当前蛋白身份：P18010
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2GDC Structure of Vinculin VD1 / IpaA560-633 complex 提交 2006-03-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
564–584（21 aa）
片段：C-terminal fragment (RESIDUES 560-633)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；100 mM HEPES, 10% 2-propanol, 20% PEG 4000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.74 Å R-free 0.294 |
| 2HSQ Human vinculin (head domain, Vh1, residues 1-258) in complex with Shigella's IpaA vinculin binding site 2 (residues 565-587) 提交 2006-07-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
565–587（23 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.97 Å R-free 0.316 |
| 2HSQ Human vinculin (head domain, Vh1, residues 1-258) in complex with Shigella's IpaA vinculin binding site 2 (residues 565-587) 提交 2006-07-22 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric（48） 与蛋白数一致 |
链 B
565–587（23 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.97 Å R-free 0.316 |
| 2HSQ Human vinculin (head domain, Vh1, residues 1-258) in complex with Shigella's IpaA vinculin binding site 2 (residues 565-587) 提交 2006-07-22 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 B
565–587（23 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.97 Å R-free 0.316 |
| 2IBF Human vinculin's head domain (Vh1, residues 1-258) in complex with two vinculin binding sites of Shigella flexneri's IpaA (residues 565-587) 提交 2006-09-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
563–587（25 aa）
片段：Vinculin binding sites: Residues 565-587
链 D
563–587（25 aa）
片段：Vinculin binding sites: Residues 565-587
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.20 Å R-free 0.270 |
| 3RF3 Shigella IpaA-VBS3 in complex with human vinculin 提交 2011-04-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
488–512（25 aa）
片段：unp residues 488-512
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未记录 | CAC CACODYLATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.2；298 K；0.1 M sodium citrate, 20% PEG 3350, 0.1 M cacodylate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.195 |
| 3RF3 Shigella IpaA-VBS3 in complex with human vinculin 提交 2011-04-05 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
488–512（25 aa）
片段：unp residues 488-512
|
未记录 | CAC CACODYLATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.2；298 K；0.1 M sodium citrate, 20% PEG 3350, 0.1 M cacodylate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.195 |
| 3RF3 Shigella IpaA-VBS3 in complex with human vinculin 提交 2011-04-05 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
488–512（25 aa）
片段：unp residues 488-512
链 D
488–512（25 aa）
片段：unp residues 488-512
|
未记录 | CAC CACODYLATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.2；298 K；0.1 M sodium citrate, 20% PEG 3350, 0.1 M cacodylate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.195 |
| 5NL1 Shigella IpaA-VBS3/TBS in complex with the Talin VBS1 domain 488-512 提交 2017-04-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 H
488–512（25 aa）
片段：UNP residues 488-512
链 I
488–512（25 aa）
片段：UNP residues 488-512
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；292 K；0.2 M ammonium sulfate
0.1 M sodium acetate pH 4.6
30 % PEG 4000
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分辨率 2.50 Å R-free 0.228 |
| 5NL1 Shigella IpaA-VBS3/TBS in complex with the Talin VBS1 domain 488-512 提交 2017-04-03 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 J
488–512（25 aa）
片段：UNP residues 488-512
链 L
488–512（25 aa）
片段：UNP residues 488-512
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；292 K；0.2 M ammonium sulfate
0.1 M sodium acetate pH 4.6
30 % PEG 4000
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.228 |
| 5NL1 Shigella IpaA-VBS3/TBS in complex with the Talin VBS1 domain 488-512 提交 2017-04-03 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 G
488–512（25 aa）
片段：UNP residues 488-512
链 K
488–512（25 aa）
片段：UNP residues 488-512
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未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；292 K；0.2 M ammonium sulfate
0.1 M sodium acetate pH 4.6
30 % PEG 4000
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.228 |