当前蛋白身份：P20871
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1CE4 CONFORMATIONAL MODEL FOR THE CONSENSUS V3 LOOP OF THE ENVELOPE PROTEIN GP120 OF HIV-1 提交 1999-03-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
294–328（35 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 2.5；290 K；压力 1
NMR样品组成
10% D2O/70% WATER/20% D3-TRIFLUOROETHANOL
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分辨率未提供 |
| 2ESX The structure of the V3 region within gp120 of JR-FL HIV-1 strain (minimized average structure) 提交 2005-10-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
301–319（19 aa）
片段：V3 of GP120
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5；305 K；离子强度（mmCIF原始值）10mM acetic acid
NMR样品组成
0.4mM V3JR-FL-447-52D complex
U-15N | 5% D2O, 95% H2O
NMR样品组成
0.4mM V3JR-FL-447-52D complex
U-15N-13C | 5% D2O, 95% H2O
NMR样品组成
0.4mM V3JR-FL-447-52D complex
U-15N-13C | 100% D2O
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分辨率未提供 |
| 2ESZ The structure of the V3 region within gp120 of JR-FL HIV-1 strain (ensemble) 提交 2005-10-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
301–319（19 aa）
片段：V3 of GP120
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5；305 K；离子强度（mmCIF原始值）10mM acetic acid
NMR样品组成
0.4mM V3JR-FL-447-52D complex
U-15N | 5% D2O, 95% H2O
NMR样品组成
0.4mM V3JR-FL-447-52D complex
U-15N-13C | 5% D2O, 95% H2O
NMR样品组成
0.4mM V3JR-FL-447-52D complex
U-15N-13C | 100% D2O
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分辨率未提供 |
| 4R2G Crystal Structure of PGT124 Fab bound to HIV-1 JRCSF gp120 core and to CD4 提交 2014-08-11 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
197–300（104 aa）
链 E
317–484（168 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；2.4M ammonium sulphate, 0.1M Tris, 13% glycerol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.28 Å R-free 0.263 |
| 4R2G Crystal Structure of PGT124 Fab bound to HIV-1 JRCSF gp120 core and to CD4 提交 2014-08-11 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 O
197–300（104 aa）
链 O
317–484（168 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；2.4M ammonium sulphate, 0.1M Tris, 13% glycerol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.28 Å R-free 0.263 |
| 4R2G Crystal Structure of PGT124 Fab bound to HIV-1 JRCSF gp120 core and to CD4 提交 2014-08-11 | Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 K
197–300（104 aa）
链 K
317–484（168 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；2.4M ammonium sulphate, 0.1M Tris, 13% glycerol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 3.28 Å R-free 0.263 |
| 4R2G Crystal Structure of PGT124 Fab bound to HIV-1 JRCSF gp120 core and to CD4 提交 2014-08-11 | Assembly 4 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
197–300（104 aa）
链 A
317–484（168 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；2.4M ammonium sulphate, 0.1M Tris, 13% glycerol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.28 Å R-free 0.263 |
| 9MMJ Crystal Structure of 19b Fab bound to the third variable (V3) loop peptide from the HIV-1 JR-FL envelope (Env) glycoprotein 提交 2024-12-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
291–333（43 aa）
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未记录 | ACT ACETATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 2 NA SODIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.18 M Ammonium sulfate, 0.09 M Sodium acetate trihydrate pH 4.6, 27% w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 2,000, 10% v/v Glycerol
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分辨率 1.78 Å R-free 0.199 |