当前蛋白身份：P16410
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1AH1 CTLA-4, NMR, 20 STRUCTURES 提交 1997-04-11 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
37–161（125 aa）
片段：EXTRACELLULAR N-TERMINAL IMMUNOGLOBULIN V-LIKE
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；303 K
|
分辨率未提供 |
| 1H6E MU2 ADAPTIN SUBUNIT (AP50) OF AP2 ADAPTOR (SECOND DOMAIN), COMPLEXED WITH CTLA-4 INTERNALIZATION PEPTIDE TTGVYVKMPPT 提交 2001-06-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 P
197–207（11 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；HANGING DROPS CONTAINING A 1:1 MIXTURE OF COMPLEX SOLUTION 6MG/ML PROTEIN AND 1MM 11MER PEPTIDE SOLUTION IN 20MM HEPES PH7.5, 1MM DTT AND RESERVOIR BUFFER 1.4-2.4M SODIUM CHLORIDE, 0.1M MES PH6.2-7.0, 0.4M NA/K PHOSPHATE, 15% GLYCEROL, pH 7.00
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.317 |
| 1I85 CRYSTAL STRUCTURE OF THE CTLA-4/B7-2 COMPLEX 提交 2001-03-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
36–161（126 aa）
片段：EXTRACELLULAR DOMAIN
链 D
36–161（126 aa）
片段：EXTRACELLULAR DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG20K, HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.300 |
| 1I8L HUMAN B7-1/CTLA-4 CO-STIMULATORY COMPLEX 提交 2001-03-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
36–161（126 aa）
片段：EXTRACELLULAR DOMAIN, RESIDUES 36-161
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；298 K；16% PEG 8000, 0.1M CACODYLATE, PH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.257 |
| 1I8L HUMAN B7-1/CTLA-4 CO-STIMULATORY COMPLEX 提交 2001-03-14 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
36–161（126 aa）
片段：EXTRACELLULAR DOMAIN, RESIDUES 36-161
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；298 K；16% PEG 8000, 0.1M CACODYLATE, PH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.257 |
| 2X44 Structure of a strand-swapped dimeric form of CTLA-4 提交 2010-01-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
36–161（126 aa）
片段：RESIDUES 36-161
|
突变：YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；0.02 M MAGNESIUM CHLORIDE, 0.1 M HEPES PH 7.5, 22 % W/V POLYACRYLIC ACID 5100 SODIUM SALT, 0.4 M NDSB-256 (OR 6 % 1,6-DIAMINOHEXANE).
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.245 |
| 3BX7 Engineered Human Lipocalin 2 (LCN2) in Complex with the Extracellular Domain of Human CTLA-4 提交 2008-01-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
38–161（124 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.4；293.15 K；1.4 M Na-malonate, pH 8.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.15K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.226 |
| 3OSK Crystal structure of human CTLA-4 apo homodimer 提交 2010-09-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
36–161（126 aa）
片段：Extracellular domain, UNP residues 36-161
链 B
36–161（126 aa）
片段：Extracellular domain, UNP residues 36-161
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；25% Polyethylene glycol 3350 (w/v), 100mM bis-Tris pH 5.5, 200mM ammonium acetate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.275 |
| 5GGV CTLA-4 in complex with tremelimumab Fab 提交 2016-06-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 Y
36–161（126 aa）
片段：UNP residues 36-161
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M sodium citrate tribasic dihydrate, pH 5.6, 12% PEG4,000, 100 mM NaCl
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.214 |
| 5TRU Structure of the first-in-class checkpoint inhibitor Ipilimumab bound to human CTLA-4 提交 2016-10-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
37–154（118 aa）
片段：UNP residues 37-154
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；291 K；0.1M ammonium sulfate, 0.1M Tris pH 7.5, 20% PEG 1500
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.268 |
| 5TRU Structure of the first-in-class checkpoint inhibitor Ipilimumab bound to human CTLA-4 提交 2016-10-27 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 c
37–154（118 aa）
片段：UNP residues 37-154
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；291 K；0.1M ammonium sulfate, 0.1M Tris pH 7.5, 20% PEG 1500
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.268 |
| 5XJ3 Complex structure of ipilimumab-scFv and CTLA-4 提交 2017-04-29 | Assembly 12 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 L
36–161（126 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 9；291 K；100 mM BICINE, 10% PEG 20000, 2% 1,4-Dioxane, pH 9.0.
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.264 |
| 5XJ3 Complex structure of ipilimumab-scFv and CTLA-4 提交 2017-04-29 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
36–161（126 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 9；291 K；100 mM BICINE, 10% PEG 20000, 2% 1,4-Dioxane, pH 9.0.
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.264 |
| 5XJ3 Complex structure of ipilimumab-scFv and CTLA-4 提交 2017-04-29 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 F
36–161（126 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 9；291 K；100 mM BICINE, 10% PEG 20000, 2% 1,4-Dioxane, pH 9.0.
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.264 |
| 5XJ3 Complex structure of ipilimumab-scFv and CTLA-4 提交 2017-04-29 | Assembly 9 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 I
36–161（126 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 9；291 K；100 mM BICINE, 10% PEG 20000, 2% 1,4-Dioxane, pH 9.0.
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.264 |
| 6RP8 Crystal Structure of Ipilimumab Fab complexed with CTLA-4 at 2.6A resolution 提交 2019-05-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 c
37–154（118 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG4000, pH6
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.267 |
| 6RP8 Crystal Structure of Ipilimumab Fab complexed with CTLA-4 at 2.6A resolution 提交 2019-05-14 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
37–154（118 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG4000, pH6
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.267 |
| 6RPJ A Non-blocking anti-CTLA-4 Nanobody complexed with CTLA-4 提交 2019-05-14 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
37–156（120 aa）
链 G
37–156（120 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG400
|
分辨率 3.25 Å R-free 0.262 |
| 6RPJ A Non-blocking anti-CTLA-4 Nanobody complexed with CTLA-4 提交 2019-05-14 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
37–156（120 aa）
链 E
37–156（120 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG400
|
分辨率 3.25 Å R-free 0.262 |
| 6RQM A blocking anti-CTLA-4 Nanobody (KN044) complexed with CTLA-4 提交 2019-05-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
37–161（125 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG400,
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.313 |
| 6XY2 Crystal structure of CTLA-4 complexed with the Fab of HL32 antibody 提交 2020-01-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
38–160（123 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 6.5；293 K；1M Li2SO4, 1.5M NH4SO4, 0.1M Sodium citrate
|
分辨率 3.05 Å R-free 0.292 |
| 7CIO Molecular interactions of cytoplasmic region of CTLA-4 with SH2 domains of PI3-kinase 提交 2020-07-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
199–206（8 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium acetate trihydrate pH 4.6, 30% PEG 4000
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.179 |
| 7DV4 Crystal structure of anti-CTLA-4 VH domain in complex with human CTLA-4 提交 2021-01-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
36–153（118 aa）
链 G
36–153（118 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；100 mM sodium citrate, 10% (w/v) PEG 6000, pH 5.0
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.258 |
| 7DV4 Crystal structure of anti-CTLA-4 VH domain in complex with human CTLA-4 提交 2021-01-12 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
36–153（118 aa）
链 E
36–153（118 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；100 mM sodium citrate, 10% (w/v) PEG 6000, pH 5.0
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.258 |
| 7ELX The crystal structure of CTLA-4 and Fab 提交 2021-04-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
36–161（126 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；285 K；PEG8000 10%, 0.1M Na Citrate 0.1M (NH4)2SO4
|
分辨率 2.14 Å R-free 0.217 |
| 7ELX The crystal structure of CTLA-4 and Fab 提交 2021-04-12 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 c
36–161（126 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；285 K；PEG8000 10%, 0.1M Na Citrate 0.1M (NH4)2SO4
|
分辨率 2.14 Å R-free 0.217 |
| 7SU0 Crystal structure of an acidic pH-selective Ipilimumab variant Ipi.105 in complex with CTLA-4 提交 2021-11-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
36–153（118 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M ammonium citrate dibasic, 20% w/v PEG 1,000, pH 5.2
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.264 |
| 7SU0 Crystal structure of an acidic pH-selective Ipilimumab variant Ipi.105 in complex with CTLA-4 提交 2021-11-15 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
36–153（118 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 FLC CITRATE ANION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M ammonium citrate dibasic, 20% w/v PEG 1,000, pH 5.2
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.264 |
| 7SU1 Crystal structure of an acidic pH-selective Ipilimumab variant Ipi.106 in complex with CTLA-4 提交 2021-11-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
36–153（118 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M sodium citrate tribasic dehydrate, 22% PEG 3,350
|
分辨率 2.53 Å R-free 0.251 |
| 8GAB Crystal structure of CTLA-4 in complex with a high affinity CTLA-4 binder 提交 2023-02-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
36–161（126 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；292 K；22% (w/v) PEG 3350 and 0.2 M KCl
|
分辨率 2.72 Å R-free 0.292 |
| 8GAB Crystal structure of CTLA-4 in complex with a high affinity CTLA-4 binder 提交 2023-02-22 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
36–161（126 aa）
|
未记录 | K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；292 K；22% (w/v) PEG 3350 and 0.2 M KCl
|
分辨率 2.72 Å R-free 0.292 |
| 8HIT Crystal structure of anti-CTLA-4 humanized IgG1 MAb--JS007 in complex with human CTLA-4 提交 2022-11-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
35–154（120 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；100mM Tris, pH 8.5, 30% w/v PEG 4000
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.298 |
| 9DQ3 Crystal structure of engineered Ipilimumab (mipi.4) Fab in complex with human CTLA-4 提交 2024-09-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
36–153（118 aa）
片段：Extracellular domain of human CTLA-4 with hexahistidine tag
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；300 K；0.18 M calcium acetate hydrate, 22.5% w/v PEG3350
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.268 |