当前蛋白身份:P18759
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1CR5 N-TERMINAL DOMAIN OF SEC18P 提交 1999-08-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
22–210(189 aa)
片段:N-TERMINAL DOMAIN
|
未记录 | NEN 1-ETHYL-PYRROLIDINE-2,5-DIONE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;277 K;PEG 8000, sodium phosphate, dimethyl sulfoxide, ATP, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 4K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.277 |
| 1CR5 N-TERMINAL DOMAIN OF SEC18P 提交 1999-08-13 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 B
22–210(189 aa)
片段:N-TERMINAL DOMAIN
|
未记录 | NEN 1-ETHYL-PYRROLIDINE-2,5-DIONE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;277 K;PEG 8000, sodium phosphate, dimethyl sulfoxide, ATP, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 4K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.277 |
| 1CR5 N-TERMINAL DOMAIN OF SEC18P 提交 1999-08-13 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 C
22–210(189 aa)
片段:N-TERMINAL DOMAIN
|
未记录 | NEN 1-ETHYL-PYRROLIDINE-2,5-DIONE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;277 K;PEG 8000, sodium phosphate, dimethyl sulfoxide, ATP, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 4K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.277 |
| 9CRU Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 1 提交 2024-07-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:undecameric(11) 与蛋白数一致 |
链 A
1–758(758 aa)
链 B
1–758(758 aa)
链 C
1–758(758 aa)
链 D
1–758(758 aa)
链 E
1–758(758 aa)
链 F
1–758(758 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.89 Å |
| 9CRX Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 3 提交 2024-07-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致 |
链 A
1–758(758 aa)
链 B
1–758(758 aa)
链 C
1–758(758 aa)
链 D
1–758(758 aa)
链 E
1–758(758 aa)
链 F
1–758(758 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.73 Å |
| 9N22 Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 2 提交 2025-01-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致 |
链 A
1–758(758 aa)
链 B
1–758(758 aa)
链 C
1–758(758 aa)
链 D
1–758(758 aa)
链 E
1–758(758 aa)
链 F
1–758(758 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.91 Å |
| 9NG2 Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 4 提交 2025-02-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致 |
链 A
1–758(758 aa)
链 B
1–758(758 aa)
链 C
1–758(758 aa)
链 D
1–758(758 aa)
链 E
1–758(758 aa)
链 F
1–758(758 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.61 Å |
| 9NLU Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 5 提交 2025-03-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致 |
链 A
1–758(758 aa)
链 B
1–758(758 aa)
链 C
1–758(758 aa)
链 D
1–758(758 aa)
链 E
1–758(758 aa)
链 F
1–758(758 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.29 Å |
| 9NLW Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 6 提交 2025-03-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致 |
链 A
1–758(758 aa)
链 B
1–758(758 aa)
链 C
1–758(758 aa)
链 D
1–758(758 aa)
链 E
1–758(758 aa)
链 F
1–758(758 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.73 Å |
| 9NLY Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 7 提交 2025-03-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致 |
链 A
1–758(758 aa)
链 B
1–758(758 aa)
链 C
1–758(758 aa)
链 D
1–758(758 aa)
链 E
1–758(758 aa)
链 F
1–758(758 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.75 Å |
| 9NLZ Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - Class 8 提交 2025-03-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致 |
链 A
1–758(758 aa)
链 B
1–758(758 aa)
链 C
1–758(758 aa)
链 D
1–758(758 aa)
链 E
1–758(758 aa)
链 F
1–758(758 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.13 Å |
| 9NM1 Y20S (Sec18-Sec17-Sec9-Sso1-Snc1) EDTA - All Merge (Class 9, focused on D1/D2) 提交 2025-03-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致 |
链 A
1–758(758 aa)
链 B
1–758(758 aa)
链 C
1–758(758 aa)
链 D
1–758(758 aa)
链 E
1–758(758 aa)
链 F
1–758(758 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9NUD Y20S after Mg2+ (Sec18) - Class 2 提交 2025-03-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 A
1–758(758 aa)
链 B
1–758(758 aa)
链 C
1–758(758 aa)
链 D
1–758(758 aa)
链 E
1–758(758 aa)
链 F
1–758(758 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.38 Å |
| 9NUE Y20S after Mg2+ (Sec18) - Class 3 提交 2025-03-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致 |
链 A
1–758(758 aa)
链 B
1–758(758 aa)
链 C
1–758(758 aa)
链 D
1–758(758 aa)
链 E
1–758(758 aa)
链 F
1–758(758 aa)
链 G
1–758(758 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.36 Å |
| 9NUZ Y20S after Mg2+ (Sec18) - Class 4 提交 2025-03-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致 |
链 A
1–758(758 aa)
链 B
1–758(758 aa)
链 C
1–758(758 aa)
链 D
1–758(758 aa)
链 E
1–758(758 aa)
链 F
1–758(758 aa)
链 G
1–758(758 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.18 Å |
| 9NV0 Sec18 Mg2+ class 2 提交 2025-03-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 A
1–758(758 aa)
链 B
1–758(758 aa)
链 C
1–758(758 aa)
链 D
1–758(758 aa)
链 E
1–758(758 aa)
链 F
1–758(758 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.83 Å |
| 9NV1 Sec18 Mg2+ class 1 提交 2025-03-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致 |
链 A
1–758(758 aa)
链 B
1–758(758 aa)
链 C
1–758(758 aa)
链 D
1–758(758 aa)
链 E
1–758(758 aa)
链 F
1–758(758 aa)
链 G
1–758(758 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.99 Å |