当前蛋白身份:P18759 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1CR5 N-TERMINAL DOMAIN OF SEC18P 提交 1999-08-13 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 22–210(189 aa) 片段:N-TERMINAL DOMAIN
未记录 NEN 1-ETHYL-PYRROLIDINE-2,5-DIONE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;277 K;PEG 8000, sodium phosphate, dimethyl sulfoxide, ATP, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 4K
分辨率 2.30 Å R-free 0.277
1CR5 N-TERMINAL DOMAIN OF SEC18P 提交 1999-08-13 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 22–210(189 aa) 片段:N-TERMINAL DOMAIN
未记录 NEN 1-ETHYL-PYRROLIDINE-2,5-DIONE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;277 K;PEG 8000, sodium phosphate, dimethyl sulfoxide, ATP, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 4K
分辨率 2.30 Å R-free 0.277
1CR5 N-TERMINAL DOMAIN OF SEC18P 提交 1999-08-13 Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 C 22–210(189 aa) 片段:N-TERMINAL DOMAIN
未记录 NEN 1-ETHYL-PYRROLIDINE-2,5-DIONE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;277 K;PEG 8000, sodium phosphate, dimethyl sulfoxide, ATP, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 4K
分辨率 2.30 Å R-free 0.277
9CRU Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 1 提交 2024-07-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:undecameric(11) 与蛋白数一致
链 A 1–758(758 aa)
链 B 1–758(758 aa)
链 C 1–758(758 aa)
链 D 1–758(758 aa)
链 E 1–758(758 aa)
链 F 1–758(758 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.89 Å
9CRX Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 3 提交 2024-07-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 1–758(758 aa)
链 B 1–758(758 aa)
链 C 1–758(758 aa)
链 D 1–758(758 aa)
链 E 1–758(758 aa)
链 F 1–758(758 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.73 Å
9N22 Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 2 提交 2025-01-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 1–758(758 aa)
链 B 1–758(758 aa)
链 C 1–758(758 aa)
链 D 1–758(758 aa)
链 E 1–758(758 aa)
链 F 1–758(758 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.91 Å
9NG2 Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 4 提交 2025-02-21 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 1–758(758 aa)
链 B 1–758(758 aa)
链 C 1–758(758 aa)
链 D 1–758(758 aa)
链 E 1–758(758 aa)
链 F 1–758(758 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.61 Å
9NLU Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 5 提交 2025-03-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 1–758(758 aa)
链 B 1–758(758 aa)
链 C 1–758(758 aa)
链 D 1–758(758 aa)
链 E 1–758(758 aa)
链 F 1–758(758 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.29 Å
9NLW Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 6 提交 2025-03-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 1–758(758 aa)
链 B 1–758(758 aa)
链 C 1–758(758 aa)
链 D 1–758(758 aa)
链 E 1–758(758 aa)
链 F 1–758(758 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.73 Å
9NLY Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 7 提交 2025-03-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 1–758(758 aa)
链 B 1–758(758 aa)
链 C 1–758(758 aa)
链 D 1–758(758 aa)
链 E 1–758(758 aa)
链 F 1–758(758 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.75 Å
9NLZ Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 8 提交 2025-03-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 1–758(758 aa)
链 B 1–758(758 aa)
链 C 1–758(758 aa)
链 D 1–758(758 aa)
链 E 1–758(758 aa)
链 F 1–758(758 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.13 Å
9NM1 Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - All Merge (Class 9, focused on D1/D2) 提交 2025-03-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 A 1–758(758 aa)
链 B 1–758(758 aa)
链 C 1–758(758 aa)
链 D 1–758(758 aa)
链 E 1–758(758 aa)
链 F 1–758(758 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9NUD Y20S after Mg2+ (Sec18) - Class 2 提交 2025-03-19 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–758(758 aa)
链 B 1–758(758 aa)
链 C 1–758(758 aa)
链 D 1–758(758 aa)
链 E 1–758(758 aa)
链 F 1–758(758 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.38 Å
9NUE Y20S after Mg2+ (Sec18) - Class 3 提交 2025-03-19 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 A 1–758(758 aa)
链 B 1–758(758 aa)
链 C 1–758(758 aa)
链 D 1–758(758 aa)
链 E 1–758(758 aa)
链 F 1–758(758 aa)
链 G 1–758(758 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.36 Å
9NUZ Y20S after Mg2+ (Sec18) - Class 4 提交 2025-03-20 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 A 1–758(758 aa)
链 B 1–758(758 aa)
链 C 1–758(758 aa)
链 D 1–758(758 aa)
链 E 1–758(758 aa)
链 F 1–758(758 aa)
链 G 1–758(758 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.18 Å
9NV0 Sec18 Mg2+ class 2 提交 2025-03-20 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–758(758 aa)
链 B 1–758(758 aa)
链 C 1–758(758 aa)
链 D 1–758(758 aa)
链 E 1–758(758 aa)
链 F 1–758(758 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.83 Å
9NV1 Sec18 Mg2+ class 1 提交 2025-03-20 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 A 1–758(758 aa)
链 B 1–758(758 aa)
链 C 1–758(758 aa)
链 D 1–758(758 aa)
链 E 1–758(758 aa)
链 F 1–758(758 aa)
链 G 1–758(758 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.99 Å