crystal structure of Oct-1 POU dimer bound to MORE 提交 2000-06-20 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:hexameric(6) 与全部聚合物一致 |
链 C
280–438(159 aa)
片段:DNA-BINDING DOMAIN
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突变:YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7;22% PEG3350, 50MM HEPES, PH 7.0, 1.8MM SPERMINE
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分辨率 1.90 Å R-free 0.242 |
| 1GT0 Crystal structure of a POU/HMG/DNA ternary complex 提交 2002-01-09 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致 |
链 C
280–438(159 aa)
片段:POU DOMAIN RESIDUES 280-438
|
突变:YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7;18% PEG3350, 50 MM HEPES PH 7.0, 20 MM MGCL2, 5% GLYCEROL
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分辨率 2.60 Å R-free 0.285 |
| 1HF0 Crystal structure of the DNA-binding domain of Oct-1 bound to DNA as a dimer 提交 2000-11-27 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致 |
链 A
280–438(159 aa)
片段:DNA-BINDING DOMAIN
链 B
280–438(159 aa)
片段:DNA-BINDING DOMAIN
|
突变:YES 突变:YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.3;pH 5.30
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分辨率 2.70 Å R-free 0.294 |
| 1O4X TERNARY COMPLEX OF THE DNA BINDING DOMAINS OF THE OCT1 AND SOX2 TRANSCRIPTION FACTORS WITH A 19MER OLIGONUCLEOTIDE FROM THE HOXB1 REGULATORY ELEMENT 提交 2003-07-17 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致 |
链 A
303–465(163 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5;303 K;离子强度(mmCIF原始值)10 mM SODIUM PHOSPHATE
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分辨率未提供 |
| 1OCT CRYSTAL STRUCTURE OF THE OCT-1 POU DOMAIN BOUND TO AN OCTAMER SITE: DNA RECOGNITION WITH TETHERED DNA-BINDING MODULES 提交 1994-05-09 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致 |
链 C
284–439(156 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.00 Å |
| 1POG SOLUTION STRUCTURE OF THE OCT-1 POU-HOMEO DOMAIN DETERMINED BY NMR AND RESTRAINED MOLECULAR DYNAMICS 提交 1994-10-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
378–437(60 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1POU THE SOLUTION STRUCTURE OF THE OCT-1 POU-SPECIFIC DOMAIN REVEALS A STRIKING SIMILARITY TO THE BACTERIOPHAGE LAMBDA REPRESSOR DNA-BINDING DOMAIN 提交 1993-06-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
284–354(71 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |