当前蛋白身份：P15529
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1CKL N-TERMINAL TWO DOMAINS OF HUMAN CD46 (MEMBRANE COFACTOR PROTEIN, MCP) 提交 1999-04-22 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
35–160（126 aa）
片段：N-TERMINAL TWO SCR DOMAINS
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未记录 | CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；16% PEG 8000, 40 MM CACL2, 100 MM NA-CACODYLATE PH 6.5, 7 MG/ML PROTEIN, 20C, pH 6.50
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分辨率 3.10 Å R-free 0.298 |
| 1CKL N-TERMINAL TWO DOMAINS OF HUMAN CD46 (MEMBRANE COFACTOR PROTEIN, MCP) 提交 1999-04-22 | Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
35–160（126 aa）
片段：N-TERMINAL TWO SCR DOMAINS
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未记录 | CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；16% PEG 8000, 40 MM CACL2, 100 MM NA-CACODYLATE PH 6.5, 7 MG/ML PROTEIN, 20C, pH 6.50
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.298 |
| 1CKL N-TERMINAL TWO DOMAINS OF HUMAN CD46 (MEMBRANE COFACTOR PROTEIN, MCP) 提交 1999-04-22 | Assembly 3 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
35–160（126 aa）
片段：N-TERMINAL TWO SCR DOMAINS
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未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；16% PEG 8000, 40 MM CACL2, 100 MM NA-CACODYLATE PH 6.5, 7 MG/ML PROTEIN, 20C, pH 6.50
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分辨率 3.10 Å R-free 0.298 |
| 1CKL N-TERMINAL TWO DOMAINS OF HUMAN CD46 (MEMBRANE COFACTOR PROTEIN, MCP) 提交 1999-04-22 | Assembly 4 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
35–160（126 aa）
片段：N-TERMINAL TWO SCR DOMAINS
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未记录 | CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；16% PEG 8000, 40 MM CACL2, 100 MM NA-CACODYLATE PH 6.5, 7 MG/ML PROTEIN, 20C, pH 6.50
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分辨率 3.10 Å R-free 0.298 |
| 1CKL N-TERMINAL TWO DOMAINS OF HUMAN CD46 (MEMBRANE COFACTOR PROTEIN, MCP) 提交 1999-04-22 | Assembly 5 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
35–160（126 aa）
片段：N-TERMINAL TWO SCR DOMAINS
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未记录 | CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；16% PEG 8000, 40 MM CACL2, 100 MM NA-CACODYLATE PH 6.5, 7 MG/ML PROTEIN, 20C, pH 6.50
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分辨率 3.10 Å R-free 0.298 |
| 1CKL N-TERMINAL TWO DOMAINS OF HUMAN CD46 (MEMBRANE COFACTOR PROTEIN, MCP) 提交 1999-04-22 | Assembly 6 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 F
35–160（126 aa）
片段：N-TERMINAL TWO SCR DOMAINS
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未记录 | CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；16% PEG 8000, 40 MM CACL2, 100 MM NA-CACODYLATE PH 6.5, 7 MG/ML PROTEIN, 20C, pH 6.50
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.298 |
| 2O39 Human Adenovirus type 11 knob in complex with domains SCR1 and SCR2 of CD46 (membrane cofactor protein, MCP) 提交 2006-12-01 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 C
35–160（126 aa）
片段：SCR1 and SCR 2 domains
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未记录 | CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；35% PEG 200, 200mM CaCl2, 100mM Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.273 |
| 2O39 Human Adenovirus type 11 knob in complex with domains SCR1 and SCR2 of CD46 (membrane cofactor protein, MCP) 提交 2006-12-01 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 D
35–160（126 aa）
片段：SCR1 and SCR 2 domains
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；35% PEG 200, 200mM CaCl2, 100mM Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.273 |
| 3INB Structure of the measles virus hemagglutinin bound to the CD46 receptor 提交 2009-08-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
35–160（126 aa）
片段：Sushi domains 1 and 2, residues 35-160
链 D
35–160（126 aa）
片段：Sushi domains 1 and 2, residues 35-160
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；293 K；12% PEG-8000, 0.2 M Ammonium Sulphate 2% PEG-400, 1% 1,2,3 heptanetriol, 1 mM Sodium Tungstate, 0.1 M Mes, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 3.10 Å R-free 0.259 |
| 3L89 Human Adenovirus type 21 knob in complex with domains SCR1 and SCR2 of CD46 (membrane cofactor protein, MCP) 提交 2009-12-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 M
35–160（126 aa）
片段：CD46 SCR1 and SCR2 domains (UNP residues 35-160)
链 N
35–160（126 aa）
片段：CD46 SCR1 and SCR2 domains (UNP residues 35-160)
链 O
35–160（126 aa）
片段：CD46 SCR1 and SCR2 domains (UNP residues 35-160)
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；298 K；6% PEG 8000, 0.1M LiCl, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.239 |
| 3L89 Human Adenovirus type 21 knob in complex with domains SCR1 and SCR2 of CD46 (membrane cofactor protein, MCP) 提交 2009-12-30 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 P
35–160（126 aa）
片段：CD46 SCR1 and SCR2 domains (UNP residues 35-160)
链 Q
35–160（126 aa）
片段：CD46 SCR1 and SCR2 domains (UNP residues 35-160)
链 R
35–160（126 aa）
片段：CD46 SCR1 and SCR2 domains (UNP residues 35-160)
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；298 K；6% PEG 8000, 0.1M LiCl, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.239 |
| 3L89 Human Adenovirus type 21 knob in complex with domains SCR1 and SCR2 of CD46 (membrane cofactor protein, MCP) 提交 2009-12-30 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 S
35–160（126 aa）
片段：CD46 SCR1 and SCR2 domains (UNP residues 35-160)
链 T
35–160（126 aa）
片段：CD46 SCR1 and SCR2 domains (UNP residues 35-160)
链 U
35–160（126 aa）
片段：CD46 SCR1 and SCR2 domains (UNP residues 35-160)
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；298 K；6% PEG 8000, 0.1M LiCl, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.239 |
| 3L89 Human Adenovirus type 21 knob in complex with domains SCR1 and SCR2 of CD46 (membrane cofactor protein, MCP) 提交 2009-12-30 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 V
35–160（126 aa）
片段：CD46 SCR1 and SCR2 domains (UNP residues 35-160)
链 W
35–160（126 aa）
片段：CD46 SCR1 and SCR2 domains (UNP residues 35-160)
链 X
35–160（126 aa）
片段：CD46 SCR1 and SCR2 domains (UNP residues 35-160)
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；298 K；6% PEG 8000, 0.1M LiCl, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
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分辨率 3.50 Å R-free 0.239 |
| 3O8E Structure of extracelllar portion of CD46 in complex with Adenovirus type 11 knob 提交 2010-08-03 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
35–286（252 aa）
片段：CD46 SCR1-SCR4 (UNP RESIDUES 35-286)
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未记录 | DTD DITHIANE DIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8；298 K；microseeding, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
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分辨率 2.84 Å R-free 0.229 |
| 3O8E Structure of extracelllar portion of CD46 in complex with Adenovirus type 11 knob 提交 2010-08-03 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 D
35–286（252 aa）
片段：CD46 SCR1-SCR4 (UNP RESIDUES 35-286)
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未记录 | DTD DITHIANE DIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8；298 K；microseeding, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 2.84 Å R-free 0.229 |
| 5FO8 Crystal Structure of Human Complement C3b in Complex with MCP (CCP1-4) 提交 2015-11-18 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
35–286（252 aa）
片段：CCP DOMAINS 1-4, UNP RESIDUES 35-286
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未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 32 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
100MM AMMONIUM CITRATE 7% PEG 3350 5MM GLUTATHIONE 50MM BIS-TRIS PROPANE, PH 6.5
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分辨率 2.40 Å R-free 0.219 |
| 8QK3 Human Adenovirus type 11 fiber knob in complex with its cell receptors, Desmoglein-2 and CD46 提交 2023-09-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
1–392（392 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.20 Å |