当前蛋白身份:P19838
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1MDI HIGH RESOLUTION SOLUTION NMR STRUCTURE OF MIXED DISULFIDE INTERMEDIATE BETWEEN MUTANT HUMAN THIOREDOXIN AND A 13 RESIDUE PEPTIDE COMPRISING ITS TARGET SITE IN HUMAN NFKB 提交 1995-02-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
53–65(13 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1MDJ HIGH RESOLUTION SOLUTION NMR STRUCTURE OF MIXED DISULFIDE INTERMEDIATE BETWEEN HUMAN THIOREDOXIN (C35A, C62A, C69A, C73A) MUTANT AND A 13 RESIDUE PEPTIDE COMPRISING ITS TARGET SITE IN HUMAN NFKB (RESIDUES 56-68 OF THE P50 SUBUNIT OF NFKB) 提交 1995-02-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
53–65(13 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1MDK HIGH RESOLUTION SOLUTION NMR STRUCTURE OF MIXED DISULFIDE INTERMEDIATE BETWEEN HUMAN THIOREDOXIN (C35A, C62A, C69A, C73A) MUTANT AND A 13 RESIDUE PEPTIDE COMPRISING ITS TARGET SITE IN HUMAN NFKB (RESIDUES 56-68 OF THE P50 SUBUNIT OF NFKB) 提交 1995-02-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
53–65(13 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1NFI I-KAPPA-B-ALPHA/NF-KAPPA-B COMPLEX 提交 1998-08-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 B
248–354(107 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5;pH 5.0
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分辨率 2.70 Å R-free 0.265 |
| 1NFI I-KAPPA-B-ALPHA/NF-KAPPA-B COMPLEX 提交 1998-08-25 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 D
248–354(107 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5;pH 5.0
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.265 |
| 1SVC NFKB P50 HOMODIMER BOUND TO DNA 提交 1995-11-27 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致 |
链 P
2–366(365 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
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分辨率 2.60 Å R-free 0.286 |
| 2DBF Solution structure of the Death domain in human Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit 提交 2005-12-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
806–893(88 aa)
片段:DEATH DOMAIN
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)120mM;压力 AMBIENT
NMR样品组成
1mM protein; 20mM d-tris-HCl(pH7.0); 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 2O61 Crystal Structure of NFkB, IRF7, IRF3 bound to the interferon-b enhancer 提交 2006-12-06 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:tetrameric(4) 与全部聚合物一致 |
链 B
40–352(313 aa)
片段:RHR region
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;294 K;100 mM HEPES, pH 7.0, 15% (w/v) PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.278 |
| 3GUT Crystal structure of a higher-order complex of p50:RelA bound to the HIV-1 LTR 提交 2009-03-30 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:hexameric(6) 与全部聚合物一致 |
链 B
41–352(312 aa)
片段:UNP residues 41-352
链 D
41–352(312 aa)
片段:UNP residues 41-352
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.3;289 K;50mM BTP pH 6.3, 50mM CaCl2, 7% w/v PEG 3000, 1mM Spermine, 10mM DTT, 8% v/v Glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 3.59 Å R-free 0.301 |
| 3GUT Crystal structure of a higher-order complex of p50:RelA bound to the HIV-1 LTR 提交 2009-03-30 | Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:hexameric(6) 与全部聚合物一致 |
链 F
41–352(312 aa)
片段:UNP residues 41-352
链 H
41–352(312 aa)
片段:UNP residues 41-352
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.3;289 K;50mM BTP pH 6.3, 50mM CaCl2, 7% w/v PEG 3000, 1mM Spermine, 10mM DTT, 8% v/v Glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 3.59 Å R-free 0.301 |
| 7LEQ Structure of importin a2 bound to p50 NLS 提交 2021-01-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
355–368(14 aa)
片段:Nuclear localization signal motif, residues 355-368
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;0.6M sodium citrate, 100 Hepes pH 6.0
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分辨率 2.24 Å R-free 0.219 |
| 7LET Structure of importin a2 bound to the p50- and p65-NLSs 提交 2021-01-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 B
355–368(14 aa)
片段:Nuclear localization signal motif, residues 355-368
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;0.6 Na Citrate, 100 mM HEPES pH 6
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.241 |
| 7LF4 Structure of importin a3 bound to the p50- and p65-NLSs 提交 2021-01-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 B
355–368(14 aa)
片段:Nuclear localization signal motif, residues 355-368
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 25% PEG 3350
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.238 |
| 7LF4 Structure of importin a3 bound to the p50- and p65-NLSs 提交 2021-01-15 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 F
355–368(14 aa)
片段:Nuclear localization signal motif, residues 355-368
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 25% PEG 3350
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.238 |
| 7LFC Structure of importin a3 bound to p50 NLS 提交 2021-01-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
355–368(14 aa)
片段:Nuclear localization signal motif, residues 355-368
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;0.2M potassium thiocyanate, 20% PEG3350, 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.220 |
| 7RG4 Importin alpha2 in complex with p50 NLS 提交 2021-07-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
151–190(40 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;296 K;0.7 M sodium citrate, 0.01M DTT, 0.1M sodium HEPES pH 7
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.243 |
| 8TQD NF-Kappa-B1 Bound with a Covalent Inhibitor 提交 2023-08-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
40–245(206 aa)
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未记录 | JMR 1-(2-bromo-4-chlorophenyl)-N-{(3S)-1-[(E)-iminomethyl]pyrrolidin-3-yl}methanesulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;293 K;0.1 M Citrate pH5.0, 20%w/v PEG 6000
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.227 |