当前蛋白身份：P15731
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1QCQ UBIQUITIN CONJUGATING ENZYME 提交 1999-05-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–148（148 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；PEG 8000, MAGNESIUM ACETATE, CACODYLATE, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
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分辨率 2.70 Å R-free 0.296 |
| 5AIE Not4 ring domain in complex with Ubc4 提交 2015-02-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–148（148 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；10% (W/V) PEG 8000, 0.02 M OF L-NA-GLUTAMATE, 0.02 M OF ALANINE (RACEMIC), 0.02 M OF GLYCINE, 0.02 M OF LYSINE HCL (RACEMIC), 0.02 M OF SERINE (RACEMIC), 0.1 M BICINE PH 8.5 AND 20% (W/V) ETHYLENE GLYCOL AS CRYSTALLIZATION BUFFER AT ROOM TEMPERATURE.
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分辨率 2.80 Å R-free 0.271 |
| 8J1R cryo-EM structures of Ufd4 in complex with Ubc4-Ub 提交 2023-04-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–148（148 aa）
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突变：C22S,C108S | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.52 Å |
| 9KHS Cryo-EM structure of Ufd2/Ubc4-Ub in complex with K29-linked diUb (monomeric conformation) 提交 2024-11-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 B
1–148（148 aa）
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突变：C22S/C102S | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.31 Å |
| 9KHT cryo-EM structure of Ufd2/Ubc4-Ub in complex with K29-linked triUb (dimeric conformation) 提交 2024-11-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12） 与蛋白数一致 |
链 B
1–148（148 aa）
链 b
1–148（148 aa）
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突变：C22S/C108S 突变：C22S/C108S | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.85 Å |
| 9M7O Cryo-EM structure of Ufd2/Ubc4-ub complex with K29triUb(monomeric conformation) 提交 2025-03-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 B
1–148（148 aa）
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突变：C22S/C102S | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 4.14 Å |