当前蛋白身份:P14859 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1CQT CRYSTAL STRUCTURE OF A TERNARY COMPLEX CONTAINING AN OCA-B PEPTIDE, THE OCT-1 POU DOMAIN, AND AN OCTAMER ELEMENT 提交 1999-08-11 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 A 277–439(163 aa) 片段:OCT-1 POU DOMAIN, RESIDUES 278-439
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;pH 7.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.326
1CQT CRYSTAL STRUCTURE OF A TERNARY COMPLEX CONTAINING AN OCA-B PEPTIDE, THE OCT-1 POU DOMAIN, AND AN OCTAMER ELEMENT 提交 1999-08-11 Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 B 277–439(163 aa) 片段:OCT-1 POU DOMAIN, RESIDUES 278-439
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;pH 7.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.326
1E3O Crystal structure of Oct-1 POU dimer bound to MORE 提交 2000-06-20 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:hexameric(6) 与全部聚合物一致
链 C 280–438(159 aa) 片段:DNA-BINDING DOMAIN
突变:YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7;22% PEG3350, 50MM HEPES, PH 7.0, 1.8MM SPERMINE
分辨率 1.90 Å R-free 0.242
1GT0 Crystal structure of a POU/HMG/DNA ternary complex 提交 2002-01-09 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 C 280–438(159 aa) 片段:POU DOMAIN RESIDUES 280-438
突变:YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7;18% PEG3350, 50 MM HEPES PH 7.0, 20 MM MGCL2, 5% GLYCEROL
分辨率 2.60 Å R-free 0.285
1HF0 Crystal structure of the DNA-binding domain of Oct-1 bound to DNA as a dimer 提交 2000-11-27 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 A 280–438(159 aa) 片段:DNA-BINDING DOMAIN
链 B 280–438(159 aa) 片段:DNA-BINDING DOMAIN
突变:YES 突变:YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.3;pH 5.30
分辨率 2.70 Å R-free 0.294
1O4X TERNARY COMPLEX OF THE DNA BINDING DOMAINS OF THE OCT1 AND SOX2 TRANSCRIPTION FACTORS WITH A 19MER OLIGONUCLEOTIDE FROM THE HOXB1 REGULATORY ELEMENT 提交 2003-07-17 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致
链 A 303–465(163 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5;303 K;离子强度(mmCIF原始值)10 mM SODIUM PHOSPHATE
分辨率未提供
1OCT CRYSTAL STRUCTURE OF THE OCT-1 POU DOMAIN BOUND TO AN OCTAMER SITE: DNA RECOGNITION WITH TETHERED DNA-BINDING MODULES 提交 1994-05-09 Assembly 1 蛋白–DNA 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致
链 C 284–439(156 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.00 Å
1POG SOLUTION STRUCTURE OF THE OCT-1 POU-HOMEO DOMAIN DETERMINED BY NMR AND RESTRAINED MOLECULAR DYNAMICS 提交 1994-10-12 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 378–437(60 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
1POU THE SOLUTION STRUCTURE OF THE OCT-1 POU-SPECIFIC DOMAIN REVEALS A STRIKING SIMILARITY TO THE BACTERIOPHAGE LAMBDA REPRESSOR DNA-BINDING DOMAIN 提交 1993-06-14 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 284–354(71 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供