当前蛋白身份:P17315 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2HDF Crystal structure of the Colicin I receptor Cir from E.coli 提交 2006-06-20 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 26–663(638 aa) 片段:Colicin I receptor
突变:W338M, L343M, F589M, V591M 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) SR STRONTIUM ION × 1 OES N-OCTYL-2-HYDROXYETHYL SULFOXIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;294 K;7-8 G/L PROTEIN IN 0.02M TRIS PH7.5, 0.001M EDTA, 0.3M NACL, 1% N-OCTYL-2-HYDROXYETHYL SULFOXIDE MIXED AT 1:1 RATIO WITH 0.1M TRIS PH7.5, 0.02-0.05M SRCL2, 5% ISOPROPANOL, 32-40 % PEG 2000 MME, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 2.65 Å R-free 0.291
2HDI Crystal structure of the Colicin I receptor Cir from E.coli in complex with receptor binding domain of Colicin Ia. 提交 2006-06-20 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 26–663(638 aa) 片段:Colicin I receptor
突变:W338M, L343M, F589M, V591M LDA LAURYL DIMETHYLAMINE-N-OXIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.2;294 K;9 G/L PROTEIN IN 0.02M TRIS PH7.5, 0.2M NACL, 0.05% LDAO, 0.45% C8E4, 3% HEPTANETRIOL MIXED AT 1:1 RATIO WITH 0.1M MES PH6.2, 10% GLYCEROL, 22% PEG 2000 MME, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 2.50 Å R-free 0.249
9NN6 E. coli Cir in Complex with the RBD of Microcin V 提交 2025-03-05 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 32–663(632 aa)
突变:W307M, L312M, F558M, V560M 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;Phosphate Buffered Saline
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blot force +5 Wait time 0 Blot total 1 Blot time 5 seconds
分辨率 2.90 Å