当前蛋白身份：P20480
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1CZ7 THE CRYSTAL STRUCTURE OF A MINUS-END DIRECTED MICROTUBULE MOTOR PROTEIN NCD REVEALS VARIABLE DIMER CONFORMATIONS 提交 1999-09-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
295–700（406 aa）
片段：CONSTRUCT MC5 FROM NCD
链 B
295–700（406 aa）
片段：CONSTRUCT MC5 FROM NCD
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；292 K；PEG 4000, NACL, MGCL2, K3PO4, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.294 |
| 1CZ7 THE CRYSTAL STRUCTURE OF A MINUS-END DIRECTED MICROTUBULE MOTOR PROTEIN NCD REVEALS VARIABLE DIMER CONFORMATIONS 提交 1999-09-01 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
295–700（406 aa）
片段：CONSTRUCT MC5 FROM NCD
链 D
295–700（406 aa）
片段：CONSTRUCT MC5 FROM NCD
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；292 K；PEG 4000, NACL, MGCL2, K3PO4, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.294 |
| 1CZ7 THE CRYSTAL STRUCTURE OF A MINUS-END DIRECTED MICROTUBULE MOTOR PROTEIN NCD REVEALS VARIABLE DIMER CONFORMATIONS 提交 1999-09-01 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
295–700（406 aa）
片段：CONSTRUCT MC5 FROM NCD
链 D
295–700（406 aa）
片段：CONSTRUCT MC5 FROM NCD
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；292 K；PEG 4000, NACL, MGCL2, K3PO4, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.294 |
| 1N6M Rotation of the stalk/neck and one head in a new crystal structure of the kinesin motor protein, Ncd 提交 2002-11-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
293–700（408 aa）
片段：NCD
链 B
293–700（408 aa）
片段：NCD
|
突变：N600K 突变：N600K | MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；291 K；PEG 8000, NaCl, Sodium Phosphate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.302 |
| 1N6M Rotation of the stalk/neck and one head in a new crystal structure of the kinesin motor protein, Ncd 提交 2002-11-11 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
293–700（408 aa）
片段：NCD
链 B
293–700（408 aa）
片段：NCD
|
突变：N600K 突变：N600K | MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；291 K；PEG 8000, NaCl, Sodium Phosphate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.302 |
| 2NCD NCD (NON-CLARET DISJUNCTIONAL) DIMER FROM D. MELANOGASTER 提交 1999-06-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
281–700（420 aa）
片段：RESIDUES 281-700
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 8 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；THE MOTHER LIQUOR CONTAINED PROTEIN AT ABOUT 20 MG/ML, 2 MM ADP, 10 MM MGCL2,
100 MM NACL, 700 MM LI2SO4, 1 MM EGTA, AND 1 MM DTT IN 20 MM HEPES, PH 7.5.
THE RESERVOIR WAS 1.4 M LI2SO4, 10 MM MGCL2, 1 MM EGTA, 1 MM DTT IN 20 MM
HEPES, PH 7.5., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.270 |
| 3L1C Kinesin-14 Protein Ncd, T436S Mutant 提交 2009-12-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
293–674（382 aa）
片段：residues 293-674
链 B
293–674（382 aa）
片段：residues 293-674
|
突变：T436S 突变：T436S | MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.75 Å R-free 0.292 |
| 3U06 Crystal structure of the kinesin-14 NcdG347D 提交 2011-09-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
293–700（408 aa）
片段：unp residues 293-700
链 B
293–700（408 aa）
片段：unp residues 293-700
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；288 K；Bis-Tris propane, Na2SO4, PEG3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 288K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.250 |
| 5HLE Structural basis of backwards motion in kinesin-14: minus-end directed nKn664 in the ADP state 提交 2016-01-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
325–348（24 aa）
链 A
664–700（37 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；PEG 3350, Ammonium sulfate, HEPES Benzamidine-HCl, ADP
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.287 |
| 5HNW Structural basis of backwards motion in kinesin-14: minus-end directed nKn664 in the AMPPNP state 提交 2016-01-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 K
325–348（24 aa）
片段：UNP RESIDUES 325-348, 664-700
链 K
664–700（37 aa）
片段：UNP RESIDUES 325-348, 664-700
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.60 Å |
| 5HNX Structural basis of backwards motion in kinesin-14: minus-end directed nKn664 in the nucleotide-free state 提交 2016-01-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 K
325–348（24 aa）
片段：UNP residues 325-348,UNP residues 664-700
链 K
664–700（37 aa）
片段：UNP residues 325-348,UNP residues 664-700
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.60 Å |
| 5HNY Structural basis of backwards motion in kinesin-14: plus-end directed nKn669 in the AMPPNP state 提交 2016-01-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 K
325–348（24 aa）
片段：UNP residues 325-348, UNP residues 664-700
链 K
669–700（32 aa）
片段：UNP residues 325-348, UNP residues 664-700
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.30 Å |
| 5HNZ Structural basis of backwards motion in kinesin-14: plus-end directed nKn669 in the nucleotide-free state 提交 2016-01-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 K
325–348（24 aa）
片段：UNP residues 325-348,UNP residues 664-700
链 K
669–700（32 aa）
片段：UNP residues 325-348,UNP residues 664-700
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.80 Å |
| 5W3D The structure of kinesin-14 wild-type Ncd-ADP dimer 提交 2017-06-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
293–700（408 aa）
链 B
293–700（408 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；291 K；50 mM sodium phosphate, 7 mM dithiothreitol, 10 mM magnesium chloride, 700 mM sodium chloride, 13% PEG8000 (w/v)
|
分辨率 2.79 Å R-free 0.280 |
| 8YUE Crystal structure of the kinesin-14 motor protein from Drosophila melanogaster 提交 2024-03-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
293–680（388 aa）
链 B
293–680（388 aa）
|
突变：Y485K 突变：Y485K | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.5M NaCl, 50mM NaPi, pH6.8, 7mM DTT, 13% PEG 8000
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.295 |
| 8YY2 Kinesin-14 in nucleotide-free state bound to 13 PF Microtubule 提交 2024-04-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
292–700（409 aa）
链 D
292–700（409 aa）
|
突变：E292M, Y485K, N697S 突变：E292M, Y485K, N697S | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；100 mM PIPES pH 6.8, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, and 1 mM GTP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 8YY3 Kinesin-14 in nucleotide-free state bound to 14 PF Microtubule 提交 2024-04-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
292–700（409 aa）
链 D
292–700（409 aa）
|
突变：E292M, Y485K, N697S 突变：E292M, Y485K, N697S | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；100 mM PIPES pH 6.8, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, and 1 mM GTP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.24 Å |
| 8YY4 Kinesin-14 with AlF3 bound to 13 PF Microtubule 提交 2024-04-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
292–700（409 aa）
链 D
292–700（409 aa）
|
突变：E292M, Y485K, N697S 突变：E292M, Y485K, N697S | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；100 mM PIPES pH 6.8, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 1 mM GTP, 2 mM ADP, 2 mM AlCl3, and 8 mM NaF
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.02 Å |
| 8YY5 Kinesin-14 with AlF3 bound to 14 PF Microtubule 提交 2024-04-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
292–700（409 aa）
链 D
292–700（409 aa）
|
突变：E292M, Y485K, N697S 突变：E292M, Y485K, N697S | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.8；100 mM PIPES pH 6.8, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 1 mM GTP, 2 mM ADP, 2 mM AlCl3, and 8 mM NaF
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.99 Å |