当前蛋白身份：P16104
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2D31 Crystal structure of disulfide-linked HLA-G dimer 提交 2005-09-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
78–86（9 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.5；293 K；CAPS, PEG8000, NaCl, pH 10.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.298 |
| 2D31 Crystal structure of disulfide-linked HLA-G dimer 提交 2005-09-23 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 F
78–86（9 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.5；293 K；CAPS, PEG8000, NaCl, pH 10.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.298 |
| 2DYP Crystal Structure of LILRB2(LIR2/ILT4/CD85d) complexed with HLA-G 提交 2006-09-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
78–86（9 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M Tris-HCl pH8.0, 45% PEG400, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.278 |
| 3SHV Crystal structure of human MCPH1 tandem BRCT domains-gamma H2AX complex 提交 2011-06-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
134–143（10 aa）
片段：residues in UNP 134-143
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.2M Sodium acetate trihydrate, 100mM TRIS hydrochloride(pH 8.5), 30%(w/v) PEG4000 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.242 |
| 3SHV Crystal structure of human MCPH1 tandem BRCT domains-gamma H2AX complex 提交 2011-06-17 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
134–143（10 aa）
片段：residues in UNP 134-143
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.2M Sodium acetate trihydrate, 100mM TRIS hydrochloride(pH 8.5), 30%(w/v) PEG4000 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.242 |
| 3SQD Crystal structure of human PTIP BRCT5/6-gamma H2AX complex 提交 2011-07-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
134–143（10 aa）
片段：UNP residues 134-143
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；287 K；18% PEG4000, 100mM Nacacodylate, pH 6.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 287K
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.248 |
| 3SQD Crystal structure of human PTIP BRCT5/6-gamma H2AX complex 提交 2011-07-05 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
134–143（10 aa）
片段：UNP residues 134-143
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；287 K；18% PEG4000, 100mM Nacacodylate, pH 6.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 287K
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.248 |
| 3SZM STRUCTURE OF HUMAN MICROCEPHALIN (MCPH1) TANDEM BRCT DOMAINS IN COMPLEX WITH A GAMMA-H2AX PHOSPHOPEPTIDE 提交 2011-07-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 I
134–143（10 aa）
片段：C-TERMINAL FRAGMENT, RESIDUES 134-143
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；20% PEG 4000, 0.1M (NH4)H2PO4, 0.1M BIS-TRIS-PROPANE , PH 4.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 295K
|
分辨率 2.63 Å R-free 0.252 |
| 3SZM STRUCTURE OF HUMAN MICROCEPHALIN (MCPH1) TANDEM BRCT DOMAINS IN COMPLEX WITH A GAMMA-H2AX PHOSPHOPEPTIDE 提交 2011-07-19 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 J
134–143（10 aa）
片段：C-TERMINAL FRAGMENT, RESIDUES 134-143
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；20% PEG 4000, 0.1M (NH4)H2PO4, 0.1M BIS-TRIS-PROPANE , PH 4.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 295K
|
分辨率 2.63 Å R-free 0.252 |
| 3SZM STRUCTURE OF HUMAN MICROCEPHALIN (MCPH1) TANDEM BRCT DOMAINS IN COMPLEX WITH A GAMMA-H2AX PHOSPHOPEPTIDE 提交 2011-07-19 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 K
134–143（10 aa）
片段：C-TERMINAL FRAGMENT, RESIDUES 134-143
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；20% PEG 4000, 0.1M (NH4)H2PO4, 0.1M BIS-TRIS-PROPANE , PH 4.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 295K
|
分辨率 2.63 Å R-free 0.252 |
| 3SZM STRUCTURE OF HUMAN MICROCEPHALIN (MCPH1) TANDEM BRCT DOMAINS IN COMPLEX WITH A GAMMA-H2AX PHOSPHOPEPTIDE 提交 2011-07-19 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 L
134–143（10 aa）
片段：C-TERMINAL FRAGMENT, RESIDUES 134-143
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；20% PEG 4000, 0.1M (NH4)H2PO4, 0.1M BIS-TRIS-PROPANE , PH 4.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 295K
|
分辨率 2.63 Å R-free 0.252 |
| 3SZM STRUCTURE OF HUMAN MICROCEPHALIN (MCPH1) TANDEM BRCT DOMAINS IN COMPLEX WITH A GAMMA-H2AX PHOSPHOPEPTIDE 提交 2011-07-19 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 M
134–143（10 aa）
片段：C-TERMINAL FRAGMENT, RESIDUES 134-143
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；20% PEG 4000, 0.1M (NH4)H2PO4, 0.1M BIS-TRIS-PROPANE , PH 4.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 295K
|
分辨率 2.63 Å R-free 0.252 |
| 3SZM STRUCTURE OF HUMAN MICROCEPHALIN (MCPH1) TANDEM BRCT DOMAINS IN COMPLEX WITH A GAMMA-H2AX PHOSPHOPEPTIDE 提交 2011-07-19 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 N
134–143（10 aa）
片段：C-TERMINAL FRAGMENT, RESIDUES 134-143
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；20% PEG 4000, 0.1M (NH4)H2PO4, 0.1M BIS-TRIS-PROPANE , PH 4.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 295K
|
分辨率 2.63 Å R-free 0.252 |
| 3SZM STRUCTURE OF HUMAN MICROCEPHALIN (MCPH1) TANDEM BRCT DOMAINS IN COMPLEX WITH A GAMMA-H2AX PHOSPHOPEPTIDE 提交 2011-07-19 | Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 O
134–143（10 aa）
片段：C-TERMINAL FRAGMENT, RESIDUES 134-143
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；20% PEG 4000, 0.1M (NH4)H2PO4, 0.1M BIS-TRIS-PROPANE , PH 4.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 295K
|
分辨率 2.63 Å R-free 0.252 |
| 3SZM STRUCTURE OF HUMAN MICROCEPHALIN (MCPH1) TANDEM BRCT DOMAINS IN COMPLEX WITH A GAMMA-H2AX PHOSPHOPEPTIDE 提交 2011-07-19 | Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 P
134–143（10 aa）
片段：C-TERMINAL FRAGMENT, RESIDUES 134-143
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；20% PEG 4000, 0.1M (NH4)H2PO4, 0.1M BIS-TRIS-PROPANE , PH 4.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 295K
|
分辨率 2.63 Å R-free 0.252 |
| 6K1I Human nucleosome core particle with gammaH2A.X variant 提交 2019-05-10 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–143（143 aa）
链 G
1–143（143 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 23 K POTASSIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291.15 K；potassium chloride, manganese chloride, potassium cacodylate
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.277 |
| 6K1J Human nucleosome core particle with H2A.X variant 提交 2019-05-10 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–143（143 aa）
链 G
1–143（143 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291.15 K；Potassium Chloride, Manganese Chloride, Potassium Cacodylate
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.319 |
| 6K1K Human nucleosome core particle with H2A.X S139E variant 提交 2019-05-10 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–143（143 aa）
链 G
1–143（143 aa）
|
突变：S139E variant 突变：S139E variant | CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 33 K POTASSIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291.15 K；potassium chloride, manganese chloride, potassium cacodylate
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.275 |
| 6ZWK Crystal structure of the phosphorylated C-terminal tail of histone H2AX in complex with a specific nanobody (C6 gammaXbody) 提交 2020-07-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
134–143（10 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% PEG 3350, 0.2M Sodium acetate
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.184 |
| 6ZWK Crystal structure of the phosphorylated C-terminal tail of histone H2AX in complex with a specific nanobody (C6 gammaXbody) 提交 2020-07-28 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
134–143（10 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% PEG 3350, 0.2M Sodium acetate
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.184 |
| 6ZWK Crystal structure of the phosphorylated C-terminal tail of histone H2AX in complex with a specific nanobody (C6 gammaXbody) 提交 2020-07-28 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 I
134–143（10 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% PEG 3350, 0.2M Sodium acetate
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.184 |
| 6ZWK Crystal structure of the phosphorylated C-terminal tail of histone H2AX in complex with a specific nanobody (C6 gammaXbody) 提交 2020-07-28 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 J
134–143（10 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% PEG 3350, 0.2M Sodium acetate
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.184 |
| 6ZWK Crystal structure of the phosphorylated C-terminal tail of histone H2AX in complex with a specific nanobody (C6 gammaXbody) 提交 2020-07-28 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 K
134–143（10 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% PEG 3350, 0.2M Sodium acetate
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.184 |
| 6ZWK Crystal structure of the phosphorylated C-terminal tail of histone H2AX in complex with a specific nanobody (C6 gammaXbody) 提交 2020-07-28 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 L
134–143（10 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% PEG 3350, 0.2M Sodium acetate
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.184 |
| 9MLL GammaH2AX containing nucleosomes, Parallel stack 提交 2024-12-19 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–143（143 aa）
链 G
1–143（143 aa）
链 N
1–143（143 aa）
链 R
1–143（143 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 9MLN GammaH2AX containing nucleosome, Canonical (Class 1) 提交 2024-12-19 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–143（143 aa）
链 G
1–143（143 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9MLR GammaH2AX containing nucleosome, Half-wrapped (Class 2) 提交 2024-12-19 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–143（143 aa）
链 G
1–143（143 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9MLS GammaH2AX containing nucleosome, Extended (Class 3) 提交 2024-12-19 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–143（143 aa）
链 G
1–143（143 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 9MMK H2AX containing nucleosome, Canonical (Class 1) 提交 2024-12-20 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–143（143 aa）
链 G
1–143（143 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9MMM H2AX containing nucleosomes, Parallel stack 提交 2024-12-20 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–143（143 aa）
链 G
1–143（143 aa）
链 N
1–143（143 aa）
链 R
1–143（143 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 9MMN H2AX containing nucleosomes, Left offset stack 提交 2024-12-20 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–143（143 aa）
链 G
1–143（143 aa）
链 N
1–143（143 aa）
链 R
1–143（143 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 9MMO H2AX containing nucleosomes, Right offset stack 提交 2024-12-20 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–143（143 aa）
链 G
1–143（143 aa）
链 N
1–143（143 aa）
链 R
1–143（143 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 9MMT H2AX containing nucleosome, Unwrapped (Class 2) 提交 2024-12-20 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–143（143 aa）
链 G
1–143（143 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9Q80 Ku70/80 with Ku70 linker and SAP domain bound to a 153 bp H2AX nucleosome 提交 2025-02-21 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric（14） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–143（143 aa）
链 G
1–143（143 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.39 Å |
| 9Q8X Ku70/80 bound to a 153 bp H2AX nucleosome 提交 2025-02-25 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric（14） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–143（143 aa）
链 G
1–143（143 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.94 Å |
| 9Q9F DNA-PK bound to a 153 bp H2AX nucleosome model 1 提交 2025-02-26 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric（13） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–143（143 aa）
链 G
1–143（143 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.54 Å |
| 9QCR DNA-PK bound to 153 bp H2AX nucleosome model 2 提交 2025-03-05 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric（13） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–143（143 aa）
链 G
1–143（143 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.37 Å |
| 9QCS Ku80 mediated DNA-PK dimer bound to 153 bp H2AX nucleosome 提交 2025-03-05 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：26-meric（26） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–143（143 aa）
链 G
1–143（143 aa）
链 c
1–143（143 aa）
链 g
1–143（143 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.38 Å |
| 9QMS DNA-PK bound to 153 bp H2AX nucleosome with ATPyS 提交 2025-03-24 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：30-meric（30） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–143（143 aa）
链 G
1–143（143 aa）
链 c
1–143（143 aa）
链 g
1–143（143 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.00 Å |